基因页：DLGAP3
概括？
| 基因 | 58512 |
| 象征 | DLGAP3 |
| 同义词 | DAP3 | SAPAP3 |
| 描述 | 光盘大型同源物相关蛋白3 |
| 参考 | MIM：611413|HGNC：HGNC：30368|ENSEMBL：ENSG00000116544|Vega：Otthumg00000004049 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p35.3-p34.1 |
| Pascal P值 | 0.15 |
| Sherlock P值 | 0.914 |
| 胎儿β | -0.414 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | 蛋白质聚类 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04031507 | 1 | 35334359 | DLGAP3 | 8.58e-5 | 0.434 | 0.026 | DMG：Wockner_2014 |
| CG18852567 | 1 | 35351627 | DLGAP3 | 2.14e-4 | -0.432 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
| CG26428731 | 1 | 35334352 | DLGAP3 | 2.762E-4 | 0.532 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| snap91 | 0.89 | 0.92 |
| DNAJC6 | 0.89 | 0.92 |
| TBC1D9 | 0.88 | 0.90 |
| SV2A | 0.87 | 0.89 |
| mpp2 | 0.86 | 0.87 |
| SLC27A4 | 0.86 | 0.89 |
| ENO2 | 0.85 | 0.88 |
| Nisch | 0.85 | 0.89 |
| PI4K2A | 0.84 | 0.88 |
| KIAA1467 | 0.84 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.54 | -0.56 |
| MT-CO2 | -0.53 | -0.54 |
| AP002478.3 | -0.53 | -0.58 |
| AC098691.2 | -0.52 | -0.59 |
| AF347015.31 | -0.52 | -0.53 |
| AF347015.2 | -0.51 | -0.49 |
| AF347015.8 | -0.51 | -0.54 |
| higd1b | -0.51 | -0.52 |
| AF347015.26 | -0.51 | -0.49 |
| mt-cyb | -0.50 | -0.51 |
第三节。基因本体论注释
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：5） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 | 142 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 505 | 511 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||