基因页面:SCAF1
总结吗?
GeneID | 58506年 |
象征 | SCAF1 |
同义词 | SRA1 |
描述 | SR-related CTD相关因子1 |
参考 | HGNC: HGNC: 30403|运用:ENSG00000126461|HPRD: 11604|织女:OTTHUMG00000183238 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 q13.3-q13.4 |
帕斯卡假定值 | 4.712 e - |
夏洛克假定值 | 0.552 |
胎儿β | -0.491 |
支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SCAF1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIF15 | 0.91 | 0.52 |
MCM10 | 0.91 | 0.44 |
PRC1 | 0.91 | 0.57 |
KIF23 | 0.90 | 0.51 |
TOP2A | 0.90 | 0.44 |
KIF4A | 0.90 | 0.48 |
CDK2 | 0.90 | 0.43 |
NCAPH | 0.90 | 0.53 |
BRIP1 | 0.90 | 0.51 |
CEP55 | 0.90 | 0.46 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.34 | -0.44 |
AF347015.27 | -0.34 | -0.44 |
MT-CO2 | -0.33 | -0.44 |
MT-CYB | -0.33 | -0.42 |
PTH1R | -0.32 | -0.33 |
AF347015.33 | -0.32 | -0.40 |
SLC9A3R2 | -0.32 | -0.24 |
AIFM3 | -0.32 | -0.35 |
C5orf53 | -0.32 | -0.32 |
AF347015.15 | -0.32 | -0.42 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
GINESTIER乳腺癌ZNF217放大DN | 335年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SOX2目标 | 734年 | 436年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG RXRA绑定与H4K20ME1马克 | 145年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |