基因页:Linc00474
概括?
基因 | 58483 |
象征 | Linc00474 |
同义词 | c9orf27 | est-yd1 |
描述 | 长基因间非蛋白质编码RNA 474 |
参考 | HGNC:HGNC:23367|HPRD:12951| |
基因类型 | ncRNA |
地图位置 | 9Q31.3 |
Pascal P值 | 0.023 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共同表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
EIF3L | 0.96 | 0.94 |
EIF4A1 | 0.96 | 0.95 |
EEF2 | 0.96 | 0.94 |
EIF3D | 0.95 | 0.92 |
RBM4 | 0.95 | 0.94 |
prPSAP2 | 0.95 | 0.94 |
DHP | 0.94 | 0.92 |
Trim28 | 0.94 | 0.92 |
QARS | 0.94 | 0.92 |
C12orf41 | 0.94 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.89 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.89 |
HLA-F | -0.75 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.88 |
AIFM3 | -0.75 | -0.80 |
AF347015.33 | -0.74 | -0.88 |
mt-cyb | -0.73 | -0.88 |
C5orf53 | -0.73 | -0.77 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.89 |
hepn1 | -0.71 | -0.78 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |