基因页:ABCD3
Summary?
GeneID | 5825 |
象征 | ABCD3 |
同义词 | ABC43 | CBAS5 | PMP70 | PXMP1 | ZWS2 |
描述 | ATP结合盒子亚家族D成员3 |
参考 | MIM:170995|HGNC:HGNC:67|ENSEMBL:ENSG00000117528|HPRD:01368|Vega:Otthumg0000000010717 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p21.3 |
Pascal P值 | 0.595 |
Sherlock P值 | 0.36 |
胎儿β | 0.568 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG17906523 | 1 | 94883536 | ABCD3 | 9.04e-9 | -0.01 | 4.12E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4847340 | CHR1 | 95158602 | ABCD3 | 5825 | 0.12 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ABCD3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
补充说明:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
补充说明:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABCD1 | ABC42 |Ald |ALDP |amn | ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 | ALDP与PMP70的异二聚化。 | 绑定 | 10551832 |
ABCD1 | ABC42 |Ald |ALDP |amn | ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 | - | HPRD,Biogrid | 10551832 |
ABCD2 | ABC39 |aldl1 |Aldr |aldrp |哈尔德 | ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 2 | PMP70与ALDRP相互作用。这种相互作用是在人类PMP70和小鼠ALDRP之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 10551832 |
ABCD3 | ABC43 |PMP70 |PXMP1 | ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 3 | PMP70通过羧基末端一半均匀地二聚二聚体。 | 绑定 | 10551832 |
BRF2 | Brfu |FLJ11052 |TFIIIB50 | BRF2,RNA聚合酶III转录起始因子的亚基,BRF1样 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
C20ORF24 | PNAS-11 |RIP5 | 染色体20开放阅读框24 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
COL6A2 | DKFZP586E1322 |FLJ46862 |pp3610 | 胶原蛋白,VI型,Alpha 2 | - | HPRD | 12176987 |
最高明的 | DKFZP686L18234 |MGC111102 |MGC8703 |PEG1 | 中胚层特定的转录本同源物(鼠标) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
MLF2 | NTN4 | 髓样白血病因子2 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
佩洛 | CGI-17 | PRO1770 | Pelota同源物(果蝇) | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PEX19 | D1S2223E |HK33 |PMP1 |PMPI |PXF |PXMP1 | 过氧化物酶体生物发生因子19 | PMP70与Farnesylation和突变的Farnesyl缺陷型PEX19相互作用。 | 绑定 | 10777694 |
PEX19 | D1S2223E |HK33 |PMP1 |PMPI |PXF |PXMP1 | 过氧化物酶体生物发生因子19 | - | HPRD,Biogrid | 10777694|11453642 |
PGRMC1 | HPR6.6 |MPR | 孕酮受体膜成分1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
PTP4A3 | prl-3 |prl-r |PRL3 | 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Reactome ABCA转运蛋白在脂质稳态中 | 18 | 11 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Reactome ABC家族蛋白介导的运输 | 34 | 21 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
渡边直肠癌放疗反应能力 | 108 | 67 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 | 137 | 84 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN | 64 | 38 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Sesto对UV C4的反应 | 20 | 14 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 | 83 | 49 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
大脑衰老 | 262 | 186 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
马洛尼对17AAG DN的回应 | 79 | 45 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Zhan早期分化基因dn | 42 | 29 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 所有SZGR 2.0基因this pathway |