概括
基因 585
象征 BBS4
同义词 -
描述 Bardet-Biedl综合征4
参考 MIM:600374|HGNC:HGNC:969|ENSEMBL:ENSG00000140463|HPRD:08982|Vega:Otthumg00000133510
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q22.3-Q23
Pascal P值 0.861
Sherlock P值 0.281
胎儿β -0.393
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12594938 CHR15 73071281 BBS4 585 0.06 顺式
RS10770856 CHR12 8705405 BBS4 585 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003777 微管运动活动 小鬼 15107855
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15107855
GO:0034452 Dynactin结合 艾达 15107855
去:0043014 α-微管蛋白结合 艾达 17574030
GO:0048487 β-微管蛋白结合 艾达 17574030
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0035058 感觉纤毛生物发生 IEA 神经元(GO期限:10) -
GO:0016358 树突开发 IEA 神经突,树突(GO期限:11) -
GO:0000226 微管细胞骨架组织 IEA -
去:0001895 视网膜稳态 IEA -
去:0001843 神经管闭合 IEA -
去:0007286 精子发育 IEA -
去:0007608 气味的感官感知 IEA -
GO:0033365 细胞器中的蛋白质定位 ISS -
GO:0033205 细胞周期中的细胞因子 小鬼 15107855
GO:0034454 微管锚定在中心体 小鬼 15107855
去:0030534 成人行为 IEA -
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
GO:0050893 感官处理 塔斯 14520415
GO:0019216 调节脂质代谢过程 IEA -
GO:0051297 中心体组织 小鬼 15107855
GO:0032465 细胞因子的调节 小鬼 15107855
GO:0045724 鞭毛生物发生的阳性调节 IEA -
GO:0046548 视网膜杆细胞发育 IEA -
GO:0045494 光感受器细胞维护 IEA -
GO:0051457 维持蛋白质位置 Igi 15107855
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000242 丁香三元材料 艾达 15107855
去:0005814 中心 艾达 15107855
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005932 基础身体 艾达 15107855|18299575
GO:0034464 bbsome 艾达 17574030
GO:0034451 中心卫星 艾达 15107855
GO:0031514 运动次级纤毛 艾达 18299575
GO:0031513 非运动原发性纤毛 艾达 17574030
GO:0060170 纤毛膜 艾达 17574030

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG乳腺癌ESR1 UP 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因