概括
基因 58525
象征 威兹
同义词 ZNF803
描述 广泛间隔的锌指图案
参考 HGNC:HGNC:30917|Ensembl:ENSG00000011451|Vega:Otthumg00000182448
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.1
Pascal P值 0.997
TADA P值 0.017
胎儿β 1.288
主持人
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
威兹 CHR19 15536​​517 G 一个 NM_021241 p.382r> c 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21216828 19 15560076 mir1470; wiz 2.35e-5 -0.291 0.017 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ADRM1 0.91 0.88
C11orf68 0.91 0.90
ZBTB45 0.89 0.90
MRPS2 0.89 0.84
imp3 0.88 0.85
ALKBH4 0.88 0.86
陷阱1 0.88 0.83
RNF126 0.88 0.87
APBB1 0.88 0.87
PPP2R1A 0.88 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.8 -0.72 -0.67
MT-CO2 -0.71 -0.64
AF347015.33 -0.69 -0.65
AF347015.21 -0.69 -0.66
AF347015.27 -0.69 -0.67
AF347015.31 -0.68 -0.63
AF347015.26 -0.68 -0.66
mt-cyb -0.67 -0.64
鼻孔 -0.67 -0.67
AF347015.2 -0.66 -0.62

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 204 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时 61 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因