SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	5934
Symbol	RBL2
同义词	P130 \| RB2
描述	视网膜母细胞瘤样2
参考	MIM:180203\|HGNC:HGNC:9894\|Ensembl:ENSG00000103479\|HPRD：01576\|Vega:OTTHUMG00000133198
基因type	protein-coding
地图位置	16q12.2
Pascal P值	0.026
Sherlock P值	0.722
eGene	前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节小脑半球 Cerebellum Cortex 额叶皮质BA9 Hippocampus 下丘脑梭子基底神经节 Meta

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	PVALUE	qvalue	TSS distance	eQTL type
RS2908797	16	53429173	RBL2	ENSG00000103479.10	3.743E-7	0	-38716	gtex_brain_ba24
rs7203132	16	53429775	RBL2	ENSG00000103479.10	4.849E-7	0	-38114	gtex_brain_ba24
rs28815549	16	53432219	RBL2	ENSG00000103479.10	1.237E-6	0	-35670	gtex_brain_ba24
RS1344491	16	53439409	RBL2	ENSG00000103479.10	7.638E-7	0	-28480	gtex_brain_ba24
rs13332071	16	53443636	RBL2	ENSG00000103479.10	3.136E-7	0	-24253	gtex_brain_ba24
rs28759393	16	53445358	RBL2	ENSG00000103479.10	7.631E-7	0	-22531	gtex_brain_ba24
RS8063294	16	53446757	RBL2	ENSG00000103479.10	8.929E-7	0	-21132	gtex_brain_ba24
rs1861353	16	53452081	RBL2	ENSG00000103479.10	3.133E-7	0	-15808	gtex_brain_ba24
rs5816894	16	53452220	RBL2	ENSG00000103479.10	3.085E-7	0	-15669	gtex_brain_ba24
RS8061398	16	53454151	RBL2	ENSG00000103479.10	3.133E-7	0	-13738	gtex_brain_ba24
RS9932007	16	53456661	RBL2	ENSG00000103479.10	2.17E-7	0	-11228	gtex_brain_ba24
rs1978337	16	53459745	RBL2	ENSG00000103479.10	3.132E-7	0	-8144	gtex_brain_ba24
rs6499613	16	53463418	RBL2	ENSG00000103479.10	7.623E-7	0	-4471	gtex_brain_ba24
rs6499617	16	53467722	RBL2	ENSG00000103479.10	3.565E-7	0	-167	gtex_brain_ba24
rs8056349	16	53468026	RBL2	ENSG00000103479.10	3.13e-7	0	137	gtex_brain_ba24
RS4146344	16	53468962	RBL2	ENSG00000103479.10	2.168E-7	0	1073	gtex_brain_ba24
RS1074182	16	53471357	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	3468	gtex_brain_ba24
rs13330182	16	53472385	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	4496	gtex_brain_ba24
rs9927982	16	53474108	RBL2	ENSG00000103479.10	5.286E-7	0	6219	gtex_brain_ba24
rs62048518	16	53474693	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	6804	gtex_brain_ba24
rs9921587	16	53475650	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	7761	gtex_brain_ba24
rs17800577	16	53476804	RBL2	ENSG00000103479.10	5.286E-7	0	8915	gtex_brain_ba24
RS9927720	16	53478022	RBL2	ENSG00000103479.10	8.22e-7	0	10133	gtex_brain_ba24
rs1362429	16	53479084	RBL2	ENSG00000103479.10	3.133E-7	0	11195	gtex_brain_ba24
rs398070807	16	53480250	RBL2	ENSG00000103479.10	2.8e-7	0	12361	gtex_brain_ba24
RS16952246	16	53480709	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	12820	gtex_brain_ba24
rs9938788	16	53481422	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	13533	gtex_brain_ba24
RS7204758	16	53482365	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	14476	gtex_brain_ba24
rs9921627	16	53482692	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	14803	gtex_brain_ba24
rs4783811	16	53483376	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	15487	gtex_brain_ba24
RS16952252	16	53483980	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	16091	gtex_brain_ba24
RS7202621	16	53486037	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	18148	gtex_brain_ba24
rs9941254	16	53487218	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	19329	gtex_brain_ba24
RS7194730	16	53489190	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	21301	gtex_brain_ba24
rs13332406	16	53489705	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	21816	gtex_brain_ba24
RS57589557	16	53490098	RBL2	ENSG00000103479.10	1.158E-7	0	22209	gtex_brain_ba24
rs9929873	16	53490676	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	22787	gtex_brain_ba24
rs2024449	16	53494617	RBL2	ENSG00000103479.10	1.66E-7	0	26728	gtex_brain_ba24
rs7204496	16	53496598	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	28709	gtex_brain_ba24
RS11859538	16	53497045	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	29156	gtex_brain_ba24
rs11864278	16	53497417	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	29528	gtex_brain_ba24
RS4784312	16	53498402	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	30513	gtex_brain_ba24
RS1072910	16	53499599	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	31710	gtex_brain_ba24
RS1072911	16	53499725	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	31836	gtex_brain_ba24
rs4281707	16	53501946	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	34057	gtex_brain_ba24
rs1131220	16	53503934	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	36045	gtex_brain_ba24
rs10748	16	53504721	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	36832	gtex_brain_ba24
RS8061073	16	53508507	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	40618	gtex_brain_ba24
rs8045674	16	53509936	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	42047	gtex_brain_ba24
RS56126229	16	53510687	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	42798	gtex_brain_ba24
RS62048526	16	53511926	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	44037	gtex_brain_ba24
rs8062535	16	53512488	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	44599	gtex_brain_ba24
rs8043918	16	53513033	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	45144	gtex_brain_ba24
RS8049033	16	53513055	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	45166	gtex_brain_ba24
RS17801498	16	53513452	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	45563	gtex_brain_ba24
RS3803657	16	53515959	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	48070	gtex_brain_ba24
rs9302647	16	53516539	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	48650	gtex_brain_ba24
rs8056370	16	53516676	RBL2	ENSG00000103479.10	2.826E-7	0	48787	gtex_brain_ba24
RS7199401	16	53516950	RBL2	ENSG00000103479.10	2.351E-7	0	49061	gtex_brain_ba24
rs56331911	16	53517891	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	50002	gtex_brain_ba24
rs200398820	16	53517894	RBL2	ENSG00000103479.10	1.276E-7	0	50005	gtex_brain_ba24
RS17193176	16	53518228	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	50339	gtex_brain_ba24
rs4783813	16	53518370	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	50481	gtex_brain_ba24
rs8046307	16	53518686	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	50797	gtex_brain_ba24
RS13337544	16	53519035	RBL2	ENSG00000103479.10	2.167E-7	0	51146	gtex_brain_ba24
rs8055279	16	53522749	RBL2	ENSG00000103479.10	2.201E-7	0	54860	gtex_brain_ba24
RS58728198	16	53523947	RBL2	ENSG00000103479.10	2.043E-7	0	56058	gtex_brain_ba24
rs3929	16	53524308	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	56419	gtex_brain_ba24
rs9931702	16	53526551	RBL2	ENSG00000103479.10	3.034e-7	0	58662	gtex_brain_ba24
rs9302648	16	53527781	RBL2	ENSG00000103479.10	3.027E-7	0	59892	gtex_brain_ba24
rs1861351	16	53533227	RBL2	ENSG00000103479.10	3.129E-7	0	65338	gtex_brain_ba24
rs1861350	16	53533342	RBL2	ENSG00000103479.10	2.043E-7	0	65453	gtex_brain_ba24
RS8055642	16	53537581	RBL2	ENSG00000103479.10	3.059E-7	0	69692	gtex_brain_ba24
RS57589557	16	53490098	RBL2	ENSG00000103479.10	2.767E-6	0.04	22209	gtex_brain_putamen_basal

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
dennd5b	0.81	0.81
ASH1L	0.81	0.82
XIAP	0.80	0.81
PPP1R12A	0.80	0.81
钩3	0.79	0.82
C9orf102	0.79	0.80
Pikfyve	0.79	0.81
KIAA2018	0.79	0.82
BMPR2	0.78	0.78
SBNO1	0.78	0.80

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
增强	-0.56	-0.69
Rhoc	-0.55	-0.63
higd1b	-0.54	-0.63
S100A16	-0.54	-0.60
AF347015.31	-0.54	-0.61
CST3	-0.54	-0.62
IFI27	-0.52	-0.61
HSD17B14	-0.52	-0.57
MT-CO2	-0.52	-0.59
DCXR	-0.52	-0.58

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
AATF	Che-1 \|che1 \|ded	凋亡拮抗转录因子	Affinity Capture-Western	BioGRID	12450794
BIRC5	API4 \|EPR-1	细菌病毒IAP重复含量5	RBL2（P130）与BIRC5（Survivin）启动子相互作用。	BIND	15271987
BRCA1	BRCAI \| BRCC1 \| IRIS \| PSCP \| RNF53	乳腺癌1，早发	Co-localization Reconstituted Complex	BioGRID	11521194
BRD2	D6S113E \|DKFZP686N0336 \|FLJ31942 \|FSH \|FSRG1 \|KIAA9001 \|nat \|ring3 \|RNF3	包含2的溴结构域	p130 interacts with BRD2 promoter.	BIND	15949438
BRD8	SMAP \| SMAP2 \| p120	含有8的溴结构域	P130与BRD8启动子相互作用。	BIND	15949438
BRF2	BRFU \| FLJ11052 \| TFIIIB50	BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like	-	HPRD，Biogrid	10330166
CCNA1	-	细胞周期蛋白A1	Reconstituted Complex	BioGRID	10022926
CCNA2	CCN1 \|CCNA	细胞周期蛋白A2	-	HPRD，Biogrid	8253383
CCNA2	CCN1 \|CCNA	细胞周期蛋白A2	P130与细胞周期蛋白A启动子区域相互作用。	BIND	10766737
CCNE1	CCNE	细胞周期蛋白E1	-	HPRD，Biogrid	8253383
CDC6	cdc18l \|HSCDC18 \|HSCDC6	cell division cycle 6 homolog (S. cerevisiae)	RBL2（P130）与CDC6启动子相互作用。	BIND	15861133
CDC6	cdc18l \|HSCDC18 \|HSCDC6	cell division cycle 6 homolog (S. cerevisiae)	p130 interacts with the Cdc6 promoter region.	BIND	10766737
CDK2	p33（CDK2）	细胞周期蛋白依赖性激酶2	-	HPRD，Biogrid	9188854
CREG1	CREG	E1A刺激基因的细胞阻遏物1	-	HPRD	9710587
E2F1	E2F-1 \| RBAP1 \| RBBP3 \| RBP3	E2F转录因子1	E2F-1 interacts with p130.	BIND	7892279
E2F1	E2F-1 \| RBAP1 \| RBBP3 \| RBP3	E2F转录因子1	p130 interacts with the E2F1 promoter region.	BIND	10766737
E2F2	E2F-2	E2F转录因子2	RBL2(p130) interacts with the E2F2 promoter.	BIND	15861133
E2F4	E2F-4	E2F transcription factor 4, p107/p130-binding	-	HPRD，Biogrid	11573202
E2F4	E2F-4	E2F transcription factor 4, p107/p130-binding	E2F-4interacts with p130.	BIND	7892279
E2F5	E2F-5	p130-binding E2F转录因子5日	-	HPRD	11756542
E2F5	E2F-5	p130-binding E2F转录因子5日	E2F-5interacts with p130.	BIND	7892279
E2F5	E2F-5	p130-binding E2F转录因子5日	Co-purification	BioGRID	7760804
HBP1	FLJ16340	HMG-box转录因子1	-	HPRD，Biogrid	9178770
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	组蛋白脱乙酰基酶1	-	HPRD，Biogrid	10969803
lin9	巴拉\|barpsv \|lin-9 \|TGS \|TGS1	LIN-9同源物（秀丽隐杆线虫）	HMIP130/TWIT与P130相互作用。	BIND	15479636
MCM7	CDABP0042 \|cdc47 \|MCM2 \|P1.1-MCM3 \|P1CDC47 \|p85mcm \|PNAS-146	微型鲜体维护复杂组件7	-	HPRD，Biogrid	9566894
MCM7	CDABP0042 \|cdc47 \|MCM2 \|P1.1-MCM3 \|P1CDC47 \|p85mcm \|PNAS-146	微型鲜体维护复杂组件7	MCM7与P130相互作用。	BIND	9566894
MDM2	HDMX \|MGC71221 \|HDM2	MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠）	p130 interacts with Mdm2.	BIND	15577944
MT1G	MGC12386 \| MT1 \| MT1K	metallothionein 1G	RBL2（P130）与MT1G启动子相互作用。	BIND	15735762
mybl2	B-myb \|bmyb \|MGC15600	v-myb myeloblastosis viral oncogene homolog (avian)-like 2	P130与B-MYB启动子区域相互作用。	BIND	10766737
PHB	PHB1	prohibitin	-	HPRD，Biogrid	10376528
RAF1	CRAF \| NS5 \| Raf-1 \| c-Raf	V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1	RAF-1与P130相互作用。	BIND	9819434
RAF1	CRAF \| NS5 \| Raf-1 \| c-Raf	V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1	-	HPRD，Biogrid	9819434
RB1	OSRC \| RB \| p105-Rb \| pRb \| pp110	retinoblastoma 1	Affinity Capture-Western	BioGRID	10490602
RBBP8	CTIP \| RIM	视网膜细胞瘤结合蛋白8	-	HPRD，Biogrid	9721205
RBBP8	CTIP \| RIM	视网膜细胞瘤结合蛋白8	-	HPRD	9721205\|10449734
RBBP9	BOG \| MGC9236 \| RBBP10	视网膜细胞瘤结合蛋白9	-	HPRD，Biogrid	9697699
RBL1	CP107 \|MGC40006 \|prb1 \|P107	retinoblastoma-like 1 (p107)	P130与P107启动子区域相互作用。	BIND	10766737
SIN3B	KIAA0700	SIN3 homolog B, transcription regulator (yeast)	-	HPRD	11959842
SNW1	BX42 \|MGC119379 \|NCOA-62 \|PRPF45 \|prp45 \|滑雪\|跳过	SNW domain containing 1	-	HPRD，Biogrid	12466551
SUV39H1	KMT1A \|MG44 \|SUV39H	Variegation 3-9同源1（果蝇）的抑制剂	Affinity Capture-Western	BioGRID	12588981
TAF1	Ba2r \|CCG1 \|CCGS \|dyt3 \|kat4 \|N-TAF1 \|NSCL2 \|\|P250 \|taf2a \| TAFII250	TAF1RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 250kDa	-	HPRD，Biogrid	9242374
UBTF	Nor-90 \|UBF	上游结合转录因子RNA聚合酶I	-	HPRD	11042686
UXT	ART-27	普遍表达的转录本	p130 interacts with the UXT chromatin.	BIND	11799066

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG CELL CYCLE	128	84	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路	86	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ETS途径	18	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PTEN途径	17	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID E2F PATHWAY	74	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXO PATHWAY	49	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G0和早期G1	25	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE	421	253	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂	325	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 PHASE	38	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES	137	79	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN	634	384	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATANABE RECTAL CANCER RADIOTHERAPY RESPONSIVE UP	108	67	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN	391	222	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER BASAL VS MESENCHYMAL UP	121	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN	805	505	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP	1142	669	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应	612	367	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROYLANCE BREAST CANCER 16Q COPY NUMBER UP	63	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN	712	443	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN	637	377	该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老	77	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇DN的反应	82	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgLL与IgLK DN	24	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP	555	346	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 AND CD2 UP	89	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞	225	163	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUNO HEMATOPOIESIS	66	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应	35	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星	50	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP	262	186	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG BOUND BY FOXP3	491	310	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED	1022	619	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激	1229	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN	92	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chung水泡细胞毒性DN	44	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向	395	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN	181	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO FOXP3 TARGETS DN	42	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标	77	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1 TARGETS VIA AKT1 DN	82	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE	1137	655	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向	61	41	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION UP	271	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUO TARGETS OF IRS1 AND IRS2	98	67	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：RBL2