概括
基因 5813
象征 普拉
同义词 mrd31 | pur-alpha | pur1 | puralpha
描述 富含嘌呤的元素结合蛋白A
参考 MIM:600473|HGNC:HGNC:9701|HPRD:02721|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31
Pascal P值 6.042E-4
Sherlock P值 0.603
胎儿β -1.65
DMG 2(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 RNA和蛋白质合成
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15563057 5 139493612 普拉 -0.031 0.26 DMG:Nishioka_2013
CG15563057 5 139493612 普拉 5.1e-10 -0.018 8.65e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6032295 CHR20 44178138 普拉 5813 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003691 双链端粒DNA结合 艾达 15777841
去:0003697 单链DNA结合 ISS -
去:0003705 RNA聚合酶II转录因子活性,增强子结合 塔斯 9334258
去:0008134 转录因子结合 ISS -
GO:0046332 Smad结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
去:0006350 转录 IEA -
去:0006270 DNA复制启动 塔斯 1545807
去:0006268 在复制过程中放松的DNA 艾达 15777841
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 IEA -
GO:0045892 转录,DNA依赖性的负调控 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000784 核染色体,端粒区域 我知道了 15777841
去:0005634 艾达 9716182
去:0005662 DNA复制因子复合物 ISS -
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钙虹膜肌肌敏感与恢复 5 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯急性髓样白血病CBF 82 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kannan TP53靶向DN 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房 38 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bacolod抗烷基化剂DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 73 79 1a HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-103/107 1571年 1577年 1a HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-129-5p 474 480 1a HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-142-5p 217 223 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-144 72 79 1A,M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-15/16/195/424/497 246 252 1a HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
HSA-MIR-15A uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 216 222 1a HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-21 371 377 1a HSA-MIR-21 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-218 470 476 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-221/222 1276 1282 M8 HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-223 168 175 1A,M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-24 1210 1217 1A,M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-26 302 308 M8 HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-27 782 788 1a HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-29 1285 1292 1A,M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-3p 1447 1453 M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-31 190 196 1a HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-330 928 935 1A,M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-369-3p 559 565 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 411 417 1a HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-410 428 434 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-448 732 738 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-485-3p 1395 1401 1a HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-488 743 749 1a HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa
mir-495 526 532 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-503 246 252 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
mir-539 518 524 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 650 656 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-544 657 663 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-9 854 860 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 1419 1425 M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu