概括
基因 5872
象征 Rab13
同义词 Gig4
描述 Rab13,Ras Oncogene家族成员
参考 MIM:602672|HGNC:HGNC:9762|Ensembl:ENSG00000143545|HPRD:04053|Vega:Otthumg0000000036589
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21.2
Sherlock P值 0.419
胎儿beta 0.576
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
PMID:COOCCUR 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2797257 CHR1 215911297 Rab13 5872 0.05 反式
RS7595584 CHR2 175652187 Rab13 5872 6.091E-5 反式
RS17029291 CHR3 32402138 Rab13 5872 0.03 反式
SNP_A-A-1853527 0 Rab13 5872 0.13 反式
RS7677329 CHR4 21586153 Rab13 5872 0.15 反式
RS16870339 CHR5 2705169 Rab13 5872 0.06 反式
RS6973230 CHR7 146072498 Rab13 5872 0.11 反式
RS12569493 CHR10 74886042 Rab13 5872 0.14 反式
RS16930362 CHR10 74890320 Rab13 5872 0.1 反式
RS17110576 CHR10 100409976 Rab13 5872 0.12 反式
RS10145685 CHR14 22794892 Rab13 5872 0.16 反式
RS624778 CHR15 48073967 Rab13 5872 0.01 反式
RS532707 CHR15 48074070 Rab13 5872 0.01 反式
RS553338 CHR15 48076921 Rab13 5872 0.01 反式
RS596942 CHR15 48082150 Rab13 5872 0.01 反式
RS16958358 CHR17 55502410 Rab13 5872 0.1 反式
RS9965053 CHR18 3166191 Rab13 5872 0.18 反式
RS17056775 CHR18 72988809 Rab13 5872 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003924 GTPase活性 tas 8294494
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0005525 GTP结合 IEA -
去:0008134 转录因子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0007155 细胞粘附 tas 8294494
去:0007264 小GTPase介导的信号转导 IEA -
去:0016192 囊泡介导的运输 tas 8294494
去:0015031 蛋白质转运 IEA -
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0005923 紧密连接 IEA 大脑(GO期限:10) -
去:0005923 紧密连接 tas 大脑(GO期限:10) 8294494
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 艾达 18029348
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
kegg紧密连接 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标向上 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化沉默的目标 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的Amundson生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN 80 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性向上 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李内膜T祖细胞 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner ES ICP与H3K4Me3 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC ICP带有H3K4ME3 20 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利伪虫 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假跨道趋化性 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集4 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jison镰状细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP,带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong TNF响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因