概括
基因 5913
象征 拉普斯
同义词 CMS11 | CMS4C | FADS | RAPSYN | RNF205
描述 受体相关的突触蛋白
参考 MIM:601592|HGNC:HGNC:9863|Ensembl:ENSG00000165917|HPRD:03353|Vega:Otthumg00000166891
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P11.2
Pascal P值 0.026
耶和华

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0033130 乙酰胆碱受体结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
去:0007268 突触传输 tas 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 8812503
细胞成分 去学期 证据 神经关键词 PubMed ID
GO:0031594 神经肌肉接头 IEA 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:3) -
去:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
Biocarta AGR途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ACH途径 16 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL与卵泡淋巴瘤DN 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙槽横纹肌肉瘤上升 98 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
coates巨噬细胞M1 vs M2向上 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 181 187 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac