基因页：RBP1
概括？
| 基因 | 5947 |
| 象征 | RBP1 |
| 同义词 | crabp-i | crbp | crbp1 | crbpi | rbpc |
| 描述 | 视黄醇结合蛋白1 |
| 参考 | MIM：180260|HGNC：HGNC：9919|Ensembl：ENSG00000114115|HPRD：07036|Vega：Otthumg00000155751 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q23 |
| Pascal P值 | 0.103 |
| Sherlock P值 | 0.65 |
| 胎儿β | 1.558 |
| 主持人 | 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11562357 | Chr9 | 94205374 | RBP1 | 5947 | 0.18 | 反式 | ||
| RS80175427 | 3 | 139217746 | RBP1 | ENSG00000114115.5 | 3.29974E-6 | 0.05 | 40925 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SCN1A | 0.85 | 0.74 |
| KCNC1 | 0.84 | 0.76 |
| AGPAT9 | 0.84 | 0.55 |
| Hapln4 | 0.82 | 0.76 |
| VAMP1 | 0.81 | 0.64 |
| sts | 0.81 | 0.83 |
| C3orf57 | 0.80 | 0.77 |
| nefh | 0.80 | 0.75 |
| RIMS3 | 0.78 | 0.78 |
| RCAN2 | 0.78 | 0.75 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPS20 | -0.32 | -0.42 |
| RPL31 | -0.31 | -0.36 |
| GTF3C6 | -0.31 | -0.30 |
| Rab13 | -0.31 | -0.47 |
| RPL35 | -0.31 | -0.40 |
| C9orf46 | -0.30 | -0.33 |
| NME4 | -0.29 | -0.37 |
| WDR86 | -0.29 | -0.20 |
| RPL27 | -0.29 | -0.29 |
| RPL36 | -0.28 | -0.34 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| GO：0019841 | 视黄醇结合 | IEA | - | |
| 去：0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
| GO：0016918 | 视网膜结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006810 | 运输 | IEA | - | |
| GO：0042572 | 视黄醇代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| pid视黄酸途径 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee神经Crest干细胞向上 | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno岩石信号不是通过Rhoa Up | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1慢性LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUELLET卵巢癌侵入性与LMP DN | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borlak肝癌EGF UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Khetchoumian Trim24靶向 | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 成人癌中甲基化的欧姆 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 欧姆胚胎癌DN | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝克莫昔芬抵抗DN | 52 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLI1融合的Rorie目标 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| nguyen Notch1靶向 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴vs血液 | 131 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C6的反应 | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21靶向 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成生7 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 敏锐的回应罗格列酮DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 安倍的内耳 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦克道尔急性肺损伤DN | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Jnk Singaling DN | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 结肠癌DN中甲基化的甲基化 | 28 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lein脉络丛标记 | 103 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jepsen SMRT目标 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的甲基化 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer肿瘤发生 | 63 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇12的时间反应12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Noushmehr GBM被甲基化沉默 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Steger脂肪形成DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| plasari nfic目标基础DN | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 1小时信号传导 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |