基因页面:ZNF77
总结吗?
GeneID | 58492年 |
象征 | ZNF77 |
同义词 | pT1 |
描述 | 锌指蛋白77 |
参考 | MIM: 194551|HGNC: HGNC: 13150|运用:ENSG00000175691|HPRD: 08936|织女:OTTHUMG00000180566 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 p13.3 |
帕斯卡假定值 | 0.343 |
胎儿β | 0.876 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | CompositeSet |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
认为:Fromer_2014 | 全外显子组测序分析 | 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ZNF77 | chr19 | 2934356 | G | 一个 | NM_021217 | p.257R > W | 错义 | 精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg02600551 | 19 | 2950360 | ZNF77 | 1.37 e-9 | -0.007 | 1.37 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZNF77_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CTDSP1 | 0.80 | 0.77 |
BMP7 | 0.77 | 0.77 |
INPPL1 | 0.75 | 0.71 |
LRP10 | 0.74 | 0.74 |
SOX21 | 0.74 | 0.71 |
LAMB2 | 0.74 | 0.72 |
TRIP6 | 0.73 | 0.73 |
SLC12A4 | 0.73 | 0.74 |
FKBP10 | 0.72 | 0.71 |
LRIG1 | 0.71 | 0.70 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPR22 | -0.48 | -0.49 |
FAM49A | -0.44 | -0.41 |
NELL2 | -0.44 | -0.42 |
EIF4A2 | -0.41 | -0.41 |
OSBPL10 | -0.41 | -0.40 |
GUCY1A2 | -0.40 | -0.38 |
KCNK9 | -0.40 | -0.39 |
MYT1L | -0.40 | -0.37 |
MEF2C | -0.40 | -0.43 |
HMGCLL1 | -0.40 | -0.39 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
PURBEY CTBP1没有SATB1的目标 | 344年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |