基因页面:ANO8
总结吗?
GeneID | 57719年 |
象征 | ANO8 |
同义词 | KIAA1623 | TMEM16H |
描述 | anoctamin 8 |
参考 | MIM: 610216|HGNC: HGNC: 29329|运用:ENSG00000074855|HPRD: 17223|织女:OTTHUMG00000182665 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13.11 |
帕斯卡假定值 | 0.885 |
夏洛克假定值 | 0.465 |
胎儿β | 0.4 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg11446345 | 19 | 17445677 | ANO8 | 3.52 e-9 | -0.012 | 2.29 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs3773648 | chr3 | 30716287 | ANO8 | 57719年 | 0.2 | 反式 | ||
rs2277184 | chr9 | 98239146 | ANO8 | 57719年 | 0.18 | 反式 | ||
rs2068673 | chr12 | 60333402 | ANO8 | 57719年 | 0.02 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ANO8_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BCAR1 | 0.84 | 0.86 |
C9orf75 | 0.82 | 0.82 |
FLYWCH1 | 0.81 | 0.83 |
ZNF444 | 0.81 | 0.83 |
MAP1S | 0.81 | 0.83 |
POLRMT | 0.81 | 0.82 |
EXOSC6 | 0.80 | 0.83 |
RNH1 | 0.80 | 0.79 |
KLHL26 | 0.79 | 0.81 |
KIAA2013 | 0.79 | 0.80 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.57 | -0.54 |
SYCP3 | -0.55 | -0.58 |
C1orf54 | -0.52 | -0.50 |
GNG11 | -0.52 | -0.51 |
AL050337.1 | -0.51 | -0.54 |
敝中断 | -0.51 | -0.50 |
AF347015.31 | -0.51 | -0.47 |
SAT1 | -0.50 | -0.50 |
CLEC2B | -0.49 | -0.48 |
AP002478.3 | -0.49 | -0.49 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH号目标 | 179年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |