基因页面:COL20A1
总结吗?
GeneID | 57642年 |
象征 | COL20A1 |
同义词 | bA261N11.4 |
描述 | 胶原蛋白类型XXα1 |
参考 | HGNC: HGNC: 14670|运用:ENSG00000101203|HPRD: 17215|织女:OTTHUMG00000032964 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 20 q13.33 |
帕斯卡假定值 | 0.005 |
夏洛克假定值 | 0.214 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs11930252 | chr4 | 173760645 | COL20A1 | 57642年 | 0.17 | 反式 | ||
rs17836777 | chr14 | 67948747 | COL20A1 | 57642年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/COL20A1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
DARWICHE皮肤肿瘤促进剂DN | 185年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DARWICHE乳头状瘤风险低 | 162年 | 104年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DARWICHE乳头状瘤风险高的DN | 180年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DARWICHE鳞状细胞癌DN | 181年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DARWICHE乳头状瘤进展风险 | 74年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DARWICHE乳头状瘤风险高和低的DN | 32 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NIKOLSKY乳腺癌20 q12问题扩增子 | 149年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
科茨巨噬细胞M1和M2 DN | 78年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CERIBELLI推动者不活跃和受NFY的约束 | 44 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA胶原蛋白 | 44 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA核心MATRISOME | 275年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |