基因页：ptprf
概括？
| 基因 | 5792 |
| 象征 | ptprf |
| 同义词 | bnah2 | lar |
| 描述 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型F |
| 参考 | MIM：179590|HGNC：HGNC：9670|ENSEMBL：ENSG00000142949|HPRD：01552|Vega：Otthumg00000007501 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 134 |
| Pascal P值 | 1.719E-6 |
| Sherlock P值 | 0.606 |
| 胎儿β | -0.349 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历：PGC128
简历：PGC128| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11210892 | CHR1 | 44100084 | Ag | 4.97E-10 | 基因间 | PTPRF，KDM4A | dist = 10741; dist = 15713 |
DNM表
| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ptprf | CHR1 | 44085065 | t | C | NM_002840 NM_130440 |
p.1585s> p p.1576s> p |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG24841511 | 1 | 44069648 | ptprf | 6.24e-5 | 0.957 | 0.023 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PPT1 | 0.90 | 0.90 |
| ATG7 | 0.87 | 0.91 |
| TMX2 | 0.86 | 0.89 |
| TMEM111 | 0.86 | 0.84 |
| ATP6V1E1 | 0.85 | 0.85 |
| higd1a | 0.84 | 0.81 |
| MAT2B | 0.84 | 0.88 |
| PGK1 | 0.84 | 0.83 |
| Selt | 0.83 | 0.83 |
| anxa7 | 0.83 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC005921.3 | -0.48 | -0.60 |
| ZNF814 | -0.45 | -0.52 |
| AC010300.1 | -0.44 | -0.52 |
| IL3RA | -0.43 | -0.59 |
| C21orf32 | -0.42 | -0.50 |
| SH3BP2 | -0.42 | -0.50 |
| EIF5B | -0.41 | -0.44 |
| ankrd36 | -0.41 | -0.52 |
| DMPK | -0.41 | -0.42 |
| SH2D2A | -0.40 | -0.45 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BCAR1 | cas |cas1 |Cass1 |crkas |P130CAS | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD | 10822386 |
| CAV1 | cav |MSTP085 |VIP21 | 小窝蛋白1，小窝蛋白，22KDA | - | HPRD，Biogrid | 12176037 |
| CAV1 | cav |MSTP085 |VIP21 | 小窝蛋白1，小窝蛋白，22KDA | Caveolin-1与LAR相互作用。 | 绑定 | 12176037 |
| CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1，1型，e-钙粘蛋白（上皮） | - | HPRD | 12095414 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9245795|11245482 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | - | HPRD | 9245795|12095414 |
| FRS2 | FRS2A |frs2alpha |SNT |SNT-1 |SNT1 | 成纤维细胞生长因子受体底物2 | - | HPRD | 10822386 |
| git1 | - | G蛋白偶联受体激酶相互作用ARFGAP 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12629171 |
| insr | CD220 |HHF5 | 胰岛素受体 | - | HPRD，Biogrid | 1321126 |
| IRS1 | hirs-1 | 胰岛素受体底物1 | - | HPRD | 10660596 |
| JUP | ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB | 交界处Plakoglobin | - | HPRD，Biogrid | 9245795 |
| NID1 | nid | nidogen 1 | - | HPRD，Biogrid | 9647658 |
| PPFIA1 | FLJ41337 |FLJ42630 |FLJ43474 |嘴唇1 |lip1 |Liprin |MGC26800 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，受体类型，F多肽（PTPRF），相互作用蛋白（Liprin），α1 | - | HPRD | 8524829|9624153 |
| PPFIA1 | FLJ41337 |FLJ42630 |FLJ43474 |嘴唇1 |lip1 |Liprin |MGC26800 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，受体类型，F多肽（PTPRF），相互作用蛋白（Liprin），α1 | - | HPRD，Biogrid | 7796809|8524829 |9624153 | 8524829|9624153 |
| PPFIA2 | FLJ41378 |MGC132572 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，F多肽（PTPRF），相互作用蛋白（Liprin），α2 | - | HPRD，Biogrid | 9624153 |
| PPFIA3 | KIAA0654 |lpna3 |MGC126567 |MGC126569 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，F多肽（PTPRF），相互作用蛋白（Liprin），α3 | - | HPRD，Biogrid | 9624153 |
| ptpra | HEPTP |HLPR |hptpa |hptpalpha |LRP |PTPA |ptprl2 |R-PTP-Alpha |RPTPA | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体类型，A | - | HPRD | 10777529 |
| ret | CDHF12 |HSCR1 |men2a |men2b |mtc1 |PTC |ret-ele1 |RET51 | ret原癌基因 | - | HPRD，Biogrid | 11121408 |
| 三人组 | FLJ42780 |TGAT | 三重功能域（PTPRF相互作用） | - | HPRD，Biogrid | 8643598 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nagashima NRG1信号传导DN | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 | 128 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bystrykh造血细胞和脑QTL顺式 | 65 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Traynor Rett综合征DN | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 村上紫外线响应6小时 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过nova2拼接 | 43 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tseng irs1靶向 | 113 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tseng成脂潜力 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和替代剪接 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ruiz TNC靶向DN | 142 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferrando Hox11邻居 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹上皮类间皮瘤 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 村上紫外线响应1小时 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对Forskolin DN的反应 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1的Juban目标 | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |