基因页：BCAT1
概括？
| 基因 | 586 |
| 象征 | BCAT1 |
| 同义词 | BCATC | BCT1 | ECA39 | MECA39 | PNAS121 | PP18 |
| 描述 | 分支链氨基酸转氨酶1 |
| 参考 | MIM：113520|HGNC：HGNC：976|Ensembl：ENSG00000060982|HPRD：00216|Vega：Otthumg00000169053 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p12.1 |
| Pascal P值 | 0.242 |
| TADA P值 | 7.44e-4 |
| 胎儿β | 0.922 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BCAT1 | CHR12 | 24989507..24989508 | GT | G | NM_001178091 NM_001178092 NM_001178093 NM_001178094 NM_005504 |
。 。 。 。 。 |
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精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004084 | 分支链 - 氨基酸酸性转氨酶活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：6） | - |
| 去：0004084 | 分支链 - 氨基酸酸性转氨酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸（GO期限：6） | 6933702 |
| 去：0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000082 | G1/s有丝分裂细胞周期的过渡 | 塔斯 | 8692959 | |
| 去：0009081 | 分支链家族氨基酸代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0009082 | 分支链家族氨基酸生物合成过程 | 塔斯 | 6933702 | |
| 去：0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 6933702 | |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg valine亮氨酸和异亮氨酸生物合成 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg pantothenate和COA生物合成 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组支链氨基酸分解代谢 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村癌症微环境DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| korkola胚胎癌 | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌基础与间充质DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗PML的目标是由Myc Up绑定 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海登布拉德在胰腺癌中扩增 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 留置权乳腺癌化生型与导管 | 83 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEART HDAC增殖集群DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOXA9和MEIS1的赫斯目标 | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生成2 | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Midbrain标记 | 82 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 怀特福德小儿癌标记 | 116 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 池子侵入性乳腺癌 | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类增殖 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TSAI DNAJB4靶向DN | 6 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| korkola胚胎癌与精子瘤 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇8的时间反应8 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 671 | 678 | 1A，M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-155 | 2573 | 2579 | M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |