基因页：Rab5a
概括？
| 基因 | 5868 |
| 象征 | Rab5a |
| 同义词 | rab5 |
| 描述 | Rab5a，Ras Oncogene家族成员 |
| 参考 | MIM：179512|HGNC：HGNC：9783|ENSEMBL：ENSG00000144566|HPRD：01542|Vega：Otthumg00000129889 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3P24.3 |
| Pascal P值 | 0.027 |
| Sherlock P值 | 0.248 |
| 支持 | 细胞内贩运 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.006 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.012 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mast2 | 0.95 | 0.93 |
| ankrd13b | 0.93 | 0.94 |
| ZNF446 | 0.93 | 0.94 |
| AC145098.2 | 0.93 | 0.93 |
| KIAA1602 | 0.93 | 0.93 |
| SMPD4 | 0.93 | 0.95 |
| GPR173 | 0.93 | 0.92 |
| CCDC120 | 0.92 | 0.91 |
| PPRC1 | 0.92 | 0.92 |
| KIAA0895L | 0.92 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.71 | -0.82 |
| C5orf53 | -0.70 | -0.73 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.82 |
| COPZ2 | -0.67 | -0.75 |
| AF347015.33 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.81 |
| ifi27 | -0.66 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.66 | -0.78 |
| S100B | -0.66 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003924 | GTPase活性 | 塔斯 | 2501306 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9697774|15016378 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | nas | 14613930 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 去：0019001 | 圭烷核苷酸结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007264 | 小GTPase介导的信号转导 | IEA | - | |
| 去：0006897 | 内吞作用 | 塔斯 | 8521472 | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001726 | 荷叶边 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0030139 | 内吞囊泡 | IEA | - | |
| GO：0042470 | 黑色素体 | IEA | - | |
| GO：0031901 | 早期内体膜 | IEA | - | |
| GO：0045121 | 膜筏 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Agtr1 | AG2S |agtr1a |agtr1b |AT1 |AT1B |at1r |AT2R1 |AT2R1A |AT2R1B |HAT1R | 血管紧张素II受体，1型 | - | HPRD，Biogrid | 11682489 |
| ALS2Cl | DKFZP686P238 |MGC129698 |RN49018 | ALS2 C末端 | - | HPRD，Biogrid | 15388334 |
| AP1G1 | adtg |clapg1 |MGC18255 | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1，伽马1亚基 | 两个杂交 | Biogrid | 14665628 |
| AP1G2 | G2AD | 与Adaptor相关的蛋白质复合物1，伽马2亚基 | 两个杂交 | Biogrid | 14665628 |
| CHM | DXS540 |FLJ38564 |GGTA |HSD-32 |MGC102710 |rep-1 |TCD | 绒毛膜血症（Rab护送蛋白1） | 重构的复合物 | Biogrid | 8294464 |
| CHML | FLJ10071 |FLJ13361 |rep2 | 类似脉络膜血症（Rab伴随蛋白2） | - | HPRD，Biogrid | 8294464|9730828 |
| EEA1 | MST105 |MSTP105 |ZFYVE2 | 早期内体抗原1 | Rab5与EEA.1相互作用。 | 绑定 | 15782196 |
| EEA1 | MST105 |MSTP105 |ZFYVE2 | 早期内体抗原1 | - | HPRD | 10491193|14600265 |
| EEA1 | MST105 |MSTP105 |ZFYVE2 | 早期内体抗原1 | 烦恼 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 11493665|11718716 |14600265 |
| GDI2 | FLJ16452 |FLJ37352 |拉布迪布 | GDP解离抑制剂2 | - | HPRD，Biogrid | 10512627 |
| GGA1 | - | Golgi相关，含有ARF结合蛋白1的γadaptin耳朵1 | 两个杂交 | Biogrid | 14665628 |
| GGA2 | FLJ20966 |KIAA1080 |vear | Golgi相关，含有ARF结合蛋白2 | 两个杂交 | Biogrid | 14665628 |
| GGA3 | KIAA0154 | Golgi相关，含有ARF结合蛋白3的γadaptin耳朵3 | 两个杂交 | Biogrid | 14665628 |
| kif3b | HH0048 |KIAA0359 | 动机家庭成员3B | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12832475 |
| Rab37 | FLJ30284 |FLJ32507 | Rab37，成员Ras Oncogene家族 | - | HPRD，Biogrid | 10722846 |
| Rab4a | HRES-1/RAB4 |rab4 | Rab4a，Ras Oncogene家族成员 | 共纯化 | Biogrid | 9524117 |
| Rab5a | rab5 | Rab5a，Ras Oncogene家族成员 | Rab5与第二个Rab5分子相互作用。 | 绑定 | 15782196 |
| Rab7a | FLJ20819 |Pro2706 |Rab7 | Rab7a，Ras Oncogene家族成员 | 两个杂交 | Biogrid | 10329441 |
| Rabac1 | pra1 |praf1 |yip3 | RAB受体1（原始化） | - | HPRD | 10329441 |
| Rabep1 | Rab5ep |Rabpt5 | Rabaptin，Rab GTPase结合效应蛋白1 | 共纯化 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 8521472|9045618 |9524117|11718716 |
| Rabep1 | Rab5ep |Rabpt5 | Rabaptin，Rab GTPase结合效应蛋白1 | - | HPRD | 8521472 | 9045618 |
| rasa1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂（GTPase激活蛋白）1 | - | HPRD | 11536198 |
| RIN1 | - | Ras和Rab Interactor 1 | - | HPRD，Biogrid | 11703925 |
| rin2 | RASSF4 | Ras和Rab Interactor 2 | - | HPRD | 12972505 |
| rin2 | RASSF4 | Ras和Rab Interactor 2 | 两个杂交 | Biogrid | 11733506 |
| rin3 | DKFZP762H1613 |FLJ11700 |FLJ22439 | Ras和Rab Interactor 3 | 两个杂交 | Biogrid | 12972505 |
| RIT2 | riba |Rin |ROC2 | 像RAS一样无CAAX 2 | 生化活动 | Biogrid | 11703925 |
| SDCBP | MDA-9 |ST1 |SYCL |Tacip18 | 联合结合蛋白（同步） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 15014045 |
| STX4 | STX4A |P35-2 | 语法4 | - | HPRD，Biogrid | 11884531 |
| TBC1D3 | TBC1D3A |TRE17 | TBC1域家庭，成员3 | - | HPRD | 12612085 |
| TBC1D3C | FLJ78248 |MGC44903 | TBC1域家庭，成员3C | - | HPRD | 12359748 |
| TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | - | HPRD | 9045618 |
| TSC2 | FLJ43106 |林|TSC4 | 结节硬化2 | 共纯化 | Biogrid | 12147258 |
| VPS45 | H1 |H1VPS45 |VPS45A |VPS45B |VPS54A |VSP45 |VSP45A | 液泡蛋白排序45个同源物（S. cerevisiae） | 亲和力捕获ms | Biogrid | 11062261 |
| ZFYVE20 | FLJ34993 |MGC126210 |Rabenosyn-5 | 锌指，含有20个的fyve域 | - | HPRD，Biogrid | 11062261 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG加压素调节的水重吸收 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肌萎缩性侧索硬化症ALS | 53 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Ptdins途径 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Rab Pathway | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid ajdiss 2Pathway | 48 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB1内部化途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID p38 alpha beta下游途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR1途径 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 咖啡馆对THC的反应 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Caffarel对THC 24小时5的响应 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染8小时 | 105 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YIH对砷C2的反应 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟A | 67 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 萨森对促性腺营养蛋白的反应 | 91 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对Forskolin DN的反应 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| STAT3的Azare肿瘤转化 | 121 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-101 | 884 | 891 | 1A，M8 | HSA-MIR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-130/301 | 1162 | 1169 | 1A，M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau | ||||
| HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
| HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
| HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
| mir-144 | 885 | 891 | 1a | HSA-MIR-144 | uacaguauagauguauguaguag |