基因页面:HCN3
总结吗?
| GeneID | 57657年 |
| 象征 | HCN3 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 超极化激活钾离子通道环核苷酸的3 |
| 参考 | MIM: 609973|HGNC: HGNC: 19183|运用:ENSG00000143630|HPRD: 17093|织女:OTTHUMG00000035872 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1的时候 |
| 夏洛克假定值 | 0.305 |
| 胎儿β | 0.915 |
| eGene | 小脑 皮质 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | Psr: 0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6753473 | chr2 | 26526418 | HCN3 | 57657年 | 0 | 反式 | ||
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | HCN3 | 57657年 | 4.024的军医 | 反式 | ||
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | HCN3 | 57657年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs17762315 | chr5 | 76807576 | HCN3 | 57657年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs7729096 | chr5 | 76835927 | HCN3 | 57657年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs4836429 | chr5 | 128339224 | HCN3 | 57657年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs1368303 | chr5 | 147672388 | HCN3 | 57657年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs9296185 | chr6 | 36530602 | HCN3 | 57657年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs10119203 | chr9 | 124813077 | HCN3 | 57657年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs17124813 | chr10 | 110347464 | HCN3 | 57657年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | HCN3 | 57657年 | 3.839 e-9 | 反式 | ||
| rs11873184 | chr18 | 1584081 | HCN3 | 57657年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005244 | 电压门控离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005249 | 电压门控钾离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005272 | 钠离子通道的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030552 | 营绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030955 | 钾离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0031402 | 钠离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006814 | 钠离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006811 | 离子传输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006813 | 钾离子运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME神经系统 | 279年 | 221年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME钾离子通道 | 98年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 1 NIKOLSKY乳腺癌扩增子对方篮里 | 38 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY突变在乳腺癌和放大 | 94年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 丰田MIR34B和MIR34C的目标 | 463年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 218 | 370年 | 377年 | 1、m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-34/449 | 395年 | 402年 | 1、m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
| hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
| hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
| hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||