基因页:rbak
概括?
基因 | 57786 |
象征 | rbak |
同义词 | ZNF769 |
描述 | RB相关的Krab锌指 |
参考 | MIM:608191|HGNC:HGNC:17680|ENSEMBL:ENSG00000146587|HPRD:16296| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p22.1 |
Pascal P值 | 0.019 |
胎儿β | 0.676 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02646611 | 7 | 5084794 | rbak | 3.295E-4 | 0.266 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RBAK_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
plekhb1 | 0.77 | 0.82 |
MBP | 0.77 | 0.82 |
kif1c | 0.77 | 0.81 |
daam2 | 0.77 | 0.79 |
EFHD1 | 0.76 | 0.83 |
hepn1 | 0.75 | 0.79 |
BCAS1 | 0.75 | 0.82 |
ptrf | 0.75 | 0.68 |
AL358113.1 | 0.75 | 0.80 |
TFEB | 0.74 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ppp3cc | -0.71 | -0.77 |
PARP6 | -0.71 | -0.77 |
STMN2 | -0.68 | -0.78 |
TRO | -0.67 | -0.73 |
tubb2a | -0.67 | -0.73 |
Gprin1 | -0.67 | -0.75 |
TMEM63B | -0.67 | -0.71 |
SRD5A1 | -0.67 | -0.75 |
RNF19B | -0.67 | -0.73 |
PODXL2 | -0.67 | -0.73 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 | 54 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |