基因页：LSM2
Summary？
| GeneID | 57819 |
| 象征 | LSM2 |
| 同义词 | c6orf28 | g7b | ybl026w | snrnp |
| 描述 | LSM2同源物，U6小核RNA和mRNA降解相关 |
| 参考 | MIM：607282|HGNC：HGNC：13940|Ensembl：ENSG00000204392|HPRD：06282|Vega：Otthumg00000031121 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 1E-12 |
| Sherlock P值 | 0.084 |
| 胎儿β | 0.574 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.1805 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04331511 | 6 | 31775519 | LSM2 | 2.05E-5 | 0.228 | 0.016 | DMG：Wockner_2014 |
| CG01937314 | 6 | 31774612 | LSM2 | 1.535E-4 | -0.241 | 0.032 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
| GO：0017070 | U6 snRNA结合 | nas | 10523320 | |
| GO：0019901 | 蛋白激酶结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | EXP | 12226669 | |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | nas | - | |
| 去：0008380 | RNA剪接 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | nas | - | |
| 去：0005681 | 剪接体 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| C14orf1 | ERG28 |Net51 | 染色体14开放阅读框1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| CRMP1 | dpysl1 |DRP-1 |DRP1 | 折叠蛋白反应介质蛋白1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| DDX20 | DKFZP434H052 |DP103 |双子座3 | 死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽20 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10601333 |
| GBP2 | - | guanylate binding protein 2, interferon-inducible | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| LSM1 | CASM |YJL124C | LSM1同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408|15231747 |
| LSM3 | smx4 |USS2 |YLR438C | LSM3同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408|15231747 |
| LSM3 | smx4 |USS2 |YLR438C | LSM3同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | Two-hybrid | Biogrid | 14667819|15231747 |16169070|16189514 |
| LSM4 | yer112w | LSM4同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408 |
| LSM5 | FLJ12710 |yer146w | LSM5同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM6 | YDR378C | LSM6同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM7 | YNL147W | LSM7同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | Two-hybrid | Biogrid | 14667819|15231747 |
| LSM7 | YNL147W | LSM7同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408|15231747 |
| LSM8 | YJR022W | LSM8同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408|15231747 |
| LSM8 | YJR022W | LSM8同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | Two-hybrid | Biogrid | 14667819|15231747 |
| RSRC1 | BM-011 | MGC12197 | 精氨酸/丝氨酸富含螺旋螺旋1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1，端粒的生存 | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| ZBTB16 | PLZF |ZNF145 | 锌指和包含16的BTB结构域 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| ZNF408 | FLJ12827 | 锌指蛋白408 | - | HPRD | 14667819 |