基因页:ENPP5
概括?
基因 | 59084 |
象征 | ENPP5 |
同义词 | NPP-5 |
描述 | 纤维纤维肽焦磷酸酶/磷酸二酯酶5(推定) |
参考 | HGNC:HGNC:13717|Ensembl:ENSG00000112796|HPRD:13272|Vega:Otthumg0000000014781 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6P21.1-P11.2 |
Pascal P值 | 0.009 |
Sherlock P值 | 0.285 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.04433 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS9472701 | CHR6 | 46116448 | ENPP5 | 59084 | 0.12 | 顺式 | ||
RS2223776 | CHR6 | 46145460 | ENPP5 | 59084 | 0.17 | 顺式 | ||
RS7153322 | CHR14 | 55584613 | ENPP5 | 59084 | 0.2 | 反式 | ||
RS17128262 | CHR14 | 55619767 | ENPP5 | 59084 | 0.2 | 反式 | ||
RS10144869 | CHR14 | 55726091 | ENPP5 | 59084 | 0.04 | 反式 | ||
RS10135891 | CHR14 | 55862955 | ENPP5 | 59084 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ENPP5_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
numbl | 0.93 | 0.94 |
FAM160A2 | 0.89 | 0.90 |
McOLN1 | 0.88 | 0.88 |
SLC45A1 | 0.87 | 0.88 |
sema4f | 0.87 | 0.89 |
SH2D3C | 0.86 | 0.90 |
RTN4RL1 | 0.86 | 0.91 |
LRFN3 | 0.86 | 0.88 |
AGPAT1 | 0.86 | 0.88 |
CADM3 | 0.86 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AP002478.3 | -0.64 | -0.69 |
AL139819.3 | -0.64 | -0.68 |
AF347015.21 | -0.63 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.62 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.61 |
鼻孔 | -0.61 | -0.65 |
AF347015.33 | -0.61 | -0.59 |
AF347015.8 | -0.61 | -0.62 |
GNG11 | -0.60 | -0.68 |
mt-cyb | -0.60 | -0.60 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质 | 450 | 256 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗DN | 230 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的肌肉 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ivanovska mir106b目标 | 90 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kohoutek CCNT1目标 | 50 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-130/301 | 295 | 302 | 1A,M8 | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 365 | 372 | 1A,M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-19 | 294 | 300 | M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga |