SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因	5764
象征	PTN
同义词	竖琴\| hbgf8 \| hbnf \| negf1
描述	pleiotiotirophin
参考	MIM：162095\|HGNC：HGNC：9630\|Ensembl:ENSG00000105894\|HPRD:01199\|Vega：Otthumg00000155709
基因type	protein-coding
地图位置	7Q33
Pascal P值	1.221E-6
Sherlock P值	0.766
Fetal beta	0.663
DMG	1（＃研究）
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	Potential synaptic genes

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
CV：GWASDB	全基因组关联研究	gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24).	1
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias	点击to show details
go_annotation	Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations	与神经相关的关键字的命中：1
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 1.7318

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

探测	Chromosome	Position	最近的基因	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	学习
cg02701024	7	136989898	PTN	1.21E-5	-0.496	0.014	DMG：Wockner_2014

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	qvalue	EQTL类型
RS17014160	chr1	206855799	PTN	5764	0.16	trans
rs1394545	chr4	136709578	PTN	5764	0.11	trans
RS11730105	chr4	136710424	PTN	5764	0.15	trans
RS11953760	chr5	9842943	PTN	5764	0.1	trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
LGALS8	0.86	0.81
AC079061.1	0.86	0.81
PTPN13	0.85	0.85
DOCK9	0.85	0.88
RNF19A	0.82	0.81
RP11-791G16.2	0.82	0.82
MEF2C	0.81	0.77
ACTN2	0.80	0.77
KLHL4	0.80	0.84
RBM24	0.80	0.82

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
DCXR	-0.52	-0.56
METRN	-0.52	-0.62
增强	-0.52	-0.64
HSD17B14	-0.52	-0.56
REEP6	-0.51	-0.46
AF347015.31	-0.51	-0.54
ACSF2	-0.51	-0.56
MT-CO2	-0.50	-0.54
FXYD1	-0.50	-0.52
TLCD1	-0.49	-0.55

Section III. Gene Ontology annotation

分子功能	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0004864	蛋白质磷酸酶抑制剂活性	塔斯		10706604
去：0008201	heparin binding	IEA		-
去：0008083	生长因子活性	IEA		-
生物过程	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0007399	神经系统的发展	塔斯	neurite (GO term level: 5)	2270483
去：0007185	transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway	塔斯		10706604
去：0008284	细胞增殖的阳性调节	塔斯		2270483
GO:0007612	学习	IEA		-
GO：0030282	骨矿化	IEA		-
细胞分量	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0005576	extracellular region	IEA		-
GO:0005615	细胞外空间	塔斯		10706604
GO:0005783	endoplasmic reticulum	艾达		11256614

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
动作	PS1TP5BP1	actin, beta	-	HPRD	9739080
阿尔	CD246 \|ki-1 \|TFG/ALK	anaplastic lymphoma receptor tyrosine kinase	-	HPRD，Biogrid	11278720
apobec3g	ARP9 \| CEM15 \| FLJ12740 \| MDS019 \| bK150C2.7 \| dJ494G10.1	载脂蛋白B mRNA编辑酶，催化多肽样3G	两个杂交	BioGRID	16169070
Arih2	ARI2 \| FLJ10938 \| FLJ33921 \| TRIAD1	Ariadne同源2（果蝇）	两个杂交	BioGRID	16169070
ARL15	arfrp2 \|FLJ20051	ADP-核糖基化因子样15	两个杂交	BioGRID	16169070
ATP5C1	ATP5C \|ATP5CL1	ATP合酶，H+转运，线粒体F1复合物，γ多肽1	两个杂交	BioGRID	16169070
Atrx	Atr2 \|MGC2094 \|mrxhf1 \|rad54 \|RAD54L \|SFM1 \|shs \|xh2 \|XNP \|Znf-Hx	alpha thalassyia/心理迟缓综合征X连锁（Rad54同源性，S。cerevisiae）	两个杂交	BioGRID	16169070
BCCIP	Tok-1 \|tok1	BRCA2 and CDKN1A interacting protein	两个杂交	BioGRID	16169070
BLOC1S1	blos1 \|FLJ39337 \|FLJ97089 \|GCN5L1 \|MGC87455 \|Micoa \|RT14	biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 1	两个杂交	BioGRID	16169070
BMI1	MGC12685 \|PCGF4 \|RNF51	BMI1polycomb ring finger oncogene	两个杂交	BioGRID	16169070
BTBD2	-	BTB (POZ) domain containing 2	两个杂交	BioGRID	16169070
C8orf30a	FLJ40907	染色体8开放阅读框30a	两个杂交	BioGRID	16169070
C9orf82	FLJ13657 \| RP11-337A23.1	chromosome 9 open reading frame 82	两个杂交	BioGRID	16169070
CACNB4	CAB4 \|cacnlb4 \|EA5 \|EJM	calcium channel, voltage-dependent, beta 4 subunit	两个杂交	BioGRID	16169070
CAPZB	CAPB \|cappb \|CAPZ \|MGC104401 \|MGC129749 \|MGC129750	capping protein (actin filament) muscle Z-line, beta	两个杂交	BioGRID	16169070
CCDC53	CGI-116	包含53	两个杂交	BioGRID	16169070
CDH10	-	cadherin 10, type 2 (T2-cadherin)	两个杂交	BioGRID	16169070
CDK5RAP2	C48 \| Cep215 \| DKFZp686B1070 \| DKFZp686D1070 \| KIAA1633 \| MCPH3	CDK5调节亚基相关蛋白2	两个杂交	BioGRID	16169070
CGA	CG-Alpha \|fsha \|gpha1 \|GPHA \|HCG \|LHA \|TSHA	glycoprotein hormones, alpha polypeptide	两个杂交	BioGRID	16169070
CHD3	Mi-2a \|mi2-alpha \|ZFH	染色体群酶DNA结合蛋白3	两个杂交	BioGRID	16169070
COX6C	-	cytochrome c oxidase subunit VIc	两个杂交	BioGRID	16169070
CRCT1	C1orf42 \| NICE-1	富含半胱氨酸的C末端1	两个杂交	BioGRID	16169070
Creld1	AVSD2 \|Cirrin \|DKFZP566D213	具有EGF样域1的半胱氨酸富含半胱氨酸	两个杂交	BioGRID	16169070
CTNNB1	ctnnb \|DKFZP686D02253 \|FLJ25606 \|FLJ37923	catenin (cadherin-associated protein), beta 1, 88kDa	Affinity Capture-Western	BioGRID	10706604
DFNA5	ICERE-1	耳聋，常染色体显性5	两个杂交	BioGRID	16169070
DNAJB11	ABBP-2 \|abbp2 \|DJ9 \|EDJ \|ERDJ3 \|ERJ3 \|hedj \|Pro1080 \|UNQ537 \|HDJ9	DNAJ（HSP40）同源物，亚家族B，成员11	两个杂交	BioGRID	16169070
DUSP12	dusp1 \|YVH1	双重特异性磷酸酶12	两个杂交	BioGRID	16169070
EIF3F	EIF3S5 \| eIF3-p47	eukaryotic translation initiation factor 3, subunit F	两个杂交	BioGRID	16169070
FAM176A	FLJ13391 \|TMEM166	具有序列相似性的家庭176，成员a	两个杂交	BioGRID	16169070
FTL	MGC71996	ferritin, light polypeptide	两个杂交	BioGRID	16169070
GIPC2	FLJ20075 \|SEMCAP-2 \|SEMCAP2	GIPC PDZ域，包含家族，成员2	两个杂交	BioGRID	16169070
Glyat	Acgnat \|猫\|GAT	glycine-N-acyltransferase	两个杂交	BioGRID	16169070
GNB2L1	GNB2-RS1 \|H12.3 \|HLC-7 \|PIG21 \|机架1	guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2-like 1	两个杂交	BioGRID	16169070
GPD1	FLJ26652	3-磷酸甘油-3-磷酸脱氢酶1（可溶性）	两个杂交	BioGRID	16169070
GSTP1	DFN7 \|faees3 \|GST3 \|pi	glutathione S-transferase pi 1	两个杂交	BioGRID	16169070
GTF2F1	BTF4 \|Rap74 \|TF2F1 \|tfiif	general transcription factor IIF, polypeptide 1, 74kDa	两个杂交	BioGRID	16169070
HSPBAP1	FLJ22623 \|FLJ39386 \|PASS1	HSPB（热休克27KDA）相关蛋白1	两个杂交	BioGRID	16169070
ITSN2	KIAA1256 \|Pro2015 \|SH3D1B \|SH3P18 \|SWA \|交换	intersectin 2	两个杂交	BioGRID	16169070
喇嘛4	DKFZP686D23145 \|喇嘛3 \|LAMA4*-1	层粘连蛋白，α4	两个杂交	BioGRID	16169070
luc7l2	CGI-59 \|CGI-74 \|FLJ10657 \|luc7b2	Luc7样2（S. cerevisiae）	两个杂交	BioGRID	16169070
MAD2L1BP	CMT2 \|KIAA0110 \|MGC11282 \|RP1-261G23.6	MAD2L1结合蛋白	两个杂交	BioGRID	16169070
Mkks	BBS6 \| HMCS \| KMS \| MKS	McKusick-Kaufman综合征	两个杂交	BioGRID	16169070
mllt3	AF9 \|FLJ2035 \|Yeats3	髓样/淋巴样或混合细胞白血病（果蝇Trithorax同源物）；易位到3	两个杂交	BioGRID	16169070
mycbp	amy-1	C-MYC结合蛋白	两个杂交	BioGRID	16169070
NAP1L5	DRLM	nucleosome assembly protein 1-like 5	两个杂交	BioGRID	16169070
NCAN	CSPG3 \|FLJ44681	Neurocan	-	HPRD	9507007
P4HB	DSI \| ERBA2L \| GIT \| PDI \| PDIA1 \| PHDB \| PO4DB \| PO4HB \| PROHB	Procollagen-丙啉，2-氧基谷物4-二氧酶（脯氨酸4-羟化酶），β多肽	两个杂交	BioGRID	16169070
PLXNB2	KIAA0315 \| MM1 \| Nbla00445 \| PLEXB2 \| dJ402G11.3	plexin B2	两个杂交	BioGRID	16169070
PMF1	-	多胺调节因子1	两个杂交	BioGRID	16169070
PPP2CA	pp2ac \|pp2ca \|RP-C	蛋白质磷酸酶2（以前为2A），催化亚基，α同工型	两个杂交	BioGRID	16169070
PSMB10	LMP10 \|mecl1 \|MGC1665 \|beta2i	proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 10	两个杂交	BioGRID	16169070
PSMD11	MGC3844 \|rpn6 \|S9 \|P44.5	蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，11	两个杂交	BioGRID	16169070
PSMD2	MGC14274 \|P97 \|rpn1 \|S2 \|陷阱2	蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，2	两个杂交	BioGRID	16169070
ptprb	DKFZP686E2262 \|DKFZP686H15164 \|FLJ44133 \|hptp-beta \|HPTPB \|MGC142023 \|MGC59935 \|PTPB \|R-PTP-BETA \|VEPTP	protein tyrosine phosphatase, receptor type, B	-	HPRD	10706604
PTPR	ptpsigma	protein tyrosine phosphatase, receptor type, S	两个杂交	BioGRID	16169070
ptprz1	hptpz \|hptpzeta \|PTP-Zeta \|PTP18 \|ptprz \|ptpz \|RPTPB \|rptpbeta \|磷酸	蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，Z多肽1	-	HPRD，Biogrid	10706604
RBM23	Caperbeta \|FLJ10482 \|MGC4458 \|pp239 \|RNPC4	RNA binding motif protein 23	两个杂交	BioGRID	16169070
RIT1	MGC125864 \| MGC125865 \| RIBB \| RIT \| ROC1	像RAS一样无CAAX 1	两个杂交	BioGRID	16169070
RPLP1	FLJ27448 \|MGC5215 \|P1 \|RPP1	核糖体蛋白，大，P1	两个杂交	BioGRID	16169070
SAT1	DC21 \| KFSD \| SAT \| SSAT \| SSAT-1	精子/精子N1-乙酰转移酶1	两个杂交	BioGRID	16169070
SDC1	CD138 \| SDC \| SYND1 \| syndecan	syndecan 1	-	HPRD	7592855
SDC1	CD138 \| SDC \| SYND1 \| syndecan	syndecan 1	Reconstituted Complex	BioGRID	8175719
SDC3	n-syndecan \|SDCN \|Synd3	syndecan 3	-	HPRD	8175719
SGSM2	KIAA0397 \|rutbc1	小G蛋白信号调节器2	两个杂交	BioGRID	16169070
sgta	中士\|Alphastgt \|HSGT	富含谷氨酰胺的小四肽重复（TPR）含α	两个杂交	BioGRID	16169070
SLC25A36	DKFZp564C053 \| FLJ10618	solute carrier family 25, member 36	两个杂交	BioGRID	16169070
SNCAIP	MGC39814 \| SYPH1	突触核蛋白，α相互作用蛋白	两个杂交	BioGRID	16169070
SSR1	DKFZP781N23103 \|FLJ14232 \|FLJ22100 \|FLJ23034 \|FLJ78242 \|FLJ93042 \|Trapa	信号序列受体，α	两个杂交	BioGRID	16169070
STC2	STC-2 \| STCRP	Stanniocalcin 2	两个杂交	BioGRID	16169070
supt7l	ART1 \| KIAA0764 \| MGC90306 \| SPT7L \| STAF65 \| STAF65(gamma)	suppressor of Ty 7 (S. cerevisiae)-like	两个杂交	BioGRID	16169070
TAC3	NKB \| NKNB \| PRO1155 \| ZNEUROK1	tachykinin 3	两个杂交	BioGRID	16169070
taf1d	josd3 \|MGC5306 \|taf（i）41	TATA box binding protein (TBP)-associated factor, RNA polymerase I, D, 41kDa	两个杂交	BioGRID	16169070
TBRG4	CPR2 \|fastkd4 \|KIAA0948	转换生长因子β调节剂4	两个杂交	BioGRID	16169070
Tomm20	KIAA0016 \|MAS20 \|MGC117367 \|MOM19 \|TOM20	translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast)	两个杂交	BioGRID	16169070
TP53BP2	53BP2 \| ASPP2 \| BBP \| PPP1R13A \| p53BP2	肿瘤蛋白p53结合蛋白，2	两个杂交	BioGRID	16169070
TXNDC9	apacd	硫氧还蛋白domain containing 9	两个杂交	BioGRID	16169070
UBQLN4	A1U \| C1orf6 \| CIP75 \| UBIN	泛素4	两个杂交	BioGRID	16169070
UTP3	CRL1 \| CRLZ1 \| FLJ23256 \| SAS10	UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae)	两个杂交	BioGRID	16169070
WFDC2	he4 \|MGC57529 \|Wap5 \|DJ461P17.6	WAP四硫化物核心域2	两个杂交	BioGRID	16169070

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
piD SYNDECAN 3 PATHWAY	17	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN	182	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN	198	110	该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN	69	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
胡椒慢性淋巴细胞性白血病	33	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN	291	176	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN	232	154	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向E	97	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK	214	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK	271	175	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN	62	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应	123	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PATTERSON DOCETAXEL RESISTANCE	29	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP	73	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN	36	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对电离辐射的响应	149	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺	69	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
钙虹膜虹膜素敏感与抗性	5	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
小腿虹膜敏感敏感与恢复的DN	5	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN	848	527	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH靶向DN	64	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时	487	286	该途径中的所有SZGR 2.0基因
他靶向DN	7	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标	988	594	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS	734	436	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN	357	212	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn	1237	837	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS UP	37	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP	203	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移DN	61	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall通过Tert Up永生	78	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP	428	266	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D	210	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN	191	123	该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN	564	326	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔	84	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常	476	285	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头	126	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向6小时	10	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时	223	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生DN	51	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记	165	118	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN	138	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向	395	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN	134	83	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN IPS ICP WITH H3K4ME3 AND H327ME3	126	83	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发	166	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块	721	492	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS DN	306	191	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3	137	85	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3	445	257	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT	572	352	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清	100	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS GROWING	243	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合	567	365	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 1 DN	63	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE	1137	655	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN	882	538	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化	570	339	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向	163	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向	364	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL DN	308	187	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上	297	194	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS	344	197	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关	753	411	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵	1028	559	该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			mirna id	miRNA seq
mirna家族	UTR start	UTR end	匹配方法	mirna id	miRNA seq
mir-137	419	425	1a	hsa-miR-137	UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir-384	644	651	1a,m8	hsa-miR-384	auuccuagaaauuguucaua
mir-496	338	344	1a	hsa-miR-496	Auuacauggccaaucuc

SZ: miRNAs which differentially expressed in brain cortex of schizophrenia patients comparing with control samples using microarray. Click这里查看与SZ相关的miRNA列表。
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击这里to see the list of brain related miRNAs.

基因页：PTN