基因页：PTPRO
概括？
| 基因 | 5800 |
| 象征 | PTPRO |
| 同义词 | glepp1 | nphs6 | ptp-oc | ptp-u2 | ptprot | ptpu2 | r-ptp-o |
| 描述 | 蛋白酪氨酸磷酸酶，受体型O型 |
| 参考 | MIM：600579|HGNC：HGNC：9678|ENSEMBL：ENSG00000151490|HPRD：02784|Vega：Otthumg00000168786 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12P13.3-P13.2 | 12P13-P12 |
| Pascal P值 | 0.011 |
| 胎儿β | 1.838 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3783076 | CHR13 | 25064456 | PTPRO | 5800 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| XPO5 | 0.95 | 0.95 |
| SF3B3 | 0.95 | 0.96 |
| DHX9 | 0.95 | 0.96 |
| poldip3 | 0.95 | 0.95 |
| KHDRBS1 | 0.95 | 0.95 |
| NUP160 | 0.95 | 0.93 |
| Smad4 | 0.95 | 0.94 |
| 加特 | 0.95 | 0.94 |
| PDCL | 0.95 | 0.93 |
| ZC4H2 | 0.95 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.88 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.89 |
| C5orf53 | -0.73 | -0.77 |
| AF347015.27 | -0.72 | -0.86 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.72 | -0.86 |
| HLA-F | -0.71 | -0.78 |
| ifi27 | -0.71 | -0.87 |
| S100B | -0.70 | -0.81 |
| mt-cyb | -0.70 | -0.85 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID套件途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘乳腺癌 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿比·lif信号2向上 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟 | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李小脑老化 | 84 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein ESR1目标 | 85 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ikeda mir133靶向 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |