基因页面:rar

总结吗?
GeneID 5917年
象征 rar
同义词 ArgRS | DALRD1 | HLD9
描述 arginyl-tRNA合成酶
参考 MIM: 107820|HGNC: HGNC: 9870|运用:ENSG00000113643|HPRD: 00142|织女:OTTHUMG00000130411
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q35.1
帕斯卡假定值 0.104
夏洛克假定值 0.569
DMG 1(#研究)
eGene 小脑半球
元

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.0276
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
rar chr5 167921598 一个 G NM_002887 。 沉默 精神分裂症 认为:Gulsuner_2013

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg24309730 5 167913298 rar 4.77 e-11 -0.017 3.89 e - DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF488 0.63 0.64
RIN1 0.62 0.58
KCNG2 0.62 0.52
VWA5B2 0.61 0.59
TNFRSF14 0.60 0.59
HIPK4 0.60 0.61
GLIS1 0.60 0.55
RHPN1 0.59 0.56
KCNH3 0.59 0.58
AGFG2 0.58 0.58
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM36A -0.41 -0.43
RBMX2 -0.40 -0.49
IDH1 -0.40 -0.41
TUBB2B -0.40 -0.41
YBX1 -0.39 -0.44
C11orf57 -0.39 -0.48
KIAA1949 -0.39 -0.39
FNBP1L -0.39 -0.37
RP9 -0.39 -0.48
GTF3C6 -0.39 -0.44

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 17353931
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0004814 arginine-tRNA连接酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0016874 连接酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006420 arginyl-tRNA氨酰化 助教 7590355
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005625 可溶部分 助教 7590355
去:0005634 核 艾达 18029348
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 助教 7590355

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG氨酰生物合成 41 33 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME胞质TRNA氨酰化 24 19 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRNA氨酰化 42 34 所有SZGR 2.0基因通路
BERTUCCI髓与乳腺癌导管 206年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
GAZDA钻石BLACKFAN贫血红细胞DN 493年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
加里CD5 DN的目标 431年 263年 所有SZGR 2.0基因通路
BORCZUK恶性间皮瘤起来 305年 185年 所有SZGR 2.0基因通路
王CLIM2 DN的目标 186年 114年 所有SZGR 2.0基因通路
TIEN肠道益生菌24小时 557年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺癌分化不良 633年 376年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌 722年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
角化细胞DN ENK紫外线反应 485年 334年 所有SZGR 2.0基因通路
BERENJENO通过RHOA转换 536年 340年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652年 1023年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ELK3 DN严重缺氧 156年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ELK3和HIF1A严重缺氧 142年 104年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化和管理不善的DN 382年 224年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN 517年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞浆细胞VS PLASMABLAST DN 309年 206年 所有SZGR 2.0基因通路
NING慢性阻塞性肺疾病 157年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
彭雷帕霉素反应DN 245年 154年 所有SZGR 2.0基因通路
LEI MYB目标 318年 215年 所有SZGR 2.0基因通路
击倒老化肌肉DN 123年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
犹太人的紫外响应集群D7 40 21 所有SZGR 2.0基因通路
外邦人紫外线高剂量DN 312年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
萨莫拉NOS2 DN的目标 96年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
DN WELCSH BRCA1目标 141年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤了 294年 199年 所有SZGR 2.0基因通路
IRITANI MAD1 DN的目标 47 30. 所有SZGR 2.0基因通路
么时间响应黄体酮集群14 143年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
PILON KLF1目标了 504年 321年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 219 65年 71年 1 hsa - mir - 219大脑 UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU