概括
基因 5893
象征 RAD52
同义词 -
描述 RAD52同源性DNA修复蛋白
参考 MIM:600392|HGNC:HGNC:9824|Ensembl:ENSG00000002016|HPRD:11855|Vega:Otthumg0000000090361
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13-p12.2
Pascal P值 0.045
Sherlock P值 0.617
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2948491 Chrx 40180688 RAD52 5893 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AppBP2 0.92 0.94
USP38 0.90 0.92
COPB2 0.90 0.92
SSR1 0.90 0.91
Trip12 0.90 0.92
波尔克 0.90 0.92
PIK3C3 0.90 0.92
XPO4 0.89 0.91
IPO8 0.89 0.90
Stam2 0.89 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.65 -0.71
MT-CO2 -0.64 -0.71
AF347015.21 -0.62 -0.68
AF347015.31 -0.62 -0.69
AF347015.8 -0.61 -0.70
AF347015.33 -0.61 -0.67
higd1b -0.60 -0.67
ifi27 -0.60 -0.67
mt-cyb -0.60 -0.67
AC018755.7 -0.59 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG同源重组 28 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome同源重组修复复制独立双链断裂 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Double Strand Break修复 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wakasugi有Znf143绑定位点 58 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇1 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stanelle E2F1目标 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杰克逊DNMT1靶向 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向DN 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存DN 113 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang击倒第二个EGF脉冲 293 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因