基因页：PTPN7
概括？
| 基因 | 5778 |
| 象征 | PTPN7 |
| 同义词 | BPTP-4 | HEPTP | LC-PTP | LPTP | PTPNI |
| 描述 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体7型 |
| 参考 | MIM：176889|HGNC：HGNC：9659|ENSEMBL：ENSG00000143851|HPRD：01480|Vega：Otthumg0000000035931 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32.1 |
| 胎儿β | -0.326 |
| 主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS16869851 | CHR4 | 20690056 | PTPN7 | 5778 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC006116.3 | 0.90 | 0.91 |
| KPNA4 | 0.90 | 0.90 |
| CYB5R4 | 0.90 | 0.90 |
| HSPA14 | 0.89 | 0.89 |
| IPO5 | 0.89 | 0.89 |
| VPS37A | 0.89 | 0.88 |
| FAF1 | 0.89 | 0.87 |
| MRPS27 | 0.88 | 0.89 |
| arl2bp | 0.88 | 0.88 |
| AC087742.2 | 0.88 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.8 | -0.78 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.77 | -0.79 |
| MT-CO2 | -0.77 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.76 | -0.79 |
| AF347015.26 | -0.76 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.77 |
| AF347015.2 | -0.75 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.77 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.71 | -0.76 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta TCR途径 | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR RAS途径 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hemin的addya红斑分化 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| faelt b cll与VH3 21 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hofmann骨髓增生综合征低风险 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan V1晚分化基因DN | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |