基因页：CPLX3
概括？
| 基因 | 594855 |
| 象征 | CPLX3 |
| 同义词 | cpx-iii | cpxiii | nbla11589 |
| 描述 | 复合素3 |
| 参考 | MIM：609585|HGNC：HGNC：27652|ENSEMBL：ENSG00000213578|Vega：Otthumg00000142816 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q24.1 |
| Pascal P值 | 0.015 |
| 胎儿β | -0.935 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| DNM：McCarthy_2014 | 整个外显子组测序分析 | 57个三重奏的整个外显子组测序，具有零星或家族性精神分裂症。 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：4 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CPLX3 | CHR15 | 75122680 | G | 一种 | NM_001030005 | P.K154K | 同义SNV | 精神分裂症 | DNM：McCarthy_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12791555 | 15 | 75118714 | CPLX3 | 2.536E-4 | -0.503 | 0.037 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0019905 | 语法结合 | IEA | 突触（GO期限：5） | - |
| 去：0005326 | 神经递质转运蛋白活性 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：3） | - |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0046928 | 神经递质分泌的调节 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：9） | - |
| GO：0016079 | 突触囊泡胞吐作用 | IEA | 神经元，突触，神经递质（GO期限：9） | - |
| 去：0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元，神经递质（GO期限：5） | - |
| 去：0030073 | 胰岛素分泌 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0005829 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen IPS ICP带有H3K27Me3 | 54 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K27me3 | 42 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-148/152 | 738 | 744 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
| HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
| HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
| mir-342 | 706 | 713 | 1A，M8 | HSA-MIR-342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
| mir-377 | 705 | 711 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |