基因页面:KLHL12
总结吗?
GeneID | 59349年 |
象征 | KLHL12 |
同义词 | C3IP1 | DKIR |
描述 | kelch像家庭成员12 |
参考 | MIM: 614522|HGNC: HGNC: 19360|运用:ENSG00000117153|HPRD: 13925|织女:OTTHUMG00000041385 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 q32.1 |
夏洛克假定值 | 0.341 |
胎儿β | -0.684 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.01 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg04462209 | 1 | 202896493 | KLHL12 | 2.18 e-8 | -0.011 | 7.35 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLHL12_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16189514|16713569 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006511 | ubiquitin-dependent蛋白质分解代谢的过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016055 | Wnt受体信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
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ARAF | A-RAF | ARAF1 | PKS2 | RAFA1 | v-raf小鼠肉瘤3611病毒致癌基因相同器官 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
BAT3 | BAG-6 | BAG6 | D6S52E | G3 | HLA-B相关记录3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
COL8A1 | C3orf7 | MGC9568 | 胶原蛋白、类型八世、α1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
CPSF6 | CFIM | CFIM68 | HPBRII-4 | HPBRII-7 | 乳沟和聚腺苷酸化特定因素68 kda | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
DVL3 | KIAA0208 | 散乱的,dsh同族体3(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KLHL12 | C3IP1 | DKIR | FLJ27152 | kelch-like 12(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
KLHL2 | ABP-KELCH | |真正MAYVEN | kelch-like 2, Mayven(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
LNX1 | LNX | MPDZ | PDZRN2 | numb-protein X 1的配体 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
MED28 | 1500003 d12rik | DKFZp434N185 | | EG1 magicin | 中介复杂28亚基 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
NDC80 | HEC | HEC1 | KNTC2 | TID3 | hsNDC80 | NDC80同族体,着丝粒复杂组件(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
PRR13 | DKFZp564J157 | FLJ23818 | TXR1 | 脯氨酸丰富的13 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
SNX20 | MGC35578 | SLIC-1 | SLIC1 | 排序nexin 20 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
VTA1 | C6orf55 | DRG-1 | DRG1 | FLJ27228 | HSPC228 | LIP5 | My012 | SBP1 | Vps20-associated 1同族体(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
PID WNT规范途径 | 20. | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋化性了 | 74年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 495 | 1181年 | 1187年 | 1 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |