基因页面:RPRD1B
总结吗?
| GeneID | 58490年 |
| 象征 | RPRD1B |
| 同义词 | C20orf77 | |爬行NET60 | dJ1057B20.2 |
| 描述 | 包含1 b核监管pre-mRNA域 |
| 参考 | MIM: 614694|HGNC: HGNC: 16209|运用:ENSG00000101413|HPRD: 08513|织女:OTTHUMG00000032434 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20 q11.23 |
| 帕斯卡假定值 | 0.092 |
| 胎儿β | 0.593 |
| eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7132043 | chr12 | 80968399 | RPRD1B | 58490年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC30A9 | 0.91 | 0.88 |
| PPP2CA | 0.90 | 0.87 |
| PPME1 | 0.90 | 0.88 |
| STAU2 | 0.90 | 0.87 |
| KLRAQ1 | 0.89 | 0.88 |
| FAM49B | 0.89 | 0.86 |
| RAB2A | 0.89 | 0.86 |
| DNAJA2 | 0.89 | 0.85 |
| MORF4L2 | 0.89 | 0.85 |
| RHOT1 | 0.88 | 0.86 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.70 | -0.60 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.59 |
| AF347015.2 | -0.68 | -0.56 |
| AF347015.8 | -0.67 | -0.58 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.58 |
| AF347015.21 | -0.66 | -0.55 |
| MT-CYB | -0.66 | -0.57 |
| HIGD1B | -0.66 | -0.59 |
| FXYD1 | -0.66 | -0.62 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.57 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BERENJENO通过RHOA转换 | 536年 | 340年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 香港E2F3目标 | 97年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森受E2F4如果 | 728年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |