概括
基因 57786
象征 rbak
同义词 ZNF769
描述 RB相关的Krab锌指
参考 MIM:608191|HGNC:HGNC:17680|ENSEMBL:ENSG00000146587|HPRD:16296|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22.1
Pascal P值 0.019
胎儿β 0.676
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02646611 7 5084794 rbak 3.295E-4 0.266 0.041 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
plekhb1 0.77 0.82
MBP 0.77 0.82
kif1c 0.77 0.81
daam2 0.77 0.79
EFHD1 0.76 0.83
hepn1 0.75 0.79
BCAS1 0.75 0.82
ptrf 0.75 0.68
AL358113.1 0.75 0.80
TFEB 0.74 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ppp3cc -0.71 -0.77
PARP6 -0.71 -0.77
STMN2 -0.68 -0.78
TRO -0.67 -0.73
tubb2a -0.67 -0.73
Gprin1 -0.67 -0.75
TMEM63B -0.67 -0.71
SRD5A1 -0.67 -0.75
RNF19B -0.67 -0.73
PODXL2 -0.67 -0.73

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化DN调节的玛丽亚达森 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因