基因页:拉比夫
概括?
基因 | 5877 |
象征 | 拉比夫 |
同义词 | MSS4 | rasgfr3 | rasgrf3 |
描述 | Rab相互作用因子 |
参考 | MIM:603417|HGNC:HGNC:9797|HPRD:04566| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q32.1 |
胎儿β | -0.184 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | 细胞内贩运 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21690091 | 1 | 202830756 | 拉比夫 | 1.02e-10 | -0.011 | 4.55e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RABIF_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LRPAP1 | 0.86 | 0.84 |
NGEF | 0.85 | 0.83 |
NCDN | 0.85 | 0.89 |
RP5-1187M17.1 | 0.84 | 0.89 |
ablim2 | 0.84 | 0.92 |
Htr6 | 0.83 | 0.84 |
INF2 | 0.83 | 0.77 |
adcy3 | 0.83 | 0.80 |
ENTPD3 | 0.82 | 0.82 |
FBXL16 | 0.82 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DBI | -0.35 | -0.38 |
Rab13 | -0.35 | -0.48 |
Spink8 | -0.34 | -0.37 |
RPS20 | -0.34 | -0.45 |
RPL34 | -0.34 | -0.44 |
Bcl7c | -0.34 | -0.44 |
FAM159B | -0.33 | -0.57 |
AF347015.21 | -0.33 | -0.21 |
AF347015.18 | -0.33 | -0.20 |
RPL38 | -0.32 | -0.46 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
石匠食道癌发生DN | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛DN | 88 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan变量早期分化基因DN | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |