概括
基因 58510
象征 prodh2
同义词 HSPOX1 | HYPDH
描述 脯氨酸脱氢酶(氧化酶)2
参考 MIM:616377|HGNC:HGNC:17325|Ensembl:ENSG00000250799|HPRD:17911|Vega:Otthumg00000180688
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.1
Pascal P值 0.827
胎儿β -0.422

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDUFA2 0.92 0.80
UQCRQ 0.91 0.80
LSMD1 0.91 0.77
myeov2 0.91 0.77
ATP5J2 0.90 0.81
COX7A2 0.90 0.82
timm8b 0.90 0.84
MRPL52 0.90 0.76
NDUFB7 0.90 0.79
MRPL54 0.90 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
myh9 -0.49 -0.45
KIF16B -0.46 -0.46
SLC6A6 -0.45 -0.47
BAT2D1 -0.43 -0.41
LRP1 -0.43 -0.37
mtr -0.42 -0.42
PPFIA1 -0.42 -0.33
MDN1 -0.42 -0.38
C14orf43 -0.42 -0.40
magi2 -0.42 -0.37

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004657 脯氨酸脱氢酶活性 IEA -
GO:0016491 氧化还原酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006537 谷氨酸生物合成过程 IEA 谷氨酸(GO期限:9) -
去:0007254 JNK级联 IEA -
去:0006562 脯氨酸分解代谢过程 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg精氨酸和脯氨酸代谢 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因