Summary
GeneID 5825
象征 ABCD3
同义词 ABC43 | CBAS5 | PMP70 | PXMP1 | ZWS2
描述 ATP结合盒子亚家族D成员3
参考 MIM:170995|HGNC:HGNC:67|ENSEMBL:ENSG00000117528|HPRD:01368|Vega:Otthumg0000000010717
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p21.3
Pascal P值 0.595
Sherlock P值 0.36
胎儿β 0.568
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17906523 1 94883536 ABCD3 9.04e-9 -0.01 4.12E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4847340 CHR1 95158602 ABCD3 5825 0.12 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

补充说明:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

补充说明:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
ABCD1 ABC42 |Ald |ALDP |amn ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 ALDP与PMP70的异二聚化。 绑定 10551832
ABCD1 ABC42 |Ald |ALDP |amn ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 1 - HPRD,Biogrid 10551832
ABCD2 ABC39 |aldl1 |Aldr |aldrp |哈尔德 ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 2 PMP70与ALDRP相互作用。这种相互作用是在人类PMP70和小鼠ALDRP之间证明的相互作用上建模的。 绑定 10551832
ABCD3 ABC43 |PMP70 |PXMP1 ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 3 PMP70通过羧基末端一半均匀地二聚二聚体。 绑定 10551832
BRF2 Brfu |FLJ11052 |TFIIIB50 BRF2,RNA聚合酶III转录起始因子的亚基,BRF1样 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
C20ORF24 PNAS-11 |RIP5 染色体20开放阅读框24 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
COL6A2 DKFZP586E1322 |FLJ46862 |pp3610 胶原蛋白,VI型,Alpha 2 - HPRD 12176987
最高明的 DKFZP686L18234 |MGC111102 |MGC8703 |PEG1 中胚层特定的转录本同源物(鼠标) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
MLF2 NTN4 髓样白血病因子2 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
佩洛 CGI-17 | PRO1770 Pelota同源物(果蝇) 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PEX19 D1S2223E |HK33 |PMP1 |PMPI |PXF |PXMP1 过氧化物酶体生物发生因子19 PMP70与Farnesylation和突变的Farnesyl缺陷型PEX19相互作用。 绑定 10777694
PEX19 D1S2223E |HK33 |PMP1 |PMPI |PXF |PXMP1 过氧化物酶体生物发生因子19 - HPRD,Biogrid 10777694|11453642
PGRMC1 HPR6.6 |MPR 孕酮受体膜成分1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
PTP4A3 prl-3 |prl-r |PRL3 蛋白酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员3 亲和力捕获ms Biogrid 17353931


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG ABC转运蛋白 44 29 所有SZGR 2.0基因this pathway
kegg过氧化物酶体 78 47 所有SZGR 2.0基因this pathway
Reactome ABCA转运蛋白在脂质稳态中 18 11 所有SZGR 2.0基因this pathway
Reactome ABC家族蛋白介导的运输 34 21 所有SZGR 2.0基因this pathway
小分子的反应组跨膜转运 413 270 所有SZGR 2.0基因this pathway
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 所有SZGR 2.0基因this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN 84 53 所有SZGR 2.0基因this pathway
thum收缩性心力衰竭 423 283 所有SZGR 2.0基因this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 所有SZGR 2.0基因this pathway
刘vmyb的目标 127 78 所有SZGR 2.0基因this pathway
乳腺癌腔与基础DN 455 304 所有SZGR 2.0基因this pathway
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 所有SZGR 2.0基因this pathway
tien肠益生菌24小时 557 331 所有SZGR 2.0基因this pathway
Kim WT1靶向DN 459 276 所有SZGR 2.0基因this pathway
Graham CML分割与正常静止 181 101 所有SZGR 2.0基因this pathway
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 所有SZGR 2.0基因this pathway
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 137 84 所有SZGR 2.0基因this pathway
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 所有SZGR 2.0基因this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 所有SZGR 2.0基因this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 所有SZGR 2.0基因this pathway
Mohankumar TLX1靶向 414 287 所有SZGR 2.0基因this pathway
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 所有SZGR 2.0基因this pathway
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN 64 38 所有SZGR 2.0基因this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 所有SZGR 2.0基因this pathway
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 所有SZGR 2.0基因this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 所有SZGR 2.0基因this pathway
Sesto对UV C4的反应 20 14 所有SZGR 2.0基因this pathway
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 83 49 所有SZGR 2.0基因this pathway
大脑衰老 262 186 所有SZGR 2.0基因this pathway
welcsh brca1靶向 198 132 所有SZGR 2.0基因this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 所有SZGR 2.0基因this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 所有SZGR 2.0基因this pathway
马洛尼对17AAG DN的回应 79 45 所有SZGR 2.0基因this pathway
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 所有SZGR 2.0基因this pathway
王肿瘤的侵入性 374 247 所有SZGR 2.0基因this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 所有SZGR 2.0基因this pathway
Zhan早期分化基因dn 42 29 所有SZGR 2.0基因this pathway
Hoshida肝癌亚类S2 115 74 所有SZGR 2.0基因this pathway
棕熊UVC响应很晚 317 190 所有SZGR 2.0基因this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 所有SZGR 2.0基因this pathway
phong tnf响应不是通过p38 337 236 所有SZGR 2.0基因this pathway