基因页：ptprm

概括？
基因 5797
象征 ptprm
同义词 ptprl1 | r-ptp-mu | rptpm | rptpu | hr-ptpu
描述 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型M型
参考 MIM：176888|HGNC：HGNC：9675|ENSEMBL：ENSG00000173482|HPRD：01479|Vega：Otthumg00000131575
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18p11.2
Pascal P值 0.007
Sherlock P值 0.349
胎儿β -0.453
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
ptprm CHR18 8379193 G 一个 NM_001105244
NM_002845		 p.1214r> q
p.1201r> q		 错过
错过		 精神分裂症 DNM：XU_2012

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG11814464 18 7567548 ptprm 1.122E-4 -0.286 0.029 DMG：Wockner_2014
CG13026370 18 8367098 LOC100192426; PTPRM 4.256E-4 0.469 0.045 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C19orf54 0.86 0.79
AL161668.2 0.85 0.82
Raver1 0.83 0.71
sepn1 0.83 0.77
EPHB4 0.82 0.82
LRP5 0.82 0.78
Gys1 0.82 0.77
llgl1 0.81 0.75
PAK4 0.80 0.77
H6PD 0.80 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.53 -0.57
Rergl -0.50 -0.62
ACOT13 -0.50 -0.54
KMO -0.49 -0.57
serpini1 -0.49 -0.54
NDUFV2 -0.48 -0.58
NDUFB3 -0.48 -0.55
ephx4 -0.48 -0.55
Sergef -0.47 -0.52
Mael -0.47 -0.55

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg粘附交界处 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID nectin途径 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向 306 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM上升 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与CBFB MYH11融合 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 DN 43 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木对TSA和Decitabine 1A的反应 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线低剂量DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Cerebellum标记 85 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee转移和替代剪接 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集9 35 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因