基因页:BAX
概括?
基因 | 581 |
Symbol | BAX |
同义词 | BCL2L4 |
描述 | BCl2相关X蛋白 |
参考 | MIM:600040|HGNC:HGNC:959|Ensembl:ENSG00000087088|HPRD:02498|Vega:Otthumg00000160476 |
Gene type | protein-coding |
地图位置 | 19q13.3-q13.4 |
Pascal P值 | 0.226 |
Fetal beta | 0.484 |
eGene | Cerebellum 下丘脑 |
数据源中的基因
Gene set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias | Click to show details |
go_annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | Hits with neuro-related keywords: 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BAX_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0042803 | protein homodimerization activity | 艾达 | 16608847 | |
GO:0042803 | protein homodimerization activity | IPI | 9111042 | |
GO:0046982 | protein heterodimerization activity | IPI | 9111042 | |
Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0043525 | 神经元凋亡的阳性调节 | 艾达 | neuron (GO term level: 9) | 15637643 |
去:0006917 | induction of apoptosis | 艾达 | 11912183 | |
去:0006919 | caspase激活 | 艾达 | 11912183 | |
GO:0042981 | regulation of apoptosis | IEA | - | |
GO:0043496 | regulation of protein homodimerization activity | 艾达 | 9111042 | |
GO:0043497 | 调节蛋白质异构化活性 | IPI | 9111042 | |
GO:0045786 | negative regulation of cell cycle | IEA | - | |
细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
去:0005829 | cytosol | 经验 | 10629050 | |
去:0005829 | cytosol | 艾达 | 11912183 | |
GO:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 11912183 | |
GO:0005741 | 线粒体外膜 | 经验 | 11136736 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | integral to membrane | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BAK1 | BAK | BAK-LIKE | BCL2L7 | CDN1 | MGC117255 | MGC3887 | BCL2-antagonist/killer 1 | - | HPRD,Biogrid | 11571294 |
BAX | BCL2L4 | BCl2相关X蛋白 | 两个杂交 | BioGRID | 11161816 |
BBC3 | JFY1 | PUMA | BCL2 binding component 3 | Bax与PUMA相互作用。 | BIND | 15574335 |
BCL2 | Bcl-2 | B-cell CLL/lymphoma 2 | - | HPRD,Biogrid | 8358790 |
BCL2 | Bcl-2 | B-cell CLL/lymphoma 2 | Bax与Bcl-2相互作用。 | BIND | 15574335 |
BCL2 | Bcl-2 | B-cell CLL/lymphoma 2 | - | HPRD | 8358790 | 9111042 |
BCL2 | Bcl-2 | B-cell CLL/lymphoma 2 | BCL-2与BAX相互作用。 | BIND | 9130713 |
bcl2a1 | ACC-1 | ACC-2 | BCL2L5 | BFL1 | GRS | HBPA1 | BCl2相关蛋白A1 | - | HPRD,Biogrid | 10753914 |
BCL2L1 | bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs | Bcl2样1 | BAX通过其BH3域与BCL-XL相互作用。这种相互作用是在小鼠Bax和人BCL-XL之间证明的相互作用上建模的。 | BIND | 11060313 |
BCL2L1 | bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs | Bcl2样1 | BAX与BCL-XL相互作用。 | BIND | 9372935 |
BCL2L1 | bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs | Bcl2样1 | BAX与BCL-XL相互作用。 | BIND | 15574335 |
BCL2L1 | bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs | Bcl2样1 | Affinity Capture-Western Protein-peptide |
BioGRID | 9824152|12137781 |12853473 |
BCL2L10 | bcl-b |嘘|Diva |MGC129810 |MGC129811 | Bcl2样10(凋亡促进剂) | - | HPRD,Biogrid | 11278245 |
BCL2L2 | bcl-w |bclw |KIAA0271 | Bcl2样2 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 10381646 |
BCLAF1 | BTF | KIAA0164 | bK211L9.1 | BCL2-associated转录factor 1 | - | HPRD | 10330179 |
BID | FP497 |MGC15319 |MGC42355 | BH3互动域死亡激动剂 | Bax与出价相互作用。 | BIND | 15574335 |
Bnipl | BNIP-S |BNIPL-1 |bnipl-2 |bnipl1 |bnipl2 |PP753 | BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like | 两个杂交 | BioGRID | 12901880 |
CRYAA | CRYA1 | HSPB4 | crystallin, alpha A | HalphaA-crystallin interacts with Bax. | BIND | 14752512 |
CRYAB | crya2 |CTPP2 |HSPB5 | crystallin, alpha B | HalphaB-crystallin interacts with Bax. | BIND | 14752512 |
GTF2B | TF2B |tfiib | 通用转录因子IIB | GTF2B (TFIIB) interacts with the Bax promoter. | BIND | 15710329 |
HSPD1 | CPN60 | GROEL | HSP60 | HSP65 | HuCHA60 | SPG13 | heat shock 60kDa protein 1 (chaperonin) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12070120 |
MCL1 | bcl2l3 |吃|mcl1l |mcl1s |MGC104264 |MGC1839 |TM值 | myeloid cell leukemia sequence 1 (BCL2-related) | - | HPRD,Biogrid | 10837489 |
MOAP1 | MAP-1 | PNMA4 | 凋亡调节剂1 | MAP-1 interacts with an unspecified isoform of Bax. | BIND | 15949439 |
MOAP1 | MAP-1 | PNMA4 | 凋亡调节剂1 | BAX通过其BH1,BH2和BH3域与MAP-1相互作用。这种相互作用是在小鼠Bax和人MAP-1之间证明的相互作用上建模的。 | BIND | 11060313 |
MOAP1 | MAP-1 | PNMA4 | 凋亡调节剂1 | - | HPRD,Biogrid | 11060313 |
MUC1 | CD227 | EMA | H23AG | MAM6 | PEM | PEMT | PUM | 粘蛋白1,细胞表面相关 | MUC1 C-TER与BAX启动子相互作用。 | BIND | 15710329 |
NOL3 | ARC | CARD2 | MYC | MYP | NOP | NOP30 | nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) | ARC与Bax相互作用。 | BIND | 15383280 |
PMAIP1 | APR |noxa | phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 15705586 |
SFN | 是的 | stratifin | - | HPRD | 11574543 |
SH3GLB1 | BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 | SH3-domain GRB2-like endophilin B1 | BAX的未指定同工型与SH3GLB1相互作用。 | BIND | 11161816 |
SH3GLB1 | BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 | SH3-domain GRB2-like endophilin B1 | - | HPRD,Biogrid | 11161816|11259440 |
SLC25A4 | AAC1 | ANT | ANT1 | PEO2 | PEO3 | T1 | solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 4 | - | HPRD,Biogrid | 9748162 |
SNCA | MGC110988 | NACP | PARK1 | PARK4 | PD1 | 突触核蛋白,α(淀粉样蛋白前体的非A4成分) | Reconstituted Complex | BioGRID | 11742726 |
TAF1 | Ba2r |CCG1 |CCGS |dyt3 |kat4 |N-TAF1 |NSCL2 ||P250 |taf2a | TAFII250 | TAF1RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa | TAF1(TAFII250) interacts with the Bax promoter. | BIND | 15710329 |
TBP | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA box binding protein | TBP与BAX启动子相互作用。 | BIND | 15710329 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | tumor protein p53 | p53interacts with Bax. | BIND | 15607964 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | tumor protein p53 | p53与Bax启动子相互作用。 | BIND | 16009130 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | tumor protein p53 | p53与Bax启动子相互作用。 | BIND | 15710329 |
TP73 | p73 | tumor protein p73 | p73-alpha interacts with BAX promoter. | BIND | 15893728 |
VDAC1 | MGC111064 | PORIN | PORIN-31-HL | voltage-dependent anion channel 1 | - | HPRD | 9843949|12767928 | 12767928 |
VDAC1 | MGC111064 | PORIN | PORIN-31-HL | voltage-dependent anion channel 1 | - | HPRD,Biogrid | 12767928 |
ywhaq | 14-3-3 | 1C5 | HS1 | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide | - | HPRD,Biogrid | 12426317 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG P53 SIGNALING PATHWAY | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg凋亡 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PRION DISEASES | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PATHWAYS IN CANCER | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG COLORECTAL CANCER | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA CHEMICAL PATHWAY | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA CERAMIDE PATHWAY | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA P53HYPOXIA PATHWAY | 23 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta P53途径 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA坏途径 | 26 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔线粒体途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SA PROGRAMMED CELL DEATH | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P73Pathway | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HDAC CLASSIII PATHWAY | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID NFAT 3 Pathway | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid reg gr途径 | 82 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CERAMIDE PATHWAY | 48 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CASPASE PATHWAY | 52 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SYNDECAN 2 PATHWAY | 33 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TAP63途径 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组凋亡 | 148 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
凋亡的反应组固有途径 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
加兹达钻石黑芬贫血髓样骨髓 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CASTELLANO NRAS TARGETS UP | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAIRO PML TARGETS BOUND BY MYC UP | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUNODA RESPONSE TO DASATINIB IMATINIB DN | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GALLUZZI PERMEABILIZE MITOCHONDRIA | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射2的响应2 | 127 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GALLUZZI PREVENT MITOCHONDIAL PERMEABILIZATION | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAVOLT TARGETS OF TP53 AND TP63 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHRAMM INHBA TARGETS UP | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ALCALA APOPTOSIS | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌中的富士park2 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMIT EGF RESPONSE 120 MCF10A | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Radaeva对IFNA1的响应 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FERNANDEZ BOUND BY MYC | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cheok对高清MTX的反应 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs供体DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weigel氧化应激反应 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS DN | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
糖尿病性肾病 | 86 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
INGA TP53 TARGETS | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张增殖与静止 | 51 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERHOLD ADIPOGENESIS DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BURTON ADIPOGENESIS 8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SANSOM WNT PATHWAY REQUIRE MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GALI TP53 TARGETS APOPTOTIC UP | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK SPERMATOGONIA | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG TLX TARGETS UP | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG BOUND BY MYC | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RAMPON ENRICHED LEARNING ENVIRONMENT EARLY DN | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 UP | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |