基因页:Ren
概括?
基因 | 5972 |
象征 | Ren |
同义词 | HNFJ2 |
描述 | 肾素 |
参考 | MIM:179820|HGNC:HGNC:9958|ENSEMBL:ENSG00000143839|HPRD:01564|Vega:Otthumg0000000036059 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q32 |
胎儿β | 0.146 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/REN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PTPN3 | 0.95 | 0.37 |
grid2ip | 0.95 | 0.27 |
FAM19A4 | 0.94 | 0.34 |
SUSD2 | 0.94 | 0.25 |
chrna3 | 0.94 | 0.45 |
TTC39A | 0.92 | 0.50 |
FAM180B | 0.92 | 0.14 |
NPL | 0.91 | 0.45 |
GNG13 | 0.91 | 0.37 |
帕帕 | 0.90 | 0.46 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
meis3p2 | -0.23 | 0.16 |
WDR86 | -0.22 | -0.21 |
CACNB3 | -0.21 | 0.13 |
SSBP4 | -0.21 | 0.12 |
BAIAP2 | -0.20 | 0.09 |
AP002414.1 | -0.20 | 0.08 |
克恩 | -0.20 | 0.12 |
ppm1m | -0.20 | 0.09 |
plekho1 | -0.20 | -0.01 |
SLC26A4 | -0.20 | -0.25 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | IPI | 神经递质(GO期限:4) | 12045255 |
去:0004190 | 天冬氨酸型内肽酶活性 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | 艾达 | 12045255 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0002003 | 血管紧张素成熟 | 艾达 | 12045255 | |
去:0001822 | 肾脏发展 | 小鬼 | 16116425 | |
去:0006508 | 蛋白水解 | 艾达 | 12045255 | |
去:0008217 | 血压调节 | 塔斯 | 7584914 | |
GO:0043408 | MAPKKK级联的调节 | 艾达 | 12045255 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 艾达 | 12045255 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0043231 | 细胞内膜结合的细胞器 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肾素血管紧张素系统 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ACE2途径 | 13 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 | 38 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA胶质母细胞瘤副本编号 | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dorsey GAB2目标 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |