基因页:prodh2
概括?
基因 | 58510 |
象征 | prodh2 |
同义词 | HSPOX1 | HYPDH |
描述 | 脯氨酸脱氢酶(氧化酶)2 |
参考 | MIM:616377|HGNC:HGNC:17325|Ensembl:ENSG00000250799|HPRD:17911|Vega:Otthumg00000180688 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.1 |
Pascal P值 | 0.827 |
胎儿β | -0.422 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRODH2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NDUFA2 | 0.92 | 0.80 |
UQCRQ | 0.91 | 0.80 |
LSMD1 | 0.91 | 0.77 |
myeov2 | 0.91 | 0.77 |
ATP5J2 | 0.90 | 0.81 |
COX7A2 | 0.90 | 0.82 |
timm8b | 0.90 | 0.84 |
MRPL52 | 0.90 | 0.76 |
NDUFB7 | 0.90 | 0.79 |
MRPL54 | 0.90 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
myh9 | -0.49 | -0.45 |
KIF16B | -0.46 | -0.46 |
SLC6A6 | -0.45 | -0.47 |
BAT2D1 | -0.43 | -0.41 |
LRP1 | -0.43 | -0.37 |
mtr | -0.42 | -0.42 |
PPFIA1 | -0.42 | -0.33 |
MDN1 | -0.42 | -0.38 |
C14orf43 | -0.42 | -0.40 |
magi2 | -0.42 | -0.37 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0004657 | 脯氨酸脱氢酶活性 | IEA | - | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006537 | 谷氨酸生物合成过程 | IEA | 谷氨酸(GO期限:9) | - |
去:0007254 | JNK级联 | IEA | - | |
去:0006562 | 脯氨酸分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |