基因页面:RAF1

总结吗?
GeneID 5894年
象征 RAF1
同义词 CMD1NN | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf
描述 Raf-1原癌基因,丝氨酸/苏氨酸激酶
参考 MIM: 164760|HGNC: HGNC: 9829|运用:ENSG00000132155|HPRD: 01265|织女:OTTHUMG00000129789
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 p25
帕斯卡假定值 0.01
夏洛克假定值 0.43
胎儿β 1.215
DMG 2(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 CANABINOID
多巴胺
METABOTROPIC谷氨酸受体
5 -羟色胺
G2Cdb.humanNRC
G2Cdb.humanPSP
Ascano FMRP目标

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
DMG: Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 2
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.006
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.1134

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg09326546 3 12705291 RAF1 -0.025 0.25 DMG: Nishioka_2013
cg09326546 3 12705291 RAF1 9.24 e-9 -0.008 4.15 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16829545 chr2 151977407 RAF1 5894年 2.8 e-5 反式
rs7787830 chr7 98797019 RAF1 5894年 0.05 反式
rs16955618 chr15 29937543 RAF1 5894年 4.884 e-5 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RAD50 0.95 0.95
BCLAF1 0.94 0.95
PRPF4B 0.93 0.95
DDX46 0.93 0.95
NARG1 0.93 0.95
ATRX 0.93 0.96
ZMYM2 0.93 0.93
FBXO11 0.93 0.94
ZNF33A 0.93 0.94
RBM26 0.93 0.95
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.73 -0.85
AF347015.31 -0.73 -0.85
TSC22D4 -0.73 -0.82
MT-CO2 -0.72 -0.85
IFI27 -0.72 -0.85
AF347015.27 -0.71 -0.82
AIFM3 -0.71 -0.77
ENHO -0.70 -0.87
AF347015.33 -0.70 -0.81
HIGD1B -0.70 -0.85

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005057 受体信号传导蛋白活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 9624170|10433554
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004674 蛋白质的丝氨酸/苏氨酸激酶活性 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0019992 二酰基甘油绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006468 蛋白质磷酸化氨基酸 助教 8063729
去:0007265 Ras蛋白信号转导 经验值 11520933
去:0007010 细胞骨架组织 国际能源机构 - - - - - -
去:0008283 细胞增殖 助教 8063729
去:0048011 神经生长因子受体信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0006915 细胞凋亡 助教 8929532
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005829 胞质 经验值 9069260
去:0005741 线粒体外膜 助教 8929532
去:0005886 等离子体膜 经验值 9069260

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 源 PubMed ID
AKT1 一种蛋白激酶| MGC99656 | PKB | PKB-ALPHA | PRKBA | RAC | RAC-ALPHA v-akt小鼠胸腺瘤病毒致癌基因同族体1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10576742
基于“增大化现实”技术 AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 雄性激素受体 - - - - - - HPRD, BioGRID 8349631
BAG1 RAP46 BCL2-associated athanogene - - - - - - HPRD, BioGRID 8692945
BCL2 bcl - 2 b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤2 - - - - - - HPRD, BioGRID 8910675|8929532
BCL2L1 BCL-XL / S | BCL2L | BCLX | Bcl-X | DKFZp781P2092 | BCL-XL | bcl-xS BCL2-like 1 重新组成复杂 BioGRID 8929532
BRAF B-RAF1 | BRAF1 | FLJ95109 | MGC126806 | MGC138284 | RAFB1 v-raf小鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官B1 b - raf与C-RAF交互。这种交互是仿照人类猴和b - raf C-RAF证明之间的交互。 绑定 15035987
BRAF B-RAF1 | BRAF1 | FLJ95109 | MGC126806 | MGC138284 | RAFB1 v-raf小鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官B1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11325826
CCT3 CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 包含TCP1 chaperonin,亚基3(γ) RAF1 (C-Raf)与CCT3 (hC87)。 绑定 12620389
CCT3 CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 包含TCP1 chaperonin,亚基3(γ) C-RAF与CCT3交互。 绑定 12620389
CCT3 CCT-gamma | CCTG | PIG48 | TCP-1-gamma | TRIC5 包含TCP1 chaperonin,亚基3(γ) 2台混合动力 BioGRID 12620389
CDC25A CDC25A2 细胞分裂周期25同族体(s .非洲酒) - - - - - - HPRD, BioGRID 9230211|10373531
CFLAR 现金| CASP8AP1 | CLARP |卡斯珀火焰| | FLAME-1 | FLAME1 | |翻转I-FLICE | MRIT | c-FLIP | c-FLIPL | c-FLIPR | c-FLIPS CASP8 FADD-like凋亡调节器 - - - - - - HPRD, BioGRID 10837247
CNKSR1 CNK | CNK1 | KSR 连接器增强剂的激酶抑制Ras 1 - - - - - - HPRD, BioGRID 15075335
CNKSR2 CNK2 | KIAA0902 | KSR2 连接器增强剂的激酶抑制Ras 2 亲和力Capture-Western BioGRID 14597674
COPS3 SGN3 COP9本构photomorphogenic同族体亚基3(拟南芥) RAF1 (C-Raf)与COPS3 (SGN3)。 绑定 12620389
COPS3 SGN3 COP9本构photomorphogenic同族体亚基3(拟南芥) C-RAF与SGN3交互。 绑定 12620389
CPS1 - - - - - - carbamoyl-phosphate合成酶1,线粒体 RAF1 (C-Raf)与CPS1交互。 绑定 12620389
CPS1 - - - - - - carbamoyl-phosphate合成酶1,线粒体 C-RAF与CPS1交互。 绑定 12620389
DMPK DM | DM1 | DM1PK | DMK | MDPK | MT-PK 营养不良myotonica-protein激酶 - - - - - - HPRD 10869570
EFEMP1 DHRD | DRAD | FBLN3 | FBNL | FLJ35535 | MGC111353 | MLVT | MTLV | S1-5 EGF-containing fibulin-like细胞外基质蛋白1 RAF1 (C-Raf)与一个未指明的同种型的EFEMP1 (FBNL)。 绑定 12620389
时代 HRAS2 | HRASP | MGC126691 | MGC126693 ES细胞表达拉 亲和力Capture-Western BioGRID 12774123
菲英岛 MGC45350 |背景下| SYN 菲英岛相关癌基因SRC, FGR,是的 - - - - - - HPRD, BioGRID 7517401
GNB2 - - - - - - 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 亲和力Capture-Western BioGRID 7782277
GNG4 DKFZp547K1018 | FLJ23803 | FLJ34187 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白)、γ4 - - - - - - HPRD, BioGRID 7782277
GRB10 GRB-IR | Grb-10 | IRBP | KIAA0207 | MEG1 | RSS 生长因子receptor-bound蛋白10 - - - - - - HPRD, BioGRID 9553107|10585452
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 - - - - - - HPRD 8530446|8911690
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 hra与英国皇家空军。这种交互是仿照hra和英国皇家空军之间的互动,都从一个未指明的物种。 绑定 15705808
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 英国皇家空军与Ras。这种交互是模仿人类的英国皇家空军和老鼠拉之间的相互作用。 绑定 11585923
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 RAF1 (C-Raf)与极品(Ha-Ras)。 绑定 12620389
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 Raf-1与Ras。 绑定 15664191
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 C-RAF与Ha-Ras交互。 绑定 12620389
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 英国皇家空军与Ras。这种交互建模在皇家空军之间的相互作用和一个未指明的来源和人类的Ras。 绑定 7523381|8307946
极品 C-BAS / | C-H-RAS | C-HA-RAS1 | CTLO | H-RASIDX | HAMSV | HRAS1 k - ras基因| | n - | RASH1 v-Ha-ras哈维鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 7862125|7969158
|8530446|8628317
|9150145|9154803
|9523700|10369681
|10783161|10882715
|10922060|12379659
|12620389|14654780
|14724584|15031288
|16803888
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89一半寿命| | LAP2 热休克蛋白90 kdaα(胞质),类成员1 Raf-1与一半。这种交互是仿照人类Raf-1之间的交互和猴子一半。 绑定 15618521
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89一半寿命| | LAP2 热休克蛋白90 kdaα(胞质),类成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 8408024
INSR CD220 | HHF5 胰岛素受体 - - - - - - HPRD 11409918
JAK1 JAK1A | JAK1B | JTK3 Janus激酶1(一种蛋白质酪氨酸激酶) - - - - - - HPRD, BioGRID 9446616
JAK2 JTK10 Janus激酶2(一种蛋白质酪氨酸激酶) - - - - - - HPRD, BioGRID 8876196
喀斯特 C-K-RAS | K-RAS2A | K-RAS2B | K-RAS4A | K-RAS4B | KI-RAS | KRAS1 | KRAS2 | NS3 | RASK2 v-Ki-ras2 Kirsten鼠肉瘤病毒致癌基因相同器官 亲和力Capture-Western
2台混合动力		 BioGRID 10783161|10882715
KSR2 FLJ25965 激酶抑制ras 2 - - - - - - HPRD 12975377
LCK YT16 | p56lck | pp58lck lymphocyte-specific蛋白质酪氨酸激酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 8939988
LRPAP1 A2MRAP | A2RAP | HBP44 | MGC138272 | MRAP |说唱 低密度脂蛋白受体相关蛋白相关蛋白1 2台混合动力 BioGRID 10783161
MAP2K1 MAPKK1 | MEK1 | MKK1 | PRKMK1 增殖蛋白激酶激酶1 重新组成复杂 BioGRID 10757792
MAP2K1 MAPKK1 | MEK1 | MKK1 | PRKMK1 增殖蛋白激酶激酶1 英国皇家空军的互动以及磷酸化Mek1 绑定 14724641
MAP2K1 MAPKK1 | MEK1 | MKK1 | PRKMK1 增殖蛋白激酶激酶1 MEK1互动以及由Raf-1磷酸化。这种交互是仿照人类MEK1之间的交互和Raf-1从一个未指明的物种。 绑定 15866172
MAP2K1 MAPKK1 | MEK1 | MKK1 | PRKMK1 增殖蛋白激酶激酶1 MEK1与c-Raf 绑定 8621729
MAP2K1 MAPKK1 | MEK1 | MKK1 | PRKMK1 增殖蛋白激酶激酶1 - - - - - - HPRD 11604401
MAP2K2 FLJ26075 | MAPKK2 | MEK2 | MKK2 | PRKMK2 增殖蛋白激酶激酶2 英国皇家空军与Mek2交互。 绑定 14724641
MAP3K1 MAPKKK1 | MEKK | MEKK1 增殖蛋白激酶激酶激酶1 MEKK1与Raf-1交互。 绑定 10969079
MAP3K1 MAPKKK1 | MEKK | MEKK1 增殖蛋白激酶激酶激酶1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 10969079
MAP3K5 ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 增殖蛋白激酶激酶激酶5 - - - - - - HPRD, BioGRID 11427728
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk 增殖蛋白激酶1 亲和力Capture-Western BioGRID 11409918
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk 增殖蛋白激酶1 Raf-1与ERK2交互。这种交互是仿照人类Raf-1之间的交互和ERK2从一个未指明的物种。 绑定 15664191
MAPK3 ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 增殖蛋白激酶3 亲和力Capture-Western BioGRID 11409918
MAPK7 BMK1 | ERK4 | ERK5 | PRKM7 增殖蛋白激酶7 - - - - - - HPRD, BioGRID 10531364
MAPK8IP3 DKFZp762N1113 | FLJ00027 | JIP3 | JSAP1 | KIAA1066 | SYD2 增殖蛋白激酶8相互作用蛋白质3 - - - - - - HPRD, BioGRID 10523642|11044439
MAPK8IP3 DKFZp762N1113 | FLJ00027 | JIP3 | JSAP1 | KIAA1066 | SYD2 增殖蛋白激酶8相互作用蛋白质3 - - - - - - HPRD 11044439
mra FLJ42964 | M-RAs | R-RAS3 | RRAS3 肌肉RAS致癌基因相同器官 - - - - - - HPRD, BioGRID 10498616
MYC bHLHe39 |原癌基因 v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 9315742
NR3C1 GCCR | GCR | GR | GRL 核受体亚科3 C组,成员1(糖皮质激素受体) - - - - - - HPRD, BioGRID 11005817
国家管制当局方面 ALPS4 | n - | NRAS1 神经母细胞瘤RAS病毒致癌基因相同器官(v-ras) 国家管制当局方面与英国皇家空军。这种交互是仿照国家管制当局方面和英国皇家空军之间的互动,都从一个未指明的物种。 绑定 15705808
国家管制当局方面 ALPS4 | n - | NRAS1 神经母细胞瘤RAS病毒致癌基因相同器官(v-ras) 亲和力Capture-Western BioGRID 10882715
NUDT14 UGPP | UGPPase nudix(核苷二磷酸与一部分X)类型主题14 RAF1 (C-Raf)与NUDT14 (hA21)。 绑定 12620389
OIP5 5730547 n13rik | LINT-25 | MIS18beta Opa相互作用蛋白5 2台混合动力 BioGRID 12620389
OIP5 5730547 n13rik | LINT-25 | MIS18beta Opa相互作用蛋白5 C-RAF与OIP5交互。 绑定 12620389
OIP5 5730547 n13rik | LINT-25 | MIS18beta Opa相互作用蛋白5 RAF1 (C-Raf)与OIP5 (hC73)。 绑定 12620389
PAK1 MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha p21蛋白(Cdc42 / Rac)活化激酶1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11733498
PBK FLJ14385 | Nori-3 | SPK | TOPK PDZ绑定激酶 RAF1 (C-Raf)与PBK (TOPK)。 绑定 12620389
PDGFRB CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 血小板源生长因子受体β多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 2475255
PEBP1 HCNP | PBP | PEBP | RKIP 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 - - - - - - HPRD 11853019
PEBP1 HCNP | PBP | PEBP | RKIP 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 RKIP与Raf-1交互。之间的交互是仿照了交互RKIP从物种和Raf-1不详不详的物种。 绑定 14654844
PEBP1 HCNP | PBP | PEBP | RKIP 磷脂酰乙醇胺结合蛋白1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 10757792
PEBP4 CORK-1 | CORK1 | GWTM1933 | MGC22776 | PRO4408 phosphatidylethanolamine-binding蛋白4 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 15302887
PEBP4 CORK-1 | CORK1 | GWTM1933 | MGC22776 | PRO4408 phosphatidylethanolamine-binding蛋白4 hPEBP4与Raf-1交互。这种交互是仿照人类hPEBP4和鼠标Raf-1证明之间的交互。 绑定 15302887
PEX5L PEX5R | PXR2 | PXR2B 过氧化物酶病生物起源因素五喜欢 - - - - - - HPRD 15302887
的PHB PHB1 prohibitin - - - - - - HPRD, BioGRID 10523633
的PHB PHB1 prohibitin RAF1 c-Raf PHB与。 绑定 16041367
PHKA2 GSD9A | MGC133071 | PHK | PYK | PYKL | XLG | XLG2 磷酸化酶激酶,α2(肝脏) 2台混合动力 BioGRID 12620389
PIN1 国防部| UBL5 peptidylprolyl cis /反式异构酶,NIMA-interacting 1 Raf-1与Pin1交互。这种交互是模仿了人类Raf-1和相互作用Pin1从猴子和未指明的物种。 绑定 15664191
PKM2 CTHBP | MGC3932 | OIP3 | PK3 | PKM | TCB | THBP1 丙酮酸激酶、肌肉 - - - - - - HPRD 12620389
PKM2 CTHBP | MGC3932 | OIP3 | PK3 | PKM | TCB | THBP1 丙酮酸激酶、肌肉 C-RAF与PyK交互。 绑定 12620389
PKM2 CTHBP | MGC3932 | OIP3 | PK3 | PKM | TCB | THBP1 丙酮酸激酶、肌肉 RAF1 (C-Raf)与PKM2 (PyK)。 绑定 12620389
PPP2R2A B55-ALPHA | B55A | FLJ26613 | MGC52248 | PR52A | PR55A 蛋白磷酸酶2(原2 a),调节亚基B,α同种型 RAF1 (c-Raf)与同种型不详PPP2R2A (PP2A-A)。 绑定 16041367
PPP2R2B B55-BETA | FLJ95686 | MGC24888 | PP2A-B55BETA | PP2A-PR55B | PP2AB-BETA | PP2APR55-BETA | PR2AB-BETA | PR2AB55-BETA | PR2APR55-BETA | PR52B | PR55-BETA | SCA12 蛋白磷酸酶2(原2 a),调节亚基,β同种型 RAF1 (c-Raf)与一个未指明的同种型的PPP2R2B (PP2A-B)。 绑定 16041367
PPP2R2C B55-GAMMA | IMYPNO | IMYPNO1 | MGC33570 | PR52 | PR55G 蛋白磷酸酶2(原2 a),调节亚基B,伽马同种型 RAF1 (c-Raf)与一个未指明的同种型的PPP2R2C (PP2A-C)。 绑定 16041367
PRKCE MGC125656 | MGC125657 | PKCE | nPKC-epsilon 蛋白激酶C,ε - - - - - - HPRD, BioGRID 11350735
PRKCZ PKC-ZETA | PKC2 蛋白激酶C,ζ - - - - - - HPRD, BioGRID 10620507
PRKG1 CGKI | DKFZp686K042 | FLJ36117 | MGC71944 | PGK | PKG | PRKG1B | PRKGR1B | cGKI-BETA | cGKI-alpha 蛋白激酶、cGMP-dependent I型 亲和力Capture-Western BioGRID 12237340
PRPF6 蚂蚁1 | C20orf14汤姆| | u5 - 102 k | hPrp6 PRP6 pre-mRNA处理因素6同族体(酵母) 2台混合动力 BioGRID 10848612
RAP1A KREV-1 | KREV1 | RAP1 | SMGP21 RAP1A, RAS致癌基因家族的成员 Co-crystal结构
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 7791872|7862125
|9867809|10454553
RAP1A KREV-1 | KREV1 | RAP1 | SMGP21 RAP1A, RAS致癌基因家族的成员 - - - - - - HPRD 7791872 | 7791872 | 7791872
RAP2A K-REV | KREV | RAP2 | RbBP-30 RAP2A, RAS致癌基因家族的成员 Raf-1与Rap2交互。这种交互建模在演示从不明物种和人类Rap2 Raf-1之间的相互作用。 绑定 15752761
RASD2 德国:4834 | rh | TEM2 RASD家族,成员2 重新组成复杂 BioGRID 14724584
RB1 OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 成视网膜细胞瘤1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9819434
RB1 OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 成视网膜细胞瘤1 Raf-1与Rb交互。 绑定 9819434
RBL2 FLJ26459 | P130 |而已 retinoblastoma-like 2 (p130) Raf-1与p130交互。 绑定 9819434
RBL2 FLJ26459 | P130 |而已 retinoblastoma-like 2 (p130) - - - - - - HPRD, BioGRID 9819434
RHEB MGC111559 | RHEB2 Ras同族体丰富大脑 - - - - - - HPRD, BioGRID 9001246
RHEB MGC111559 | RHEB2 Ras同族体丰富大脑 英国皇家空军与Rheb交互。 绑定 15854902
rp6 - 213 h19.1 面具| MST4 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶MST4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11306563
基本 - - - - - - RAS相关病毒致癌基因相同器官(r-ras) 2台混合动力 BioGRID 10848612
RRAS2 TC21 RAS相关病毒(r-ras)致癌基因同族体2 RAF1 (C-Raf)与RRAS2 (R-Ras)。 绑定 12620389
RRAS2 TC21 RAS相关病毒(r-ras)致癌基因同族体2 重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 10557073|10783161
RRAS2 TC21 RAS相关病毒(r-ras)致癌基因同族体2 - - - - - - HPRD 10064593
SFN YWHAS stratifin 亲和力Capture-MS BioGRID 15778465
SHOC2 FLJ60412 | KIAA0862 | SIAA0862 | SOC-2 | SOC2 | SUR-8 | SUR8 soc-2抑制清晰的相同器官(秀丽隐杆线虫) - - - - - - HPRD, BioGRID 10783161
SPRY2 MGC23039 | hSPRY2 sprouty同族体2(果蝇) 亲和力Capture-Western BioGRID 12717443
SPRY4 - - - - - - sprouty同族体4(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 12717443
SRC c - src ASV | SRC1 | | p60-Src v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 7517401
STK3 FLJ90748 | KRS1 | MST2 丝氨酸/苏氨酸激酶3 (STE20同系物、酵母) Raf-1与MST2交互。这种交互是仿照人类猴和Raf-1 MST2证明之间的交互。 绑定 15618521
TIMM50 MGC102733 | TIM50 | TIM50L 移位酶内线粒体膜50同族体(酵母) C-RAF与TIMM50交互。 绑定 12620389
TIMM50 MGC102733 | TIM50 | TIM50L 移位酶内线粒体膜50同族体(酵母) RAF1 (C-Raf)与TIMM50 (hC22)。 绑定 12620389
TSC22D3 浸| DKFZp313A1123 | DSIPI | GILZ | TSC-22R | hDIP TSC22域家族,成员3 - - - - - - HPRD, BioGRID 12391160
UBE2D2 E2 (17) KB2 | PUBC1 | UBC4 | UBC4/5 | UBCH5B ubiquitin-conjugating酶E2D 2 (UBC4/5同系物、酵母) 生化活动 BioGRID 11676916
VAV1 变风量空调 变风量空调1鸟嘌呤核苷酸交换因子 - - - - - - HPRD, BioGRID 8900182
VDAC1 MGC111064 |孔蛋白| PORIN-31-HL 压敏电阻器阴离子通道1 亲和力Capture-Western BioGRID 12079506
YWHAB GW128 | HS1 | KCIP-1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,β多肽 C-RAF与14-3-3-beta交互。 绑定 12620389
YWHAB GW128 | HS1 | KCIP-1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,β多肽 - - - - - - HPRD 8702721|12360521
YWHAB GW128 | HS1 | KCIP-1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,β多肽 RAF1 (C-Raf)与YWHAB (14-3-3-beta)。 绑定 12620389
YWHAB GW128 | HS1 | KCIP-1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,β多肽 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力		 BioGRID 8702721|10620507
|10848612|12360521
|12620389
YWHAE 14-3-3E | FLJ45465 | KCIP-1 | MDCR | MDS 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,ε多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 7644510
YWHAE 14-3-3E | FLJ45465 | KCIP-1 | MDCR | MDS 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,ε多肽 14-3-3-epsilon与Raf-1交互。 绑定 7644510
YWHAG 14-3-3GAMMA 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、伽马多肽 - - - - - - HPRD 8702721|10433554
YWHAG 14-3-3GAMMA 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、伽马多肽 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western		 BioGRID 10433554|10620507
|17353931
YWHAH YWHA1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,埃塔多肽 - - - - - - HPRD, BioGRID 8702721
YWHAQ 14-3-3 | 1 c5 | HS1 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,θ多肽 亲和力Capture-MS
亲和力Capture-Western
西部
重新组成复杂		 BioGRID 8663231|10620507
|10757792|17353931
YWHAZ KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、ζ多肽 Raf-1与14-3-3ζ。这种交互是仿照人类Raf-1和小鼠14-3-3-zeta证明之间的交互。 绑定 7559537
YWHAZ KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、ζ多肽 亲和力Capture-Western
重新组成复杂		 BioGRID 7628630|9261098
|10620507|10887173
YWHAZ KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、ζ多肽 - - - - - - HPRD 7628630|7939632


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG MAPK信号通路 267年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG ERBB信号通路 87年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG趋化因子信号通路 190年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG血管平滑肌收缩 115年 81年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG VEGF信号通路 76年 53 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG粘着斑 201年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG缝隙连接 90年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG自然杀手细胞介导的细胞毒性 137年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG T细胞受体信号通路 108年 89年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG B细胞受体信号通路 75年 56 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG FCεRI信号通路 79年 58 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG FCγR介导的吞噬作用 97年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG长期势差现象 70年 57 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG生成信号通路 126年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG长期萧条 70年 53 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG调节肌动蛋白细胞骨架 216年 144年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG胰岛素信号通路 137年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG促性腺激素信号通路 101年 77年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG孕激素介导的卵母细胞成熟 86年 59 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG杀菌作用 102年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG通路在癌症 328年 259年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG结肠直肠癌 62年 47 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG肾细胞癌 70年 60 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG胰腺癌 70年 56 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG子宫内膜癌 52 45 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG神经胶质瘤 65年 56 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG前列腺癌 89年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG黑色素瘤 71年 57 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG膀胱癌 42 33 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG慢性骨髓性白血病 73年 59 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG急性髓系白血病 60 47 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG非小细胞肺癌 54 47 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA AT1R通路 36 28 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA SPPA通路 22 18 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA BCR通路 37 28 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA BIOPEPTIDES通路 45 35 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CDMAC通路 16 15 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CCR3通路 23 21 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA神经酰胺通路 22 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA趋化因子受体CXCR4通路 24 22 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA EGF通路 31日 25 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA EPO通路 19 13 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA ECM通路 24 17 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA ERK通路 28 22 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA FCER1通路 41 30. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA FMLP通路 39 29日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA GH通路 28 22 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IGF1通路 21 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IL2通路 22 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IL3通路 15 11 所有SZGR 2.0基因通路
白细胞介素6 BIOCARTA通路 22 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IL2RB通路 38 26 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RACCYCD通路 26 23 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA格列卫通路 23 17 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA胰岛素通路 22 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA整合素途径 38 29日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA角化细胞通路 46 38 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PYK2通路 31日 24 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA MAPK通路 87年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IGF1R通路 23 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA神经生长因子通路 18 13 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NFAT通路 56 45 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PDGF通路 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CDK5通路 11 11 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RAS途径 23 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA HER2通路 22 17 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA MAL通路 19 17 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA巴尔MAPK通路 12 11 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA BARRESTIN SRC通路 15 14 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA满足途径 37 30. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA GPCR通路 37 31日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA敏捷的途径 18 15 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA细胞通路 49 37 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA传真照片路径 24 17 所有SZGR 2.0基因通路
圣GA12通路 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
圣克ALPHA通道 16 11 所有SZGR 2.0基因通路
圣Gα我途径 35 29日 所有SZGR 2.0基因通路
SIG IL4RECEPTOR LYPHOCYTES在B 27 23 所有SZGR 2.0基因通路
圣肾上腺素能 36 29日 所有SZGR 2.0基因通路
圣整合素信号通路 82年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
心肌细胞动作电位团体胰岛素受体途径 51 41 所有SZGR 2.0基因通路
ST T细胞信号转导 45 33 所有SZGR 2.0基因通路
SIG BCR信号通路 46 38 所有SZGR 2.0基因通路
圣B细胞抗原受体 40 32 所有SZGR 2.0基因通路
PID FCER1通路 62年 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID内皮素途径 63年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID BCR 5通路 65年 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID GMCSF通路 37 31日 所有SZGR 2.0基因通路
PID满足途径 80年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID CDC42通路 70年 51 所有SZGR 2.0基因通路
PID SHP2通路 58 46 所有SZGR 2.0基因通路
PID MTOR 4通道 69年 55 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL2 1通路 55 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID IGF1通路 30. 23 所有SZGR 2.0基因通路
PID TCR RAS途径 14 14 所有SZGR 2.0基因通路
PID神经酰胺通路 48 37 所有SZGR 2.0基因通路
PID ERBB1下游通路 105年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
PID ERBB2 ERBB3通路 44 35 所有SZGR 2.0基因通路
PID PDGFRB通路 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PID P38 MK2型通路 21 19 所有SZGR 2.0基因通路
PID AR NONGENOMIC通路 31日 27 所有SZGR 2.0基因通路
PID ERBB1内化途径 41 35 所有SZGR 2.0基因通路
PID CXCR3通路 43 34 所有SZGR 2.0基因通路
PID工具包通路 52 40 所有SZGR 2.0基因通路
PID VEGFR1 2通道 69年 57 所有SZGR 2.0基因通路
PID PI3KCI AKT通路 35 30. 所有SZGR 2.0基因通路
PID MAPK TRK通路 34 31日 所有SZGR 2.0基因通路
PID CD8细胞受体下游通路 65年 56 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
PID FAK通路 59 45 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
通过自洽场工具包REACTOME信号 78年 59 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
由ERBB4 REACTOME信号 90年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
由ERBB2 REACTOME信号 101年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GRB2 ERBB2事件信号 22 20. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME表皮生长因子受体信号的癌症 109年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME SHC1 ERBB4事件信号 20. 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME胰岛素受体信号级联 87年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME武器介导的激活 17 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME长期ERK激活事件 19 18 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号来拉 27 23 所有SZGR 2.0基因通路
从质膜通过TRKA REACTOME神经生长因子信号 137年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME对erk信号 36 30. 所有SZGR 2.0基因通路
FGFR REACTOME信号的疾病 127年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
P38通过放射免疫和RIN REACTOME信号 15 14 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME胃泌激素分子通过PKC和MAPK信号通路 205年 136年 所有SZGR 2.0基因通路
表皮生长因子受体信号REACTOME SHC1事件 15 13 所有SZGR 2.0基因通路
在化学突触REACTOME传输 186年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经系统 279年 221年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME GPCR信号的 920年 449年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME神经递质受体结合和下游传播的突触后细胞 137年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
由PDGF REACTOME信号 122年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME下游信号转导 95年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME轴突引导 251年 188年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NCAM信号对神经突生长 64年 49 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME激活谷氨酸NMDA受体在绑定和突触后的事件 37 32 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME磷酸化分子通过RAS的激活 27 23 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NMDA受体激活后的事件 33 28 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME FRS2介导的级联 36 27 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME FGFR下游信号激活 One hundred. 74年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号的盲降 107年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RAP1信号 17 12 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME IL 2的信号 41 34 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME通过胰岛素受体信号 108年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME SOS介导的信号 14 13 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RAF MAP激酶级联 10 10 所有SZGR 2.0基因通路
人体自燃现象REACTOME介导的信号 15 12 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME适应性免疫系统 539年 350年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞因子在免疫系统信号 270年 204年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME血小板激活信号和聚合 208年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
由FGFR REACTOME信号 112年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
人体自燃现象REACTOME相关事件 17 13 所有SZGR 2.0基因通路
刘SOX4 DN的目标 309年 191年 所有SZGR 2.0基因通路
ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN 526年 357年 所有SZGR 2.0基因通路
BORCZUK恶性间皮瘤起来 305年 185年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌2小时DN 88年 53 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群3 329年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
OUELLET卵巢癌浸润性对LMP 117年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
巴里斯甲状腺癌DN 59 45 所有SZGR 2.0基因通路
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN 800年 473年 所有SZGR 2.0基因通路
GRUETZMANN胰腺癌DN 203年 134年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
TAGHAVI肿瘤转变 12 10 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2目标了 424年 268年 所有SZGR 2.0基因通路
唱转移基质上 110年 70年 所有SZGR 2.0基因通路
与IL5 BYSTROEM相关 51 30. 所有SZGR 2.0基因通路
THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN 225年 163年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 225年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
SESTO应对紫外线C2 54 39 所有SZGR 2.0基因通路
霁应对FSH DN 58 43 所有SZGR 2.0基因通路
麦地那SMARCA4目标 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
外邦人集群D5紫外线反应 39 26 所有SZGR 2.0基因通路
外邦人紫外线高剂量DN 312年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
FIRESTEIN扩散 175年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
研究人类MITODB 6 2002 429年 260年 所有SZGR 2.0基因通路
研究线粒体 447年 277年 所有SZGR 2.0基因通路
CHAUHAN应对METHOXYESTRADIOL DN 102年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
BRUNEAU分隔作用心室 10 8 所有SZGR 2.0基因通路
PHESSE APC和MBD2的目标 20. 14 所有SZGR 2.0基因通路
HG TERAO AOX4目标 28 20. 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 124.1 139年 145年 1 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-19 461年 468年 1、m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir - 331 27 34 1、m8 hsa - mir - 331大脑 GCCCCUGGGCCUAUCCUAGAA
mir - 503 108年 114年 1 hsa - mir - 503 UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG
miR-7 674年 681年 1、m8 hsa-miR-7深圳 UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG