SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因	5929
象征	RBBP5
同义词	RBQ3 \| SWD1
描述	视网膜细胞瘤结合蛋白5
参考	MIM：600697\|HGNC：HGNC：9888\|ENSEMBL：ENSG00000117222\|HPRD：02826\|Vega：Otthumg00000037104
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1q32
Sherlock P值	0.093
TADA P值	0.01
胎儿β	-0.021
主持人	伏隔核基底神经节迈尔斯的顺式和跨性别
支持	染色质重塑基因

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DNM：Gulsuner_2013	整个外显子组测序分析	155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。

第一节遗传学和表观遗传学注释

DNM表

基因	染色体	位置	参考	alt	成绩单	AA更改	突变类型	筛	CG46	特征	学习
RBBP5	CHR1	205068937	G	一个	NM_001193272 NM_001193272 NM_001193273 NM_001193273 NM_005057 NM_005057	。 p.304h> y 。 p.177h> y 。 p.304h> y	拼接错过拼接错过拼接错过			精神分裂症	DNM：Gulsuner_2013

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS2289256	CHR4	187089132	RBBP5	5929		0.02		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
PRRG3	0.74	0.81
L3MBTL2	0.74	0.79
GGA3	0.74	0.80
AP3B2	0.73	0.80
AP2A2	0.73	0.79
KCTD21	0.72	0.77
USP11	0.72	0.79
MAP3K12	0.72	0.80
PISD	0.72	0.77
ZFYVE27	0.72	0.79

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
MT-CO2	-0.57	-0.62
AF347015.31	-0.56	-0.61
AF347015.21	-0.55	-0.64
higd1b	-0.55	-0.62
AC098691.2	-0.54	-0.66
GNG11	-0.53	-0.64
AF347015.33	-0.53	-0.57
AC021016.1	-0.53	-0.59
AF347015.8	-0.53	-0.60
AF347015.2	-0.53	-0.57

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
ASCL2	Ash2 \|哈希2 \|mash2 \|BHLHA45	Achaete-Scute复合物同源2（果蝇）	亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	12482968
Ash2l	Ash2 \|ASH2L1 \|ASH2L2 \|bre2	ASH2（不存在，小或同源） - 像（果蝇）	重构的复合物	Biogrid	15199122
HCFC1	CFF \|HCF-1 \|HCF1 \|HFC1 \|MGC70925 \|VCAF	宿主细胞因子C1（VP16-辅助蛋白）	共纯化	Biogrid	15199122
HCFC2	FLJ94012 \|HCF-2 \|HCF2	宿主细胞因子C2	共纯化	Biogrid	15199122
Hist2H3C	H3 \|H3.2 \|H3/m \|H3F2 \|H3FM \|MGC9629	组蛋白簇2，H3C	重构的复合物	Biogrid	12482968
Men1	meai \|SCG2	多内分泌肿瘤I	共纯化	Biogrid	15199122
mll	all-1 \|CXXC7 \|FLJ11783 \|HRX \|htrx1 \|KMT2A \|MLL/GAS7 \|mll1a \|tet1-mll \|TRX1	髓样/淋巴样或混合乳突白血病（Trithorax同源性，果蝇）	RBBP5与MLL相互作用。	绑定	15960975
mll	all-1 \|CXXC7 \|FLJ11783 \|HRX \|htrx1 \|KMT2A \|MLL/GAS7 \|mll1a \|tet1-mll \|TRX1	髓样/淋巴样或混合乳突白血病（Trithorax同源性，果蝇）	亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	15199122
mll3	DKFZP686C08112 \|FLJ12625 \|FLJ38309 \|哈尔\|KIAA1506 \|KMT2C \|MGC119851 \|MGC119852 \|MGC119853	髓样/淋巴或混合乳突白血病3	亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	12482968
NCOA6	AIB3 \|antp \|ASC2 \|HOX1.1 \|Hoxa7 \|KIAA0181 \|NRC \|prip \|Rap250 \|trbp	核受体共激活因子6	亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩共纯化	Biogrid	12482968
RB1	OSRC \|RB \|P105-RB \|PRB \|PP110	视网膜细胞瘤1	-	HPRD，Biogrid	7558034
tuba4a	FLJ30169 \|H2-Alpha \|tuba1	微管蛋白，α4A	共纯化	Biogrid	12482968
塔布	M40 \|MGC117247 \|MGC16435 \|OK/SW-CL.56 \|tubb1 \|tubb5	微管蛋白，β	共纯化	Biogrid	12482968
WDR5	Big-3 \|SWD3	WD重复域5	共纯化	Biogrid	15199122

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标	1278	748	该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴里斯甲状腺癌	23	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络	423	265	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN	1024	594	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标	148	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼细胞淋巴瘤	50	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期	390	242	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时	105	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌	973	570	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上	863	514	该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞	425	253	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标	425	261	该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱门特乳腺癌复制号码	23	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
泰勒在急性淋巴细胞白血病中甲基化	77	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移	221	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因