基因页：reg1a
概括？
| 基因 | 5967 |
| 象征 | reg1a |
| 同义词 | ICRF | P19 | PSP | PSPS | PSPS1 | PTP | REG |
| 描述 | 再生家庭成员1 alpha |
| 参考 | MIM：167770|HGNC：HGNC：9951|ENSEMBL：ENSG00000115386|HPRD：01338|Vega：Otthumg00000130016 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P12 |
| Pascal P值 | 0.035 |
| 胎儿β | 0.159 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1578978 | CHR8 | 118196802 | reg1a | 5967 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GCNT4 | 0.92 | 0.86 |
| chn1 | 0.92 | 0.94 |
| htr2a | 0.91 | 0.75 |
| HLF | 0.91 | 0.88 |
| OXR1 | 0.91 | 0.75 |
| TMEM155 | 0.91 | 0.82 |
| Mkx | 0.90 | 0.71 |
| diras2 | 0.90 | 0.68 |
| Ell2 | 0.89 | 0.67 |
| NDFIP2 | 0.89 | 0.68 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FADS2 | -0.59 | -0.66 |
| SEMA4B | -0.55 | -0.68 |
| Bcl7c | -0.55 | -0.72 |
| GPR125 | -0.53 | -0.55 |
| SH3BP2 | -0.51 | -0.77 |
| traf4 | -0.51 | -0.77 |
| pde9a | -0.51 | -0.75 |
| FAM59B | -0.51 | -0.52 |
| CNTFR | -0.50 | -0.63 |
| cdc42ep4 | -0.50 | -0.52 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| St Interferon Gamma途径 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 圣雅克统计途径 | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST Stat3途径 | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST型I干扰素路径 | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王·巴雷特（Wang Barretts）食道 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| cavard肝癌恶性与良性 | 32 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee肝癌电纤维酸DN | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤预后 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Myc DN | 63 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee肝癌E2F1 DN | 64 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG MUC2靶标十二指肠6MO DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM有关联 | 171 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |