基因页面:RB1
总结吗?
GeneID | 5925年 |
象征 | RB1 |
同义词 | OSRC | PPP1R130 | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 |
描述 | 成视网膜细胞瘤1 |
参考 | MIM: 614041|HGNC: HGNC: 9884|运用:ENSG00000139687|HPRD: 01574|织女:OTTHUMG00000016900 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 13 q14.2 |
帕斯卡假定值 | 0.02 |
胎儿β | 1.093 |
基因数据来源
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RB1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SNX32 | 0.51 | 0.60 |
TCEAL5 | 0.50 | 0.52 |
PDZD4 | 0.49 | 0.54 |
PPP1R9B | 0.48 | 0.51 |
KIFC2 | 0.48 | 0.53 |
TCAP | 0.48 | 0.46 |
JAKMIP1 | 0.48 | 0.53 |
CCDC64 | 0.46 | 0.54 |
OGFR | 0.46 | 0.47 |
SPEG | 0.46 | 0.52 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MYL12A | -0.36 | -0.44 |
AP002478.3 | -0.32 | -0.35 |
TM4SF1 | -0.31 | -0.30 |
GIMAP5 | -0.31 | -0.31 |
TTC38 | -0.31 | -0.30 |
MAPKAPK3 | -0.31 | -0.35 |
GJA4 | -0.31 | -0.32 |
ICAM2 | -0.31 | -0.32 |
C1orf54 | -0.30 | -0.35 |
CLDN5 | -0.30 | -0.35 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | molecular_function | ND | 3413073 | |
去:0003700 | 转录因子的活动 | 助教 | 3657987 | |
去:0003713 | 转录辅激活活动 | NAS | 15572661 | |
去:0008134 | 转录因子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016564 | 转录抑制因子活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0019900 | 激酶绑定 | 艾达 | 16286473 | |
去:0050681 | 雄激素受体结合 | NAS | 15572661 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0000075 | 细胞周期检查点 | 助教 | 10825186 | |
去:0000082 | 有丝分裂细胞周期G1 / S过渡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0000122 | 负调控RNA聚合酶II启动子的转录 | 助教 | 9491888 | |
去:0000279 | 有丝分裂期 | NAS | 7542657 | |
去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | NAS | 3413073 | |
去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006469 | 负调节蛋白激酶活性 | 新闻学会 | 9858607 | |
去:0007050 | 细胞周期阻滞 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008285 | 负调节细胞增殖 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016568 | 染色质修饰 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0051146 | 横纹肌细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0051318 | G1期 | 助教 | 7542657 | |
去:0051301 | 细胞分裂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030308 | 负调节细胞生长 | 助教 | 7542657 | |
去:0043353 | 阐明红细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0030521 | 雄激素受体信号通路 | NAS | 15572661 | |
去:0045651 | 积极调节巨噬细胞分化 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045944 | 积极的监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0045786 | 负调控细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043550 | 脂质调节激酶活性 | 艾达 | 16286473 | |
去:0044419 | 生物种间相互作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0000785 | 染色质 | 助教 | 3657987 | |
去:0005819 | 主轴 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | NAS | 3413073 | |
去:0005634 | 核 | 助教 | 3657987 | |
去:0005654 | 核浆 | 经验值 | 9190208|11931757|14527418 |
|
去:0005667 | 转录因子复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016605 | PML的身体 | 艾达 | 9448006 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AATF | CHE-1 | CHE1 | d | 细胞凋亡与转录因子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10783144|12450794 |
AATF | CHE-1 | CHE1 | d | 细胞凋亡与转录因子 | Che-1与Rb交互。 | 绑定 | 10783144 |
ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | - - - - - - | HPRD | 7828850|8242749 |
ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | Rb与c-Abl | 绑定 | 9632788 |
ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8242749 |
AHR | - - - - - - | 芳基碳氢化合物受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9712901 |
基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | Rb与基于“增大化现实”技术。 | 绑定 | 9675141 |
基于“增大化现实”技术 | AIS | DHTR | HUMARA | KD | NR3C4 | SBMA | SMAX1 |解冻 | 雄性激素受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9675141 |
ARID3B | BDP | DRIL2 | 在丰富的互动领域3 b(像) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10446990 |
ARID4A | RBBP1 | RBP-1 | RBP1 | 丰富的互动领域4 (RBP1-like) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10321733|10490602 |
ARNT | HIF-1beta | HIF1B | HIF1BETA |探戈| bHLHe2 | 芳基碳氢化合物核转运蛋白受体 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 9712901 |
ATF2 | CRE-BP1 | CREB2 | HB16 | MGC111558 | TREB7 | 激活转录因子2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 1641004 |
ATF2 | CRE-BP1 | CREB2 | HB16 | MGC111558 | TREB7 | 激活转录因子2 | Rb与ATF2交互。之间的交互是仿照了交互Rb从物种和ATF2不详不详的物种。 | 绑定 | 11566021 |
BAG1 | RAP46 | BCL2-associated athanogene | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12845674 |
BCR | 所有| bcr - abl1 | BCR1 | CML | D22S11 | D22S662 | FLJ16453 | PHL | 断点集群区域 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 9071815 |
BDP1 | DKFZp686C01233 | DKFZp686K0831 | HSA238520 | KIAA1241 | KIAA1689 | TAF3B1 | TFC5 | TFIIIB”| TFIIIB150 | TFIIIB90 | TFNR | B ' ' 1,亚基的RNA聚合酶III希望具有转录起始因素 | Rb与TFIIIB90 | 绑定 | 9169441 |
BGLAP | 边界网关协议| OC | PMF1 | 骨gamma-carboxyglutamate (gla)的蛋白质 | 复审委员会与OC启动子。 | 绑定 | 15949438 |
BIRC5 | API4 | EPR-1 | baculoviral IAP repeat-containing 5 | RB1(复审委员会)与BIRC5交互(存活素)启动子。 | 绑定 | 15271987 |
BNC2 | BSN2 | DKFZp686A01127 | FLJ20043 | FLJ34928 | basonuclin 2 | 复审委员会与BAA90908交互。 | 绑定 | 15949438 |
乳腺癌易感基因1 | 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 | 早发性乳腺癌 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10220405 |
乳腺癌易感基因1 | 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 | 早发性乳腺癌 | BRCA1与Rb交互。 | 绑定 | 10518542 |
BRD2 | D6S113E | DKFZp686N0336 | FLJ31942 | FSH | FSRG1 | KIAA9001 | NAT | RING3 | RNF3 | bromodomain包含2 | 复审委员会与BRD2启动子。 | 绑定 | 15949438 |
BRD8 | SMAP | SMAP2 | p120 | bromodomain包含8 | 复审委员会与BRD8启动子。 | 绑定 | 15949438 |
BRF1 | BRF | FLJ42674 | FLJ43034 | GTF3B | MGC105048 | TAF3B2 | TAF3C | TAFIII90 | TF3B90 | TFIIIB90 | hBRF | BRF1同族体,单元的RNA聚合酶III转录起始因子希望(酵母) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11997511 |
CASP10 | ALPS2 | FLICE2 | MCH4 | 半胱天冬酶10,apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP10 (caspase-10)劈开RB-1 (hRB) DSID共识网站产生2形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP2 | CASP-2 | ICH-1L | ICH-1L / 1 s | ICH1 | NEDD2 | 半胱天冬酶2,apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP2 (caspase-2)劈开RB-1 (hRB)死者共识网站p100形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP3 | CPP32 | CPP32B |本来 | 半胱天冬酶3 apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP3 (caspase-3)劈开RB-1 (hRB)死亡,DSID共识网站产生p100, 2、p61 p48形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP6 | MCH2 | 半胱天冬酶6 apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP6 (caspase-6)劈开RB-1 (hRB) DSID共识网站产生2形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP7 | CMH-1 | ICE-LAP3 | MCH3 | 半胱天冬酶7,apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP7 (caspase-7)劈开RB-1 (hRB)死亡,DSID共识网站产生2,p61和p48形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | |马赫MCH5 | MGC78473 | 半胱天冬酶8日apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP8 (caspase-8)劈开RB-1 (hRB) 2形式和一定程度上的p61形式。 | 绑定 | 15735701 |
CASP9 | APAF-3 | APAF3 | CASPASE-9c | ICE-LAP6 | MCH6 | 半胱天冬酶9日apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | CASP9 (caspase-9)劈开RB-1 (hRB)借给共识网站产生p76形式。 | 绑定 | 15735701 |
CBX1 | CBX | HP1-BETA | HP1Hs-beta | HP1Hsbeta | M31 | MOD1 | p25beta | chromobox同族体1 (HP1β同族体果蝇) | 重新组成复杂 | BioGRID | 12711675 |
CBX4 | NBP16 | PC2 | hPC2 | chromobox同族体4 (Pc类同系物,果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11583618 |
CBX5 | HP1 | HP1A | chromobox同族体5 (HP1α相同器官,果蝇) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11484059 |
CCNA1 | - - - - - - | 细胞周期蛋白A1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10022926 |
CCND1 | BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 | 细胞周期蛋白D1 | Rb与细胞周期蛋白D1。这种交互是仿照了细胞周期蛋白D1从鼠标和Rb人类之间的相互作用。 | 绑定 | 11126356 |
CCND1 | BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 | 细胞周期蛋白D1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8490963 |
CCND3 | - - - - - - | 细胞周期素D3 | 2台混合动力 | BioGRID | 17972097 |
CCNT2 | FLJ90560 | MGC134840 | 细胞周期蛋白T2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12037672 |
CDK2 | p33 (CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | CDK2磷酸化Rb羧基端。 | 绑定 | 15241418 |
CDK2 | p33 (CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | 生化活动 | BioGRID | 10938106 |
到 | CMM3 | MGC14458 | PSK-J3 | 细胞周期蛋白依赖性激酶4 | 到磷酸化Rb羧基端。这种交互是仿照人类Rb和鼠标到证明之间的交互。 | 绑定 | 15241418 |
CDK6 | MGC59692 | PLSTIRE | STQTL11 | 细胞周期蛋白依赖性激酶6 | CDK6磷酸化Rb。这种交互是仿照CDK6和Rb之间的互动,从一个不明的物种。 | 绑定 | 7629134 |
CDK6 | MGC59692 | PLSTIRE | STQTL11 | 细胞周期蛋白依赖性激酶6 | Cdk6磷酸化Rb | 绑定 | 10339564 |
CDK9 | C-2k | CDC2L4 | CTK1 | PITALRE |达克 | 细胞周期蛋白依赖性激酶9 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 12037672 |
CDKN1A | P21 CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1 (p21 Cip1) | Rb与p21启动子进行交互。 | 绑定 | 15716956 |
CEBPB | C / EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | |圈MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11596110 |
CEBPD | C / EBP-delta | CELF | CRP3 | NF-IL6-beta | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),δ | C / EBP-delta与Rb交互。 | 绑定 | 15674331 |
CEBPE | C / EBP-epsilon | CRP1 | CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),ε | Rb与C / EBPepsilon。 | 绑定 | 12947005 |
CREG1 | CREG | E1A-stimulated基因的细胞抑制因子1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9710587 |
CTBP1 | 酒吧| MGC104684 | c端结合蛋白1 | - - - - - - | HPRD | 11583618 |
CUX1 | CASP | CDP | CDP /切割| CDP1 | COY1 | CUTL1 | CUX | Clox | CUX / CDP | GOLIM6 | Nbla10317 | p100 | p110 | p200 |我 | 如一把同源框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12891711 |
DNMT1 | 目的| CXXC9 | DNMT | FLJ16293 | MCMT | MGC104992 | (cytosine-5) DNA甲基转移酶1 | Rb与hDnmt1交互。 | 绑定 | 11847125 |
DNMT1 | 目的| CXXC9 | DNMT | FLJ16293 | MCMT | MGC104992 | (cytosine-5) DNA甲基转移酶1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10888886 |
DNMT3A | DNMT3A2 | M.HsaIIIA | (cytosine-5) DNA甲基转移酶3α | 重新组成复杂 | BioGRID | 11350943 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | 复审委员会与E2F-1交互。 | 绑定 | 15949438 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | 复审委员会与E2F1交互。 | 绑定 | 8816797|8816798 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 7739537|8230483 |8896460|9422723 |10869426|11470869 |12397079 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | 复审委员会与E2F1交互。 | 绑定 | 15619620 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | E2F1 (RBP3)与复审委员会。 | 绑定 | 1638634 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | - - - - - - | HPRD | 1388726|11583618 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | Rb与E2F-1交互。 | 绑定 | 8346196 |
E2F1 | E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 | E2F转录因子1 | Rb与E2F | 绑定 | 9632788 |
E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | E2F-2与复审委员会。 | 绑定 | 8246996 |
E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12502741 |
E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | E2F1与复审委员会。 | 绑定 | 8246996 |
E2F2 | E2F-2 | E2F转录因子2 | 复审委员会与E2F-2交互。 | 绑定 | 15949438 |
E2F4 | E2F-4 | E2F转录因子4,p107 / p130-binding | 2台混合动力 | BioGRID | 10869426 |
E2F4 | E2F-4 | E2F转录因子4,p107 / p130-binding | - - - - - - | HPRD | 8657117 |
E4F1 | E4F | MGC99614 | E4F转录因子1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10869426 |
EID1 | C15orf3 | CRI1 | EID-1 | IRO45620 | MGC138883 | MGC138884 | PNAS-22 | PTD014 | RBP21 | EP300抑制剂相互作用的区别1 | 复审委员会与EID-1交互。 | 绑定 | 15949438 |
EID1 | C15orf3 | CRI1 | EID-1 | IRO45620 | MGC138883 | MGC138884 | PNAS-22 | PTD014 | RBP21 | EP300抑制剂相互作用的区别1 | RB1(复审委员会)与CRI1 (EID-1)。 | 绑定 | 15806172 |
EID1 | C15orf3 | CRI1 | EID-1 | IRO45620 | MGC138883 | MGC138884 | PNAS-22 | PTD014 | RBP21 | EP300抑制剂相互作用的区别1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11073989|11073990 |
ELF1 | - - - - - - | E74-like因子1 (ets域转录因子) | - - - - - - | HPRD | 8493578 |
ENC1 | CCL28 | ENC-1 | FLJ39259 | KLHL35 | KLHL37监督| | PIG10 | TP53I10 | 与BTB-like ectodermal-neural皮层(域) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9566959 |
促红细胞生成素 | EP | MGC138142 | 促红细胞生成素 | RB1(复审委员会)与促红细胞生成素基因3(总理)增强剂。 | 绑定 | 15674338 |
”丛书 | AP-1 | C-FOS | v-fos FBJ小鼠骨肉瘤病毒致癌基因相同器官 | - - - - - - | HPRD | 8475068 |
FRK | GTK | PTK5 |爱你 | fyn-related激酶 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7664264 |
FRK | GTK | PTK5 |爱你 | fyn-related激酶 | 复审委员会与爱。 | 绑定 | 7664264 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12761493 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | RACK1与Rb | 绑定 | 12761493 |
GTF3C2 | KIAA0011 | TFIIIC-BETA | TFIIIC110 | 通用转录因子IIIC多肽2β110 kda | Rb与TFIIIC2 | 绑定 | 9169441 |
HBP1 | FLJ16340 | hmg盒子转录因子1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9178770 |
HDAC1 | DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰酶1 | RB和HDAC1交互。 | 绑定 | 11447271 |
HDAC1 | DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰酶1 | - - - - - - | HPRD | 9491888|10888886 |11896613|11909966 |
HDAC1 | DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰酶1 | 视网膜母细胞瘤蛋白与组蛋白脱乙酰酶1。 | 绑定 | 10734134 |
HDAC1 | DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰酶1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 9491888|9724731 |10490602|10615135 |10779361|11684023 |12466959 |
HDAC2 | RPD3 | YAF1 | 组蛋白脱乙酰酶2 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490602 |
HDAC3 | HD3 | RPD3 | RPD3-2 | 组蛋白脱乙酰酶3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12479814 |
HIF1A | HIF-1alpha | HIF1 | HIF1-ALPHA | MOP1 | PASD8 | 低氧诱导因子1α亚基(基本helix-loop-helix转录因子) | RB1(复审委员会)与HIF1A (HIF-1-alpha)。 | 绑定 | 15674338 |
HMGB1 | DKFZp686A04236 | HMG1 | HMG3 | SBP-1 | 高机动组框1 | HMGB1与RB1(复审委员会)。这种交互是仿照了老鼠HMGB1和人类之间的相互作用RB1(复审委员会)。 | 绑定 | 11748221 |
HMGB1 | DKFZp686A04236 | HMG1 | HMG3 | SBP-1 | 高机动组框1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11748221 |
HSPA8 | HSC54 | HSC70 | HSC71 | HSP71 | HSP73 | HSPA10 | LAP1 | MGC131511 | MGC29929 | NIP71 | 热休克蛋白质8 70 kda | - - - - - - | HPRD | 7673249 |
JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7935440 |
JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | Rbp2与Rb交互。这种交互是仿照人类Rbp2证明之间的交互和Rb从一个未指明的物种。 | 绑定 | 11358960 |
JARID1A | KDM5A | RBBP2 | RBP2 | jumonji,丰富互动领域1 | 复审委员会与RBP2交互。 | 绑定 | 15949438 |
小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10026157 |
小君 | AP-1 | AP1 | c-Jun | 小君致癌基因 | RB与c-Jun交互。 | 绑定 | 10026157 |
KAT2B | CAF P P / CAF | | | PCAF | K(赖氨酸)乙酰转移酶2 b | 复审委员会与P / CAF的乙酰转移酶域。 | 绑定 | 15044952 |
LIN37 | F25965 | MGC9505 | ZK418.4 | lin-37 | lin-37同族体(秀丽隐杆线虫) | 复审委员会与hMip40交互。 | 绑定 | 15479636 |
LIN54 | CXCDC1 | DKFZp686L1814 | JC8.6 | MGC129905 | MIP120 | lin-54同族体(秀丽隐杆线虫) | 复审委员会与hMip120交互。 | 绑定 | 15479636 |
LIN9 | 巴拉| BARPsv | Lin-9 | TGS | TGS1 | lin-9同族体(秀丽隐杆线虫) | 复审委员会与hMip130 /责难。 | 绑定 | 15479636 |
LIN9 | 巴拉| BARPsv | Lin-9 | TGS | TGS1 | lin-9同族体(秀丽隐杆线虫) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15538385 |
LMNA | CDCD1 | CDDC | CMD1A | CMT2B1 | EMD2 FPL | | FPLD |计| IDC | LDP1 | LFP | LGMD1B | LMN1 | LMNC | PRO1 | 核纤层蛋白A / C | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8058329|8278403 |
LMNA | CDCD1 | CDDC | CMD1A | CMT2B1 | EMD2 FPL | | FPLD |计| IDC | LDP1 | LFP | LGMD1B | LMN1 | LMNC | PRO1 | 核纤层蛋白A / C | Rb与核纤层蛋白C | 绑定 | 12475961 |
MAPK1 | ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk | 增殖蛋白激酶1 | RB1由MAPK1磷酸化。这种交互是仿照人类KIAA1536之间的交互和MAPK1从一个未指明的物种。 | 绑定 | 15489336 |
MAPK9 | JNK-55 | JNK2 | JNK2A | JNK2ALPHA | JNK2B | JNK2BETA | PRKM9 | SAPK | p54a | p54aSAPK | 增殖蛋白激酶9 | Rb与JNK2交互。之间的交互是仿照了交互Rb从物种和JNK2不详不详的物种。 | 绑定 | 11566021 |
MCM7 | CDABP0042 | CDC47 | MCM2 | P1.1-MCM3 | P1CDC47 | P85MCM | pnas - 146 | 7 minichromosome维护复杂的组件 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9566894 |
MCM7 | CDABP0042 | CDC47 | MCM2 | P1.1-MCM3 | P1CDC47 | P85MCM | pnas - 146 | 7 minichromosome维护复杂的组件 | MCM7与Rb交互。 | 绑定 | 9566894 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7791904 | 7791904|10721693 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | Rb与Mdm2交互。 | 绑定 | 15577944 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | Rb与MDM2交互。 | 绑定 | 15485814 |
MDM4 | DKFZp781B1423 | HDMX | MDMX | MGC132766 | MRP1 | Mdm4 p53结合蛋白同系物(鼠标) | 复审委员会与MDMX交互。这种交互建模在演示鼠标MDMX之间的相互作用和人类复审委员会。 | 绑定 | 12532331 |
MITF | MI | WS2A | bHLHe32 | microphthalmia-associated转录因子 | Mitf与Rb的一个未指明的同种型。 | 绑定 | 15716956 |
MNAT1 | MAT1 | RNF66 | TFB3 | 三角恋同族体1,细胞周期蛋白H装配因素(非洲爪蟾蜍光滑的) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11113200 |
MORF4L1 | Eaf3 | FWP006 | HsT17725 | MGC10631 | MORFRG15 | MRG15 | S863-6 | 4像1死亡率的因素 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11500496|12397079 |
MORF4L2 | KIAA0026 | MORFL2 | MRGX | 4像2死亡率的因素 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14506250 |
MRFAP1 | PAM14 | PGR1 | Mof4家庭相关蛋白1 | 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 11500496|12397079 |
MT1G | MGC12386 | MT1 | MT1K | 金属硫蛋白1克 | RB1与MT1G启动子进行交互。 | 绑定 | 15735762 |
MYC | bHLHe39 |原癌基因 | v-myc myelocytomatosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7838535 |
MYOD1 | 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 | 肌原性的分化1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8381715 |
NCOA6 | AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP | 核受体共激活剂6 | Rb与ASC-2交互。 | 绑定 | 14645241 |
NCOA6 | AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP | 核受体共激活剂6 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 14645241 |
NDC80 | HEC | HEC1 | KNTC2 | TID3 | hsNDC80 | NDC80同族体,着丝粒复杂组件(酵母) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10409732 |
NFIX | NF1A | 核因子I / X (CCAAT-binding转录因子) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11896613 |
PA2G4 | EBP1 | HG4-1 | p38-2G4 | proliferation-associated 2 g4, 38 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11268000 |
PAX6 | 一个| AN2 | D11S812E | MGC17209 | MGDA | WAGR | 双箱6 | 重新组成复杂 | BioGRID | 10359315 |
PELP1 | HMX3 | MNAR | P160 | 脯氨酸、谷氨酸和亮氨酸丰富蛋白质1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12682072 |
PELP1 | HMX3 | MNAR | P160 | 脯氨酸、谷氨酸和亮氨酸丰富蛋白质1 | PELP1与复审委员会。 | 绑定 | 12682072 |
的PHB | PHB1 | prohibitin | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10376528 |
PIK3R1 | GRB1 | p85 | p85-ALPHA | phosphoinositide-3-kinase,调节亚基1(α) | Rb与p55alpha | 绑定 | 12588990 |
PIK3R3 | DKFZp686P05226 | FLJ41892 |过去| p55-GAMMA | phosphoinositide-3-kinase,调节亚基3(γ) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12588990 |
PIK3R3 | DKFZp686P05226 | FLJ41892 |过去| p55-GAMMA | phosphoinositide-3-kinase,调节亚基3(γ) | Rb与PI3K调节亚基p55gamma | 绑定 | 12588990 |
PML | 万立升| PP8675 | RNF71 | TRIM19 | 早幼粒细胞白血病 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9448006 |
POLA1 | DKFZp686K1672 |普拉| p180 | DNA聚合酶(导演)、α1、催化亚基 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9395244 |
PPARG | NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma | 过氧物酶体proliferator-activated受体γ | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 12479814 |
PPIA | CYPA | CYPH | MGC117158 | MGC12404 | MGC23397 | peptidylprolyl异构酶(还有) | Rb与CypA交互。 | 绑定 | 12210730 |
PRDM2 | HUMHOXY1 | KMT8 | MTB-ZF | RIZ | RIZ1 | RIZ2 | 公关领域包含2,ZNF域 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7538672 |
PRKRA | DYT16 | HSD14 | |协议递交 | 激活蛋白激酶,interferon-inducible双链RNA依赖 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9010216 |
RAF1 | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf | v-raf-1小鼠白血病病毒致癌基因同族体1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9819434 |
RAF1 | CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf | v-raf-1小鼠白血病病毒致癌基因同族体1 | Raf-1与Rb交互。 | 绑定 | 9819434 |
RB1 | OSRC | RB | p105-Rb |复审委员会| pp110 | 成视网膜细胞瘤1 | - - - - - - | HPRD | 12502741 |
RBAK | ZNF769 | RB-associated带锌指 | - - - - - - | HPRD | 10702291 |
RBBP4 | NURF55 | RBAP48 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 | 视网膜母细胞瘤蛋白1 (Rb)与RbAp48交互 | 绑定 | 7503932 |
RBBP4 | NURF55 | RBAP48 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7503932 |
RBBP5 | RBQ3 | SWD1 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白5 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7558034 |
RBBP7 | MGC138867 | MGC138868 | RbAp46 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白7 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7503932 |
RBBP7 | MGC138867 | MGC138868 | RbAp46 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白7 | 视网膜母细胞瘤蛋白,Rb,与RbAp46交互。 | 绑定 | 7503932 |
RBBP8 | CTIP |边缘 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白8 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9721205 |
RBBP9 | 沼泽| MGC9236 | RBBP10 | 视网膜母细胞瘤结合蛋白9 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9697699 |
RBL1 | CP107 | MGC40006 | PRB1 | p107 | retinoblastoma-like 1 (p107) | Rb与p107启动子进行交互。 | 绑定 | 15716956 |
RBL1 | CP107 | MGC40006 | PRB1 | p107 | retinoblastoma-like 1 (p107) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490602 |
RBL2 | FLJ26459 | P130 |而已 | retinoblastoma-like 2 (p130) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10490602 |
RFC1 | A1 | MGC51786 | MHCBFB | PO-GA | RECC1 RFC | | RFC140 | 复制因子C(激活1)145 kda | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 10353443 |
RING1 | RING1A | RNF1 | 无名指蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11583618 |
RUNX2 | CCD AML3 | CBFA1 | | CCD1 | MGC120022 | MGC120023 | OSF2 | PEA2aA | PEBP2A1 | PEBP2A2 | PEBP2aA | PEBP2aA1 | runt-related转录因子2 | Runx2与复审委员会。 | 绑定 | 15583032 |
SERPINB2 | HsT1201 | PAI | PAI-2 |黄牌| PLANH2 | serpin肽酶抑制剂,支系B(卵白蛋白),成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12944478 |
SERPINB2 | HsT1201 | PAI | PAI-2 |黄牌| PLANH2 | serpin肽酶抑制剂,支系B(卵白蛋白),成员2 | Rb与PAI-2交互。 | 绑定 | 12944478 |
SKP2 | FBL1 | FBXL1 | FLB1 | MGC1366 | s阶段kinase-associated蛋白2(下岗通知) | Skp2与Rb交互。 | 绑定 | 15469821 |
SMARCA4 | BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7923370 |
SMARCB1 | BAF47 | INI1 | RDT | SNF5 | SNF5L1 | Sfh1p | Snr1 | hSNFS | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚b,成员1 | - - - - - - | HPRD | 11085541 |
SNAPC1 | PTFgamma | SNAP43 | 小核RNA激活复杂,多肽1,43 kda | Rb与SNAP43 | 绑定 | 11094070 |
SNAPC1 | PTFgamma | SNAP43 | 小核RNA激活复杂,多肽1,43 kda | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 11094070 |
SNAPC3 | MGC132011 | MGC33124 | PTFbeta | SNAP50 | 小核RNA激活复杂、多肽3 50 kda | Rb与SNAP50 | 绑定 | 11094070 |
SNAPC3 | MGC132011 | MGC33124 | PTFbeta | SNAP50 | 小核RNA激活复杂、多肽3 50 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11094070 |
SNW1 | Bx42 | MGC119379 | ncoa - 62 | PRPF45 | Prp45 | SKIIP |跳过 | SNW域包含1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12466551 |
SP1 | - - - - - - | Sp1转录因子 | - - - - - - | HPRD | 7732011 |
SP1 | - - - - - - | Sp1转录因子 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11896613 |
SP3 | DKFZp686O1631 | SPR-2 | Sp3转录因子 | - - - - - - | HPRD | 7732011 |
SPIB | SPI-B | Spi-B转录因子(Spi-1 / PU。1相关) | - - - - - - | HPRD | 10196196 |
SUV39H1 | KMT1A | MG44 | SUV39H | 抑制的彩色3 - 9同族体1(果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11484059|11533237 |
TAF1 | BA2R | CCG1 | 20 | DYT3 | KAT4 | N-TAF1 | NSCL2 |的| P250 | TAF2A | TAFII250 | TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,250 kda | TAFII250与Rb交互。 | 绑定 | 11126356 |
TAF1 | BA2R | CCG1 | 20 | DYT3 | KAT4 | N-TAF1 | NSCL2 |的| P250 | TAF2A | TAFII250 | TAF1 RNA聚合酶II, TATA盒结合蛋白(真沸点)相关因素,250 kda | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7724524|9242374 |9858607 |
真沸点 | GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID | TATA盒结合蛋白 | Rb与真沸点 | 绑定 | 11094070 |
TFDP1 | DP1 | DRTF1 | Dp-1 | 转录因子Dp-1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 7739537 |
TFDP2 | DP2 | Dp-2 | 转录因子Dp-2 (E2F二聚合作伙伴2) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 7739537 |
TGM2 | G-ALPHA-h | GNAH | TG2 | TGC | 转谷氨酰胺酶2 (C多肽,protein-glutamine-gamma-glutamyltransferase) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9315663 |
THOC1 | HPR1 | P84 | P84N5 | THO复杂1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7525595 |
TMPO | CMD1T | LAP2 | LEMD4 | MGC61508 | PRO0868 | TP | 促胸腺生成素 | Rb与LAP2alpha | 绑定 | 12475961 |
TMPO | CMD1T | LAP2 | LEMD4 | MGC61508 | PRO0868 | TP | 促胸腺生成素 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12475961 |
TP73 | P73 | 肿瘤蛋白质p73 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12761493 |
TRAP1 | HSP75 | HSP90L | TNF receptor-associated蛋白1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 8756626 |
TRIP11 | CEV14 | gmap - 210 | TRIP230 | 甲状腺激素受体担任11 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9256431 |
酪氨酸 | OCA1A | OCAIA | SHEP3 | 酪氨酸酶(oculocutaneous白化病IA) | Rb与酪氨酸启动子进行交互。 | 绑定 | 15716956 |
UBE2I | C358B7.1 | P18 | UBC9 | ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母) | RB1(复审委员会)进行交互,sumoylated,不详的同种型UBE2I (Ubc9)。 | 绑定 | 15806172 |
UBTF | 和- 90 | UBF | 上游转录因子结合,RNA聚合酶I | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11042686 |
论述 | NR1I1 | 维生素D (1,25 - dihydroxyvitamin D3)受体 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11358960 |
VEGFA | MGC70609 | VEGF | VEGF-A |结合 | 血管内皮生长因子A | RB1(复审委员会)与VEGF促进剂。 | 绑定 | 15674338 |
ZBTB16 | PLZF | ZNF145 | 锌指和BTB域包含16 | 复审委员会与PLZF交互。 | 绑定 | 15949438 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞周期 | 128年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG通路在癌症 | 328年 | 259年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG胰腺癌 | 70年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG神经胶质瘤 | 65年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG前列腺癌 | 89年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG黑色素瘤 | 71年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG膀胱癌 | 42 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG慢性骨髓性白血病 | 73年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG小细胞肺癌 | 84年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG非小细胞肺癌 | 54 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA G1通路 | 28 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA TID通路 | 19 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA CELLCYCLE通路 | 23 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA SKP2E2F通路 | 10 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA FAS通路 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA HIVNEF通路 | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA通路血巨细胞病毒 | 17 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA RACCYCD通路 | 26 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA PPARA通路 | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA P53通路 | 16 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA RB通路 | 13 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA P27通路 | 13 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA PML通路 | 17 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA电话通路 | 18 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA TNFR1通路 | 29日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA ARF通路 | 17 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID P73PATHWAY | 79年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID E2F通路 | 74年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID神经酰胺通路 | 48 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID P53下游通路 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID ATF2通路 | 59 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID FOXM1通路 | 40 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID 1 RB通路 | 65年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID他嘿通路 | 48 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞周期 | 421年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
从染色质REACTOME ORC1移除 | 67年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME细胞周期有丝分裂 | 325年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
在G1年代过渡REACTOME细胞周期素E相关事件 | 65年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME G1期 | 38 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME G1年代过渡 | 112年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME DNA的合成 | 92年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME有丝分裂G1 G1年代阶段 | 137年 | 79年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME抑制受损DNA的复制起始RB1 E2F1 | 13 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME DNA复制 | 192年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME E2F介导的DNA复制的监管 | 35 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME S期 | 109年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAZDA钻石BLACKFAN贫血祖DN | 66年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1 HSC融合起来 | 185年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC1目标了 | 457年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SENESE HDAC3目标了 | 501年 | 327年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARKEY RB1慢性LOF DN | 118年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素 | 612年 | 367年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
巴里斯甲状腺癌DN | 59 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
高田胃癌拷贝数DN | 29日 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
标志着非组蛋白乙酰化蛋白质 | 15 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RIZ红细胞分化HEMGN | 31日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MOHANKUMAR TLX1目标了 | 414年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蔡对电离辐射的反应 | 149年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA乳腺癌点燃INT网络 | 101年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168年 | 103年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA为中心的网络 | 117年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
魏MYCN目标与E箱 | 795年 | 478年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
弗里德曼不朽DN | 34 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
他PTEN的目标 | 16 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治细胞周期MIR192目标 | 62年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2目标了 | 424年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHIN集群7 B细胞淋巴瘤 | 27 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MORI小PRE BII淋巴细胞 | 86年 | 57 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TCGA胶质母细胞瘤拷贝数DN | 31日 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
丁肺癌显著变异 | 26 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
丁肺癌突变频繁 | 12 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MANALO缺氧DN | 289年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
白细胞介素6 BROCKE凋亡发生逆转 | 144年 | 98年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞浆细胞VS PLASMABLAST DN | 309年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
彭葡萄糖剥夺DN | 169年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
任受E2F | 61年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MAGRANGEAS多发性骨髓瘤IGLL VS IGLK | 42 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
与13 q14 HASLINGER B CLL删除 | 24 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霍夫曼细胞淋巴瘤了 | 50 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
哈达德B淋巴细胞祖 | 293年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
亚伯拉罕ALPC VS多发性骨髓瘤 | 26 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MA骨髓分化了 | 39 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUMAR MLL AF9融合的目标 | 405年 | 264年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由《魏盖尔氧化应激和过氧化氢 | 36 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
击倒老化肌肉了 | 244年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
胡锦涛GENOTOXIN行动直接和间接24小时 | 55 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒8小时 | 105年 | 73年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
霁应对FSH DN | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DELASERNA MYOD目标了 | 89年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
朱巨细胞病毒了 | 120年 | 89年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUNINGER IGF1 VS PDGFB目标 | 82年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
朱巨细胞病毒24小时 | 93年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MAHAJAN IL1A反应 | 81年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
程印的雌二醇 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DE YY1 DN的目标 | 92年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BPA DAIRKEE癌症容易反应 | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BONOME卵巢癌生存非最优减积 | 510年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
气浆细胞瘤了 | 259年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRESHOCK癌症拷贝数 | 323年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MCMURRAY TP53 hra合作响应DN | 67年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
詹V1后期分化基因 | 32 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
石田E2F目标 | 53 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TCGA突变成胶质细胞瘤 | 8 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和11 q23处重新安排 | 351年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUROKAWA肝癌复发早期DN | 7 | 6 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党由MYC DN | 253年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
么时间响应黄体酮集群14 | 143年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
卡MIR302A目标 | 77年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BRIDEAU印迹基因 | 63年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 686年 | 692年 | 1 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
mir - 143 | 999年 | 1005年 | 1 | hsa - mir - 143大脑 | UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA |
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 883年 | 889年 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
miR-192/215 | 1582年 | 1589年 | 1、m8 | hsa - mir - 192 | CUGACCUAUGAAUUGACAGCC |
hsa - mir - 215 | AUGACCUAUGAAUUGACAGAC | ||||
miR-33 | 456年 | 462年 | 1 | hsa-miR-33 | GUGCAUUGUAGUUGCAUUG |
hsa-miR-33b | GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA | ||||
miR-7 | 1063年 | 1070年 | 1、m8 | hsa-miR-7深圳 | UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG |