概括
基因 5983
象征 RFC3
同义词 RFC38
描述 复制因子C亚基3
参考 MIM:600405|HGNC:HGNC:9971|ENSEMBL:ENSG00000133119|HPRD:02676|Vega:Otthumg0000000016715
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q13.2
Pascal P值 0.434
胎儿β 1.095
DMG 1(#研究)
主持人 海马

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02294249 13 34392492 RFC3 5.96E-8 -0.007 1.51E-5 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CPSF3L 0.91 0.92
ZNF513 0.88 0.90
TRMT1 0.88 0.88
ppan 0.88 0.88
WDR46 0.87 0.89
CXXC1 0.87 0.89
PRMT7 0.87 0.85
ANAPC2 0.87 0.86
E4F1 0.86 0.89
SIRT7 0.86 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.75 -0.78
AF347015.27 -0.75 -0.80
MT-CO2 -0.71 -0.75
mt-cyb -0.71 -0.76
AF347015.8 -0.71 -0.77
AF347015.33 -0.70 -0.74
AF347015.15 -0.69 -0.76
AF347015.21 -0.68 -0.77
AF347015.2 -0.67 -0.73
MT-ATP8 -0.64 -0.80

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG DNA复制 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG核苷酸切除修复 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG不匹配维修 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Fanconi Pathway 47 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATR途径 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期检查点 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录耦合ner tc ner 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome POL切换 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸切除修复 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA POL在TC NER中填充间隙填充的Reactome修复合成 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护 122 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome全球基因组NER GG NER 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome滞后链合成 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA复制 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATR的反应组激活复制应力 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome端粒维护 75 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
端粒的Reactome扩展 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G2 M检查点 45 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA链伸长 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hummel Burkitts淋巴瘤 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分割与正常静止 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham正常静止与正常分裂DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李·威尔姆斯肿瘤的肿瘤变性 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT网络 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana BRCA中心网络 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 110 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stanelle E2F1目标 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F绑定的REN 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3的大风apl突变 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
durchdewald皮肤致癌 88 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特福德小儿癌标记 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist IL6剥夺DN 98 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS信号传导DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ishida E2F目标 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YU BAP1目标 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因