基因页:BBS4
概括?
基因 | 585 |
象征 | BBS4 |
同义词 | - |
描述 | Bardet-Biedl综合征4 |
参考 | MIM:600374|HGNC:HGNC:969|ENSEMBL:ENSG00000140463|HPRD:08982|Vega:Otthumg00000133510 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q22.3-Q23 |
Pascal P值 | 0.861 |
Sherlock P值 | 0.281 |
胎儿β | -0.393 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12594938 | CHR15 | 73071281 | BBS4 | 585 | 0.06 | 顺式 | ||
RS10770856 | CHR12 | 8705405 | BBS4 | 585 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/BBS4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003777 | 微管运动活动 | 小鬼 | 15107855 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15107855 | |
GO:0034452 | Dynactin结合 | 艾达 | 15107855 | |
去:0043014 | α-微管蛋白结合 | 艾达 | 17574030 | |
GO:0048487 | β-微管蛋白结合 | 艾达 | 17574030 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0035058 | 感觉纤毛生物发生 | IEA | 神经元(GO期限:10) | - |
GO:0016358 | 树突开发 | IEA | 神经突,树突(GO期限:11) | - |
GO:0000226 | 微管细胞骨架组织 | IEA | - | |
去:0001895 | 视网膜稳态 | IEA | - | |
去:0001843 | 神经管闭合 | IEA | - | |
去:0007286 | 精子发育 | IEA | - | |
去:0007608 | 气味的感官感知 | IEA | - | |
GO:0033365 | 细胞器中的蛋白质定位 | ISS | - | |
GO:0033205 | 细胞周期中的细胞因子 | 小鬼 | 15107855 | |
GO:0034454 | 微管锚定在中心体 | 小鬼 | 15107855 | |
去:0030534 | 成人行为 | IEA | - | |
GO:0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
GO:0050893 | 感官处理 | 塔斯 | 14520415 | |
GO:0019216 | 调节脂质代谢过程 | IEA | - | |
GO:0051297 | 中心体组织 | 小鬼 | 15107855 | |
GO:0032465 | 细胞因子的调节 | 小鬼 | 15107855 | |
GO:0045724 | 鞭毛生物发生的阳性调节 | IEA | - | |
GO:0046548 | 视网膜杆细胞发育 | IEA | - | |
GO:0045494 | 光感受器细胞维护 | IEA | - | |
GO:0051457 | 维持蛋白质位置 | Igi | 15107855 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000242 | 丁香三元材料 | 艾达 | 15107855 | |
去:0005814 | 中心 | 艾达 | 15107855 | |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005932 | 基础身体 | 艾达 | 15107855|18299575 | |
GO:0034464 | bbsome | 艾达 | 17574030 | |
GO:0034451 | 中心卫星 | 艾达 | 15107855 | |
GO:0031514 | 运动次级纤毛 | 艾达 | 18299575 | |
GO:0031513 | 非运动原发性纤毛 | 艾达 | 17574030 | |
GO:0060170 | 纤毛膜 | 艾达 | 17574030 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG乳腺癌ESR1 UP | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时DN | 101 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |