基因页:拉普斯
概括?
基因 | 5913 |
象征 | 拉普斯 |
同义词 | CMS11 | CMS4C | FADS | RAPSYN | RNF205 |
描述 | 受体相关的突触蛋白 |
参考 | MIM:601592|HGNC:HGNC:9863|Ensembl:ENSG00000165917|HPRD:03353|Vega:Otthumg00000166891 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P11.2 |
Pascal P值 | 0.026 |
耶和华 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RAPSN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0033130 | 乙酰胆碱受体结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | tas | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 8812503 |
细胞成分 | 去学期 | 证据 | 神经关键词 | PubMed ID |
GO:0031594 | 神经肌肉接头 | IEA | 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:3) | - |
去:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta AGR途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ACH途径 | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤DN | 45 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙槽横纹肌肉瘤上升 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-142-5p | 181 | 187 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |