概括
基因 5876
象征 rabggtb
同义词 GGTB
描述 Rab geranylgeranylsylansferase beta亚基
参考 MIM:179080|HGNC:HGNC:9796|ENSEMBL:ENSG00000137955|HPRD:01532|Vega:Otthumg00000009786
基因类型 蛋白质编码
地图位置 131
Pascal P值 0.267
Sherlock P值 0.225
DEG P值 DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = 1.08:cc_ba10_disease_p = 0.0061:hbb_ba9_fold_change = 1.24:hbb_ba9_disease_p = 0.0152
胎儿β 1.236

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM177A1 0.83 0.80
TMEM68 0.81 0.80
SRP54 0.81 0.79
Rab11a 0.81 0.83
ptges3 0.81 0.81
Rab18 0.81 0.79
B3GALNT1 0.80 0.81
BIRC2 0.80 0.81
ASCC1 0.80 0.80
LRRC40 0.79 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.57 -0.65
AF347015.33 -0.56 -0.65
AF347015.8 -0.55 -0.64
AF347015.27 -0.54 -0.63
AF347015.31 -0.54 -0.63
mt-cyb -0.54 -0.63
AC018755.7 -0.53 -0.61
FXYD1 -0.53 -0.61
AF347015.15 -0.53 -0.64
AF347015.2 -0.52 -0.62

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 12620389
去:0004659 前转移酶活性 IEA -
去:0004663 Rab-蛋白质黄烷基凝血酶转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006464 蛋白质修饰过程 nas 8380507
去:0007601 视觉感知 塔斯 8380507

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID PRL信号事件途径 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水DN抑制 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肺癌 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schramm Inhba目标DN 24 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数大与微小的DN 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheng对醋酸镍的反应 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ehlers neuploidy up 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras致癌签名 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-381 98 104 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu