总结
GeneID 5859
象征 QARS
同义词 glnrs | mscca | pro2195
描述 谷氨酰胺基-TRNA合成酶
参考 MIM:603727|HGNC:HGNC:9751|Ensembl:ENSG00000172053|HPRD:07223|Vega:Otthumg00000156774
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.31
Pascal P值 0.025
Sherlock P值 0.187
胎儿β 0.649
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09092311 3 49142581 QARS 6.3e-8 -0.011 1.57E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mettl3 0.85 0.86
tekt2 0.83 0.80
RBM5 0.82 0.83
WDR19 0.82 0.84
C20ORF96 0.82 0.89
CENPT 0.82 0.84
Exosc10 0.81 0.87
ZNF789 0.81 0.80
C3orf62 0.81 0.77
TCTN2 0.80 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.64 -0.78
AF347015.31 -0.63 -0.77
MT-CO2 -0.62 -0.76
mt-cyb -0.60 -0.75
AF347015.8 -0.60 -0.75
AF347015.33 -0.60 -0.72
HLA-F -0.60 -0.65
ABCG2 -0.58 -0.67
AF347015.15 -0.58 -0.73
COPZ2 -0.57 -0.67

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004819 谷氨酰胺-TRNA连接酶活性 IEA -
去:0004819 谷氨酰胺-TRNA连接酶活性 塔斯 8078941
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14667819
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006424 谷氨酸-TRNA氨基酰化 IEA 谷氨酸(GO期限:11) -
去:0006425 谷氨酰胺基-TRNA氨基酰化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome线粒体tRNA氨基酰化 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老肌肉DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHNG多发性骨髓瘤过度 52 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan变量早期分化基因DN 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 68 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 17 24 1A,M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu