基因页面:PTPRZ1
总结吗?
| GeneID | 5803年 |
| 象征 | PTPRZ1 |
| 同义词 | HPTPZ | HPTPzeta | PTP-ZETA | PTP18 | PTPRZ | PTPZ | R-PTP-zeta-2 | RPTPB | RPTPbeta | phosphacan |
| 描述 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体Z1型 |
| 参考 | MIM: 176891|HGNC: HGNC: 9685|运用:ENSG00000106278|HPRD: 01481|织女:OTTHUMG00000157057 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q31.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.261 |
| 夏洛克假定值 | 0.688 |
| 胎儿β | 1.666 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 3 | 链接到SZGene |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005001 | 跨膜受体蛋白酪氨酸磷酸酶活性 | 助教 | 1323835 | |
| 去:0004089 | 碳酸脱水酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016787 | 水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0008330 | 蛋白质酪氨酸/苏氨酸磷酸酶活性 | NAS | 9653645 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007417 | 中枢神经系统开发 | 助教 | 大脑(术语层面:6) | 8387522 |
| 去:0007409 | axonogenesis | 国际能源机构 | 神经元,轴突神经突(术语层面:12) | - - - - - - |
| 去:0006470 | 蛋白质氨基酸脱磷酸作用 | 助教 | 1323835 | |
| 去:0008150 | biological_process | ND | - - - - - - | |
| 去:0006730 | 一个碳化合物代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005575 | cellular_component | ND | - - - - - - | |
| 去:0005578 | 蛋白质的细胞外基质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 8387522 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG上皮细胞信号在幽门螺杆菌感染 | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BERTUCCI髓与乳腺癌导管DN | 169年 | 118年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VECCHI胃癌早期DN | 367年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JAEGER转移DN | 258年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菅直人对三氧化二砷的回应 | 123年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GUENTHER增长球形VS附着 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES 1 | 379年 | 235年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不知道背景目标2 DN | 464年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 对紫外线C8 SESTO回应 | 72年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 一致的脂肪细胞的分化了 | 74年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 写到响应干扰素β | 71年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MAHAJAN IL1A反应 | 81年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DURCHDEWALD皮肤致癌DN | 264年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗3 | 720年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯TP53的目标了 | 602年 | 364年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53的目标 | 601年 | 369年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三骨DN乳腺癌复发 | 315年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564年 | 326年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌DN | 101年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村DN转移模型 | 43 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 熟知的乳房基底与腔的 | 54 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿隆索转移神经了 | 18 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿隆索转移了 | 198年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 162年 | 168年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 129 - 5 - p | 788年 | 794年 | m8 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
| hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
| mir - 133 | 512年 | 518年 | 1 | hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU |
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| mir - 200 bc / 429 | 449年 | 455年 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||
| miR-221/222 | 354年 | 360年 | 1 | hsa - mir - 221大脑 | AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC |
| hsa - mir - 222大脑 | AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC | ||||
| mir - 450 | 788年 | 794年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |