基因页:RAD52
概括?
基因 | 5893 |
象征 | RAD52 |
同义词 | - |
描述 | RAD52同源性DNA修复蛋白 |
参考 | MIM:600392|HGNC:HGNC:9824|Ensembl:ENSG00000002016|HPRD:11855|Vega:Otthumg0000000090361 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p13-p12.2 |
Pascal P值 | 0.045 |
Sherlock P值 | 0.617 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2948491 | Chrx | 40180688 | RAD52 | 5893 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AppBP2 | 0.92 | 0.94 |
USP38 | 0.90 | 0.92 |
COPB2 | 0.90 | 0.92 |
SSR1 | 0.90 | 0.91 |
Trip12 | 0.90 | 0.92 |
波尔克 | 0.90 | 0.92 |
PIK3C3 | 0.90 | 0.92 |
XPO4 | 0.89 | 0.91 |
IPO8 | 0.89 | 0.90 |
Stam2 | 0.89 | 0.93 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.65 | -0.71 |
MT-CO2 | -0.64 | -0.71 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.69 |
AF347015.8 | -0.61 | -0.70 |
AF347015.33 | -0.61 | -0.67 |
higd1b | -0.60 | -0.67 |
ifi27 | -0.60 | -0.67 |
mt-cyb | -0.60 | -0.67 |
AC018755.7 | -0.59 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG同源重组 | 28 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome同源重组修复复制独立双链断裂 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Double Strand Break修复 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wakasugi有Znf143绑定位点 | 58 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇1 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stanelle E2F1目标 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tseng irs1靶向DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杰克逊DNMT1靶向 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krasnoselskaya ILF3靶向DN | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang击倒第二个EGF脉冲 | 293 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |