基因页面:RARB
总结吗?
| GeneID | 5915年 |
| 象征 | RARB |
| 同义词 | HAP | MCOPS12 | NR1B2 | RRB2 |
| 描述 | 视黄酸受体β |
| 参考 | MIM: 180220|HGNC: HGNC: 9865|运用:ENSG00000077092|HPRD: 07183|织女:OTTHUMG00000130480 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 p24.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.007 |
| 胎儿β | -3.078 |
| eGene | 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NUDT1 | 0.75 | 0.56 |
| MED30 | 0.72 | 0.56 |
| H2AFY2 | 0.72 | 0.44 |
| HAUS1 | 0.71 | 0.58 |
| LEMD1 | 0.71 | 0.50 |
| HAUS4 | 0.71 | 0.63 |
| DCAF13 | 0.71 | 0.45 |
| C17orf45 | 0.70 | 0.58 |
| TMSB10 | 0.70 | 0.56 |
| RUVBL1 | 0.70 | 0.51 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CCNI2 | -0.42 | -0.55 |
| RAPGEF4 | -0.42 | -0.60 |
| PK4P | -0.42 | -0.55 |
| OSBPL1A | -0.41 | -0.60 |
| ASPHD1 | -0.41 | -0.47 |
| COBL | -0.41 | -0.61 |
| GAS2L1 | -0.41 | -0.47 |
| EPB49 | -0.41 | -0.51 |
| SPARCL1 | -0.41 | -0.51 |
| BCL2L2 | -0.41 | -0.56 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003700 | 转录因子的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003707 | 类固醇激素受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003708 | 视黄酸受体的活动 | 艾达 | 2177841 | |
| 去:0003708 | 视黄酸受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003708 | 视黄酸受体的活动 | 助教 | 2833708 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 艾达 | 2177841 | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 2833708 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005575 | cellular_component | ND | - - - - - - | |
| 去:0005634 | 核 | 艾达 | 2177841 | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG通路在癌症 | 328年 | 259年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG小细胞肺癌 | 84年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG非小细胞肺癌 | 54 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID RXR VDR通路 | 26 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID视黄酸途径 | 30. | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WT1 ZIRN维甲酸反应 | 23 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZIRN维甲酸反应了 | 21 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 标志着HDAC目标了 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 | 207年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 压抑的徐HGF目标AKT1 DN | 95年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐AKT1目标48小时 | 9 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 欧姆甲基化在成人癌症 | 27 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胚胎癌DN欧姆 | 8 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好VS适度 | 109年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC和上述目标 | 230年 | 156年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 在APL NOUZOVA甲基化 | 68年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NOUZOVA维甲酸和H4乙酰化作用 | 143年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃晚期造血祖 | 544年 | 307年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HNE和《魏盖尔氧化应激 | 60 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREIRA应对TSA DN | 18 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 亚砷酸YIH应对C3 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LOPES甲基化在结肠癌 | 27 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤前列腺癌HCP H3K27ME3 | 97年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 霍克甲基化在癌症 | 56 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK精母细胞 | 72年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHARMA PILOCYTIC星形细胞瘤的位置 | 25 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李前列腺癌表观遗传 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类DN | 210年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝脏发展起来 | 166年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 卡MIR302A目标 | 77年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KATSANOU ELAVL1目标了 | 169年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PLASARI TGFB1目标10人力资源DN | 244年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 德拉克洛瓦RARG绑定MEF | 367年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 德拉克洛瓦RAR目标了 | 48 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 德拉克洛瓦RAR绑定西文 | 462年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-1/206 | 22 | 28 | m8 | hsa-miR-1 | UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA |
| hsa - mir - 206深圳 | UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG | ||||
| hsa - mir - 613 | AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC | ||||
| mir - 101 | 362年 | 368年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| miR-130/301 | 664年 | 670年 | 1 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
| hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
| hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
| hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
| mir - 133 | 121年 | 127年 | 1 | hsa - mir - 133 a | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU |
| hsa - mir - 133 b | UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA | ||||
| mir - 135 | 879年 | 885年 | m8 | hsa - mir - 135 a | UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA |
| hsa - mir - 135 b | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| miR-141/200a | 850年 | 857年 | 1、m8 | hsa - mir - 141 | UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG |
| hsa - mir - 200 a | UAACACUGUCUGGUAACGAUGU | ||||
| mir - 144 | 1257年 | 1263年 | m8 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG | ||||
| mir - 146 | 1135年 | 1142年 | 1、m8 | hsa - mir - 146 a | UGAGAACUGAAUUCCAUGGGUU |
| hsa - mir - 146 b大脑 | UGAGAACUGAAUUCCAUAGGCU | ||||
| miR-15/16/195/424/497 | 78年 | 84年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 743年 | 749年 | 1 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
| hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
| hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
| hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
| hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
| mir - 203.1 | 213年 | 219年 | 1 | hsa - mir - 203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| miR-29 | 373年 | 379年 | m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| miR-30-3p | 95年 | 102年 | 1、m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| miR-30-5p | 864年 | 870年 | m8 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
| hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
| hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
| hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
| miR-34/449 | 697年 | 703年 | 1 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
| hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
| hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
| hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
| mir - 376 c | 1246年 | 1252年 | m8 | hsa - mir - 376 c | AACAUAGAGGAAAUUCCACG |