基因页：PTPRN2
概括？
| 基因 | 5799 |
| 象征 | PTPRN2 |
| 同义词 | ia-2beta | iar | icaar | ptprp | r-ptp-n2 |
| 描述 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，N2型受体 |
| 参考 | MIM：601698|HGNC：HGNC：9677|Ensembl：ENSG00000155093|HPRD：03413|Vega：Otthumg00000152646 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7Q36 |
| Sherlock P值 | 0.051 |
| 胎儿β | -0.914 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
| 支持 | 酪氨酸激酶信号传导 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 12 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 12 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG23220435 | 7 | 158107284 | PTPRN2 | 3.18e-6 | 0.415 | 0.009 | DMG：Wockner_2014 |
| CG08401938 | 7 | 158155932 | PTPRN2 | 8.85e-6 | 0.324 | 0.013 | DMG：Wockner_2014 |
| CG26389638 | 7 | 158264915 | PTPRN2 | 2.076E-4 | 0.374 | 0.035 | DMG：Wockner_2014 |
| CG09066883 | 7 | 157932951 | PTPRN2 | 2.289E-4 | 0.373 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
| CG07213780 | 7 | 158342600 | PTPRN2 | 2.382E-4 | 0.46 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
| CG09450352 | 7 | 157495481 | PTPRN2 | 2.612E-4 | 0.526 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
| CG22881266 | 7 | 157543942 | PTPRN2 | 3.257E-4 | 0.326 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
| CG26173773 | 7 | 158075624 | PTPRN2 | 3.337E-4 | 0.425 | 0.041 | DMG：Wockner_2014 |
| CG27448110 | 7 | 157484647 | PTPRN2 | 3.63e-4 | -0.41 | 0.042 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18951543 | 7 | 157633867 | PTPRN2 | 3.95E-4 | -0.478 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
| CG13632655 | 7 | 158266097 | PTPRN2 | 4.51E-4 | 0.406 | 0.045 | DMG：Wockner_2014 |
| CG25607226 | 7 | 157369960 | PTPRN2 | 7.6e-8 | 0.019 | 1.8e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NT5DC2 | 0.93 | 0.88 |
| PPP4C | 0.92 | 0.93 |
| SLC25A1 | 0.92 | 0.87 |
| SPNS1 | 0.91 | 0.90 |
| TSEN34 | 0.91 | 0.92 |
| WDR34 | 0.91 | 0.92 |
| DHRS13 | 0.91 | 0.91 |
| GPX7 | 0.90 | 0.85 |
| GNB2 | 0.90 | 0.92 |
| TARBP2 | 0.90 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.66 | -0.71 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.79 |
| HLA-F | -0.64 | -0.67 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.78 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.74 |
| MT-CO2 | -0.63 | -0.75 |
| AF347015.8 | -0.62 | -0.78 |
| tinagl1 | -0.61 | -0.65 |
| mt-cyb | -0.60 | -0.76 |
| CA4 | -0.60 | -0.67 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG I型糖尿病 | 44 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chow RASSF1目标DN | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Prkca和ETS1 DN的审查目标 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏4NQO或UV | 63 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ehlers neuploidy up | 41 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tavazoie转移 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蒙特罗甲状腺癌的生存率差DN | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |