基因页:TRPV4
概括?
基因 | 59341 |
象征 | TRPV4 |
同义词 | BCYM3 | CMT2C | HMSN2C | OTRPC4 | SMAL | SPSMA | SSQTL1 | TRP12 | VRL2 | VROAC |
描述 | 瞬态受体电势阳离子通道亚家族V成员4 |
参考 | MIM:605427|HGNC:HGNC:18083|Ensembl:ENSG00000111199|HPRD:05667|Vega:Otthumg00000169277 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.1 |
Pascal P值 | 0.002 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0126 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRPV4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005516 | 钙调蛋白结合 | 小鬼 | 12724311 | |
去:0005262 | 钙通道活性 | 艾达 | 18458941 | |
GO:0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 16293632 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007204 | 胞质钙离子浓度的升高 | 艾达 | 18458941 | |
去:0007231 | 渗透感信号通路 | 塔斯 | 12724311 | |
去:0009612 | 对机械刺激的反应 | 塔斯 | 15753126 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | 艾达 | 18458941 | |
去:0006816 | 钙离子传输 | nas | 11025659 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0006884 | 细胞体积稳态 | 塔斯 | 12724311 | |
去:0006874 | 细胞钙离子稳态 | 艾达 | 12724311 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 11025659 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 15753126 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
屏障癌复发肿瘤样品DN | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
恩格曼癌祖细胞dn | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-378 | 291 | 297 | 1a | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-491 | 166 | 172 | M8 | HSA-MIR-491脑 | aguggggaacccuuccaugga |