概括
基因 5877
象征 拉比夫
同义词 MSS4 | rasgfr3 | rasgrf3
描述 Rab相互作用因子
参考 MIM:603417|HGNC:HGNC:9797|HPRD:04566|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q32.1
胎儿β -0.184
DMG 1(#研究)
支持 细胞内贩运

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21690091 1 202830756 拉比夫 1.02e-10 -0.011 4.55e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LRPAP1 0.86 0.84
NGEF 0.85 0.83
NCDN 0.85 0.89
RP5-1187M17.1 0.84 0.89
ablim2 0.84 0.92
Htr6 0.83 0.84
INF2 0.83 0.77
adcy3 0.83 0.80
ENTPD3 0.82 0.82
FBXL16 0.82 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DBI -0.35 -0.38
Rab13 -0.35 -0.48
Spink8 -0.34 -0.37
RPS20 -0.34 -0.45
RPL34 -0.34 -0.44
Bcl7c -0.34 -0.44
FAM159B -0.33 -0.57
AF347015.21 -0.33 -0.21
AF347015.18 -0.33 -0.20
RPL38 -0.32 -0.46

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
石匠食道癌发生DN 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛DN 88 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan变量早期分化基因DN 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因