基因页面:NGB
总结吗?
GeneID | 58157年 |
象征 | NGB |
同义词 | - - - - - - |
描述 | neuroglobin |
参考 | MIM: 605304|HGNC: HGNC: 14077|运用:ENSG00000165553|HPRD: 05602|织女:OTTHUMG00000171558 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 14 q24.3 |
帕斯卡假定值 | 0.282 |
夏洛克假定值 | 0.799 |
胎儿β | -2.443 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2151616 | chr9 | 101729102 | NGB | 58157年 | 0.17 | 反式 | ||
rs6132977 | chr20 | 2825971 | NGB | 58157年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NGB_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C4orf27 | 0.86 | 0.85 |
RG9MTD1 | 0.85 | 0.86 |
PSMA4 | 0.84 | 0.87 |
TIMM9 | 0.84 | 0.85 |
RBM34 | 0.84 | 0.85 |
DPM1 | 0.84 | 0.87 |
BXDC2 | 0.84 | 0.83 |
C7orf36 | 0.84 | 0.84 |
CWC15 | 0.83 | 0.87 |
FRG1 | 0.83 | 0.80 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.15 | -0.59 | -0.61 |
MT-CYB | -0.59 | -0.59 |
AF347015.2 | -0.59 | -0.61 |
AF347015.26 | -0.58 | -0.63 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.58 |
AF347015.27 | -0.56 | -0.56 |
SEMA3G | -0.56 | -0.62 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.57 |
MT-CO2 | -0.56 | -0.54 |
英格 | -0.55 | -0.59 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005344 | 氧运输活动 | 助教 | 11029004 | |
去:0019825 | 氧气结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0020037 | 血红素结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006810 | 运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0015671 | 氧气输送 | NAS | 11029004 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005833 | 血红蛋白复合体 | NAS | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |