基因页：KDM5A
概括？
| 基因 | 5927 |
| 象征 | KDM5A |
| 同义词 | rbbp-2 | rbbp2 | rbp2 |
| 描述 | 赖氨酸脱甲基酶5A |
| 参考 | MIM：180202|HGNC：HGNC：9886|Ensembl：ENSG0000000073614|HPRD：08915|Vega：Otthumg00000168055 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p11 |
| Pascal P值 | 0.586 |
| Sherlock P值 | 0.874 |
| 胎儿β | 0.38 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| hexdc | 0.84 | 0.84 |
| PCBP4 | 0.81 | 0.84 |
| ACD | 0.81 | 0.77 |
| UCKL1 | 0.81 | 0.81 |
| FBXL6 | 0.81 | 0.79 |
| CLN3 | 0.80 | 0.81 |
| PLSCR3 | 0.80 | 0.82 |
| ZBTB48 | 0.79 | 0.79 |
| rfng | 0.79 | 0.80 |
| qtrt1 | 0.79 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.56 | -0.59 |
| AF347015.31 | -0.54 | -0.58 |
| MT-CO2 | -0.52 | -0.57 |
| mt-cyb | -0.52 | -0.57 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.58 |
| AF347015.15 | -0.51 | -0.58 |
| MT-ATP8 | -0.49 | -0.64 |
| AF347015.33 | -0.49 | -0.53 |
| ABCG2 | -0.49 | -0.52 |
| AF347015.21 | -0.48 | -0.62 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| bglap | bgp |OC |PMF1 | 骨γ-羧基谷氨酸（GLA）蛋白 | RBP2与OC启动子相互作用。 | 绑定 | 15949438 |
| BRD2 | D6S113E |DKFZP686N0336 |FLJ31942 |FSH |FSRG1 |KIAA9001 |nat |ring3 |RNF3 | 包含2的溴结构域 | RBP2与BRD2启动子相互作用。 | 绑定 | 15949438 |
| BRD8 | smap |smap2 |P120 | 含有8的溴结构域 | RBP2与BRD8启动子相互作用。 | 绑定 | 15949438 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 11358960 |
| ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | RBP2与ER相互作用。 | 绑定 | 11358960 |
| LMO2 | rbtn2 |rbtnl1 |Rhom2 |TTG2 | Lim域仅2（菱形素状1） | - | HPRD，Biogrid | 9129143 |
| NR3C1 | GCCR |GCR |gr |grl | 核受体亚科3，C组，成员1（糖皮质激素受体） | 重构的复合物 | Biogrid | 11358960 |
| NR3C1 | GCCR |GCR |gr |grl | 核受体亚科3，C组，成员1（糖皮质激素受体） | RBP2与GR相互作用。这种相互作用是根据人RBP2和大鼠GR之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 11358960 |
| 拉拉 | NR1B1 |RAR | 视黄酸受体，α | 重构的复合物 | Biogrid | 11358960 |
| 拉拉 | NR1B1 |RAR | 视黄酸受体，α | RBP2与RAR相互作用。 | 绑定 | 11358960 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | - | HPRD，Biogrid | 7935440 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | RBP2与RB相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人RBP2和RB之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 11358960 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | PRB与RBP2相互作用。 | 绑定 | 15949438 |
| RBL1 | CP107 |MGC40006 |prb1 |P107 | 视网膜母细胞瘤状1（p107） | - | HPRD，Biogrid | 7935440 |
| TBP | gtf2d |GTF2D1 |MGC117320 |MGC126054 |MGC126055 |SCA17 |tfiid | 塔塔盒结合蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 7935440 |
| VDR | NR1I1 | 维生素D（1,25-二羟基维生素D3）受体 | - | HPRD，Biogrid | 11358960 |
| VDR | NR1I1 | 维生素D（1,25-二羟基维生素D3）受体 | RBP2与VDR相互作用。 | 绑定 | 11358960 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZ红细胞分化HBZ | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在喉癌中放大了耶维宁 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼细胞淋巴瘤 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 卫生部对干扰素beta的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP | 49 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tracey对IFNA2 DN的抗性 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHO NR4A1目标 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 | 106 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |