概括
基因 5796
象征 ptprk
同义词 R-PTP-KAPPA
描述 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体型K型
参考 MIM:602545|HGNC:HGNC:9674|ENSEMBL:ENSG00000152894|HPRD:03968|Vega:Otthumg0000000015536
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q22.2-Q22.3
Pascal P值 0.325
Sherlock P值 0.27
胎儿β -0.085
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25328795 6 128841761 ptprk 2.34e-9 -0.007 1.77E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CGRRF1 0.92 0.82
C18orf32 0.83 0.68
PPA2 0.83 0.71
GSTO1 0.83 0.74
MRPS15 0.82 0.74
TMEM126B 0.81 0.75
TMEM14C 0.81 0.69
LPAR6 0.81 0.76
MDP1 0.81 0.63
CMC1 0.80 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tnks1bp1 -0.56 -0.57
myo18a -0.56 -0.51
TCOF1 -0.54 -0.54
CEP250 -0.54 -0.56
SUPT6H -0.54 -0.51
SAFB2 -0.54 -0.53
ZC3H13 -0.54 -0.52
cdc2l2 -0.53 -0.51
ankrd11 -0.53 -0.50
BAT2D1 -0.53 -0.49

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
pid nfat tfpathway 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Okumura炎症反应LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬抵抗DN 52 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移 79 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5靶向 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或UV 63 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 88 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAT3的Azare肿瘤转化 121 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因