基因页:威兹
概括?
基因 | 58525 |
象征 | 威兹 |
同义词 | ZNF803 |
描述 | 广泛间隔的锌指图案 |
参考 | HGNC:HGNC:30917|Ensembl:ENSG00000011451|Vega:Otthumg00000182448 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.1 |
Pascal P值 | 0.997 |
TADA P值 | 0.017 |
胎儿β | 1.288 |
主持人 | 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
威兹 | CHR19 | 15536517 | G | 一个 | NM_021241 | p.382r> c | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21216828 | 19 | 15560076 | mir1470; wiz | 2.35e-5 | -0.291 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ADRM1 | 0.91 | 0.88 |
C11orf68 | 0.91 | 0.90 |
ZBTB45 | 0.89 | 0.90 |
MRPS2 | 0.89 | 0.84 |
imp3 | 0.88 | 0.85 |
ALKBH4 | 0.88 | 0.86 |
陷阱1 | 0.88 | 0.83 |
RNF126 | 0.88 | 0.87 |
APBB1 | 0.88 | 0.87 |
PPP2R1A | 0.88 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.8 | -0.72 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.64 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.65 |
AF347015.21 | -0.69 | -0.66 |
AF347015.27 | -0.69 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.63 |
AF347015.26 | -0.68 | -0.66 |
mt-cyb | -0.67 | -0.64 |
鼻孔 | -0.67 | -0.67 |
AF347015.2 | -0.66 | -0.62 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时 | 61 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |