基因页：RAC2
概括?
| 基因ID | 5880 |
| Symbol | RAC2 |
| 同义词 | EN-7|Gx|HSPC022|p21-Rac2 |
| 描述 | ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) |
| 参考 | MIM：602049|HGNC：HGNC：9802|Ensembl:ENSG00000128340|HPRD：03628|Vega:OTTHUMG00000150540 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 22q13.1 |
| Pascal P值 | 0.065 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | gwasdbrecords for schizophrenia | |
| 简历：PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| 去_Annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | Hits with neuro-related keywords: 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| HECTD3 | 0.89 | 0.92 |
| DTX4 | 0.89 | 0.93 |
| TRIM27 | 0.88 | 0.93 |
| FRMD4A | 0.88 | 0.90 |
| Gprin1 | 0.88 | 0.93 |
| VASH1 | 0.88 | 0.88 |
| AKT1 | 0.88 | 0.91 |
| ZNF282 | 0.88 | 0.92 |
| DTX1 | 0.88 | 0.92 |
| SARM1 | 0.88 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.85 |
| S100B | -0.71 | -0.83 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.86 |
| AF347015.27 | -0.71 | -0.85 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.84 |
| FXYD1 | -0.69 | -0.82 |
| AIFM3 | -0.69 | -0.74 |
| MT-CYB | -0.69 | -0.83 |
| AC021016.1 | -0.68 | -0.84 |
| C5orf53 | -0.68 | -0.74 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去:0003924 | GTPase活性 | 塔斯 | 2674130 | |
| 去:0005515 | protein binding | 新闻学会 | 11090627 | |
| 去:0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去:0030031 | cell projection biogenesis | IEA | axon (GO term level: 8) | - |
| 去：0007165 | signal transduction | 塔斯 | 2674130 | |
| 去：0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | IEA | - | |
| GO：0010310 | regulation of hydrogen peroxide metabolic process | 塔斯 | 16636067 | |
| 去:0006935 | 趋化性 | IEA | - | |
| 去:0007264 | small GTPase mediated signal transduction | IEA | - | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 去:0060263 | 呼吸爆发调节 | IDA | 16636067 | |
| 细胞分量 | 去term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去:0005622 | intracellular | IEA | - | |
| 去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
| 去:0005635 | nuclear envelope | IEA | - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ACTB | PS1TP5BP1 | 肌动蛋白,β | - | HPRD，Biogrid | 11027608 |
| Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂（GDI）alpha | - | HPRD | 11513578 |
| Arhgdib | D4 | GDIA2 | GDID4 | LYGDI | Ly-GDI | RAP1GN1 | RhoGDI2 | RHO GDP解离抑制剂（GDI）β | - | HPRD，Biogrid | 10655614 |
| CDC42 | cdc42hs |G25K | 细胞分裂周期42（GTP结合蛋白，25KDA） | - | HPRD，Biogrid | 9748241 |
| CUL1 | MGC149834 | MGC149835 | 卡林1 | - | HPRD，Biogrid | 11445862 |
| DEF6 | IBP | SLAT | differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) | DEF6 interacts with Rac2. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human DEF6 and Rac2 from an unspecified species. | BIND | 15023524 |
| DEF6 | IBP | SLAT | differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) | - | HPRD，Biogrid | 15023524 |
| DOCK2 | FLJ46592 |KIAA0209 | dedicator of cytokinesis 2 | - | HPRD，Biogrid | 10559471 |
| GDI1 | FLJ41411 |gdil |MRX41 |MRX48 |OPHN2 |rabgd1a |Rabgdia |XAP-4 | GDP dissociation inhibitor 1 | - | HPRD，Biogrid | 9490022 |
| ICMT | HSTE14 |MGC39955 |MST098 |MSTP098 |PCCMT |PCMT |ppmt | isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase | - | HPRD，Biogrid | 9614111 |
| NCF2 | FLJ93058 | NCF-2 | NOXA2 | P67-PHOX | P67PHOX | neutrophil cytosolic factor 2 | - | HPRD，Biogrid | 9624165|9642115 |
| NOS2 | hep-nos |iNos |nos |NOS2A | nitric oxide synthase 2, inducible | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 11457725 |
| NOXA1 | FLJ25475 | MGC131800 | NY-CO-31 | SDCCAG31 | p51NOX | NADPH oxidase activator 1 | - | HPRD | 12716910 |
| PAK2 | PAK65 | PAKgamma | p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12176041 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG AXON GUIDANCE | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg vegf信号通路 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FOCAL ADHESION | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG NATURAL KILLER CELL MEDIATED CYTOTOXICITY | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG B CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY | 75 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FC GAMMA R MEDIATED PHAGOCYTOSIS | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG PATHWAYS IN CANCER | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG COLORECTAL CANCER | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg胰腺癌 | 70 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG病毒心肌炎 | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SIGNALING BY RHO GTPASES | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME AXON GUIDANCE | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Semaphorin信号中的Reactome SemA4D | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SEMAPHORIN INTERACTIONS | 68 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SemA4D诱导细胞迁移和生长锥塌陷 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 UP | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC1 TARGETS UP | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKEY RB1 ACUTE LOF UP | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NEBEN AML WITH FLT3 OR NRAS DN | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DAIRKEE TERT TARGETS UP | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC NETWORK | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALCALA APOPTOSIS | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIU NASOPHARYNGEAL CARCINOMA | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU CELL MIGRATION | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH MYC MAX TARGETS | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up | 87 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WIELAND UP BY HBV INFECTION | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Galindo对肠毒素的免疫反应 | 85 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GILDEA METASTASIS | 30 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PETROVA PROX1 TARGETS DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia延迟对TGFB1的响应 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCLACHLAN DENTAL CARIES DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C4的响应 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群T7 | 98 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KANG CISPLATIN RESISTANCE UP | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 2G | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村转移模型DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROSS LEUKEMIA WITH MLL FUSIONS | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP | 91 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARSON FOXP3 TARGETS UP | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DANG BOUND BY MYC | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACOSTA PROLIFERATION INDEPENDENT MYC TARGETS DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |