概括
基因 59341
象征 TRPV4
同义词 BCYM3 | CMT2C | HMSN2C | OTRPC4 | SMAL | SPSMA | SSQTL1 | TRP12 | VRL2 | VROAC
描述 瞬态受体电势阳离子通道亚家族V成员4
参考 MIM:605427|HGNC:HGNC:18083|Ensembl:ENSG00000111199|HPRD:05667|Vega:Otthumg00000169277
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.1
Pascal P值 0.002

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0126

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005516 钙调蛋白结合 小鬼 12724311
去:0005262 钙通道活性 艾达 18458941
GO:0042802 相同的蛋白质结合 IPI 16293632
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007204 胞质钙离子浓度的升高 艾达 18458941
去:0007231 渗透感信号通路 塔斯 12724311
去:0009612 对机械刺激的反应 塔斯 15753126
去:0006816 钙离子传输 艾达 18458941
去:0006816 钙离子传输 nas 11025659
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0006884 细胞体积稳态 塔斯 12724311
去:0006874 细胞钙离子稳态 艾达 12724311
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 nas 11025659
去:0005886 质膜 艾达 15753126

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
屏障癌复发肿瘤样品DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lein脉络丛标记 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-378 291 297 1a HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-491 166 172 M8 HSA-MIR-491 aguggggaacccuuccaugga