概括?
基因 581
Symbol BAX
同义词 BCL2L4
描述 BCl2相关X蛋白
参考 MIM:600040|HGNC:HGNC:959|Ensembl:ENSG00000087088|HPRD:02498|Vega:Otthumg00000160476
Gene type protein-coding
地图位置 19q13.3-q13.4
Pascal P值 0.226
Fetal beta 0.484
eGene Cerebellum
下丘脑

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details
go_annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0042803 protein homodimerization activity 艾达 16608847
GO:0042803 protein homodimerization activity IPI 9111042
GO:0046982 protein heterodimerization activity IPI 9111042
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0043525 神经元凋亡的阳性调节 艾达 neuron (GO term level: 9) 15637643
去:0006917 induction of apoptosis 艾达 11912183
去:0006919 caspase激活 艾达 11912183
GO:0042981 regulation of apoptosis IEA -
GO:0043496 regulation of protein homodimerization activity 艾达 9111042
GO:0043497 调节蛋白质异构化活性 IPI 9111042
GO:0045786 negative regulation of cell cycle IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0005829 cytosol 经验 10629050
去:0005829 cytosol 艾达 11912183
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0005739 线粒体 艾达 11912183
GO:0005741 线粒体外膜 经验 11136736
去:0016020 IEA -
GO:0016021 integral to membrane IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
BAK1 BAK | BAK-LIKE | BCL2L7 | CDN1 | MGC117255 | MGC3887 BCL2-antagonist/killer 1 - HPRD,Biogrid 11571294
BAX BCL2L4 BCl2相关X蛋白 两个杂交 BioGRID 11161816
BBC3 JFY1 | PUMA BCL2 binding component 3 Bax与PUMA相互作用。 BIND 15574335
BCL2 Bcl-2 B-cell CLL/lymphoma 2 - HPRD,Biogrid 8358790
BCL2 Bcl-2 B-cell CLL/lymphoma 2 Bax与Bcl-2相互作用。 BIND 15574335
BCL2 Bcl-2 B-cell CLL/lymphoma 2 - HPRD 8358790 | 9111042
BCL2 Bcl-2 B-cell CLL/lymphoma 2 BCL-2与BAX相互作用。 BIND 9130713
bcl2a1 ACC-1 | ACC-2 | BCL2L5 | BFL1 | GRS | HBPA1 BCl2相关蛋白A1 - HPRD,Biogrid 10753914
BCL2L1 bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs Bcl2样1 BAX通过其BH3域与BCL-XL相互作用。这种相互作用是在小鼠Bax和人BCL-XL之间证明的相互作用上建模的。 BIND 11060313
BCL2L1 bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs Bcl2样1 BAX与BCL-XL相互作用。 BIND 9372935
BCL2L1 bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs Bcl2样1 BAX与BCL-XL相互作用。 BIND 15574335
BCL2L1 bcl-xl/s |bcl2l |bclx |bcl-x |DKFZP781P2092 |bcl-xl |bcl-xs Bcl2样1 Affinity Capture-Western
Protein-peptide
BioGRID 9824152|12137781
|12853473
BCL2L10 bcl-b |嘘|Diva |MGC129810 |MGC129811 Bcl2样10(凋亡促进剂) - HPRD,Biogrid 11278245
BCL2L2 bcl-w |bclw |KIAA0271 Bcl2样2 Affinity Capture-Western BioGRID 10381646
BCLAF1 BTF | KIAA0164 | bK211L9.1 BCL2-associated转录factor 1 - HPRD 10330179
BID FP497 |MGC15319 |MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 Bax与出价相互作用。 BIND 15574335
Bnipl BNIP-S |BNIPL-1 |bnipl-2 |bnipl1 |bnipl2 |PP753 BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like 两个杂交 BioGRID 12901880
CRYAA CRYA1 | HSPB4 crystallin, alpha A HalphaA-crystallin interacts with Bax. BIND 14752512
CRYAB crya2 |CTPP2 |HSPB5 crystallin, alpha B HalphaB-crystallin interacts with Bax. BIND 14752512
GTF2B TF2B |tfiib 通用转录因子IIB GTF2B (TFIIB) interacts with the Bax promoter. BIND 15710329
HSPD1 CPN60 | GROEL | HSP60 | HSP65 | HuCHA60 | SPG13 heat shock 60kDa protein 1 (chaperonin) Affinity Capture-Western BioGRID 12070120
MCL1 bcl2l3 |吃|mcl1l |mcl1s |MGC104264 |MGC1839 |TM值 myeloid cell leukemia sequence 1 (BCL2-related) - HPRD,Biogrid 10837489
MOAP1 MAP-1 | PNMA4 凋亡调节剂1 MAP-1 interacts with an unspecified isoform of Bax. BIND 15949439
MOAP1 MAP-1 | PNMA4 凋亡调节剂1 BAX通过其BH1,BH2和BH3域与MAP-1相互作用。这种相互作用是在小鼠Bax和人MAP-1之间证明的相互作用上建模的。 BIND 11060313
MOAP1 MAP-1 | PNMA4 凋亡调节剂1 - HPRD,Biogrid 11060313
MUC1 CD227 | EMA | H23AG | MAM6 | PEM | PEMT | PUM 粘蛋白1,细胞表面相关 MUC1 C-TER与BAX启动子相互作用。 BIND 15710329
NOL3 ARC | CARD2 | MYC | MYP | NOP | NOP30 nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) ARC与Bax相互作用。 BIND 15383280
PMAIP1 APR |noxa phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 - HPRD,Biogrid 15705586
SFN 是的 stratifin - HPRD 11574543
SH3GLB1 BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 SH3-domain GRB2-like endophilin B1 BAX的未指定同工型与SH3GLB1相互作用。 BIND 11161816
SH3GLB1 BIF-1 |CGI-61 |KIAA0491 |DJ612B15.2 SH3-domain GRB2-like endophilin B1 - HPRD,Biogrid 11161816|11259440
SLC25A4 AAC1 | ANT | ANT1 | PEO2 | PEO3 | T1 solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 4 - HPRD,Biogrid 9748162
SNCA MGC110988 | NACP | PARK1 | PARK4 | PD1 突触核蛋白,α(淀粉样蛋白前体的非A4成分) Reconstituted Complex BioGRID 11742726
TAF1 Ba2r |CCG1 |CCGS |dyt3 |kat4 |N-TAF1 |NSCL2 ||P250 |taf2a | TAFII250 TAF1RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa TAF1(TAFII250) interacts with the Bax promoter. BIND 15710329
TBP GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID TATA box binding protein TBP与BAX启动子相互作用。 BIND 15710329
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 p53interacts with Bax. BIND 15607964
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 p53与Bax启动子相互作用。 BIND 16009130
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 p53与Bax启动子相互作用。 BIND 15710329
TP73 p73 tumor protein p73 p73-alpha interacts with BAX promoter. BIND 15893728
VDAC1 MGC111064 | PORIN | PORIN-31-HL voltage-dependent anion channel 1 - HPRD 9843949|12767928 | 12767928
VDAC1 MGC111064 | PORIN | PORIN-31-HL voltage-dependent anion channel 1 - HPRD,Biogrid 12767928
ywhaq 14-3-3 | 1C5 | HS1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide - HPRD,Biogrid 12426317


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG P53 SIGNALING PATHWAY 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS 53 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PRION DISEASES 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG COLORECTAL CANCER 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CHEMICAL PATHWAY 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CERAMIDE PATHWAY 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P53HYPOXIA PATHWAY 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P53途径 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA坏途径 26 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔线粒体途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PROGRAMMED CELL DEATH 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P73Pathway 79 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HDAC CLASSIII PATHWAY 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT 3 Pathway 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CERAMIDE PATHWAY 48 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CASPASE PATHWAY 52 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SYNDECAN 2 PATHWAY 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TAP63途径 54 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组固有途径 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加兹达钻石黑芬贫血髓样骨髓 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASTELLANO NRAS TARGETS UP 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO PML TARGETS BOUND BY MYC UP 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUNODA RESPONSE TO DASATINIB IMATINIB DN 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALLUZZI PERMEABILIZE MITOCHONDRIA 43 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTTA APOPTOSIS VIA NFKB 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALLUZZI PREVENT MITOCHONDIAL PERMEABILIZATION 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAVOLT TARGETS OF TP53 AND TP63 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHRAMM INHBA TARGETS UP 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALA APOPTOSIS 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌中的富士park2 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 120 MCF10A 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radaeva对IFNA1的响应 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERNANDEZ BOUND BY MYC 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对高清MTX的反应 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs供体DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iglesias E2F目标 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS DN 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGA TP53 TARGETS 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS DN 64 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM WNT PATHWAY REQUIRE MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALI TP53 TARGETS APOPTOTIC UP 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK SPERMATOGONIA 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS UP 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMPON ENRICHED LEARNING ENVIRONMENT EARLY DN 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 UP 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因