基因页：tnrc6c

概括？
基因 57690
象征 tnrc6c
同义词 -
描述 含6C的三核苷酸重复
参考 MIM：610741|HGNC：HGNC：29318|Ensembl：ENSG0000000078687|HPRD：10026|Vega：Otthumg00000132642
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q25.3
Pascal P值 0.242
DEG P值 DEG：ZHAO_2015：P = 2.16E-04：Q = 0.0860
胎儿β 0.761
DMG 1（＃研究）
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
tnrc6c CHR17 76083048 C G NM_001142640
NM_018996		 p.1223l> v
p.1226l> v		 错过
错过		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG00175441 17 76100646 tnrc6c 1.94E-7 0.654 0.005 DMG：Wockner_2014
CG05736847 17 76100510 tnrc6c 1.31E-6 0.656 0.007 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Reactome PreNCH的转录和翻译 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pre Notch表达和处理 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组调节RNA途径 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 DN永生 65 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因