基因页:RFC3
概括?
基因 | 5983 |
象征 | RFC3 |
同义词 | RFC38 |
描述 | 复制因子C亚基3 |
参考 | MIM:600405|HGNC:HGNC:9971|ENSEMBL:ENSG00000133119|HPRD:02676|Vega:Otthumg0000000016715 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q13.2 |
Pascal P值 | 0.434 |
胎儿β | 1.095 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 海马 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02294249 | 13 | 34392492 | RFC3 | 5.96E-8 | -0.007 | 1.51E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RFC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CPSF3L | 0.91 | 0.92 |
ZNF513 | 0.88 | 0.90 |
TRMT1 | 0.88 | 0.88 |
ppan | 0.88 | 0.88 |
WDR46 | 0.87 | 0.89 |
CXXC1 | 0.87 | 0.89 |
PRMT7 | 0.87 | 0.85 |
ANAPC2 | 0.87 | 0.86 |
E4F1 | 0.86 | 0.89 |
SIRT7 | 0.86 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.75 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.80 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.75 |
mt-cyb | -0.71 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.71 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.70 | -0.74 |
AF347015.15 | -0.69 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.2 | -0.67 | -0.73 |
MT-ATP8 | -0.64 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG DNA复制 | 36 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG核苷酸切除修复 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG不匹配维修 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Fanconi Pathway | 47 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ATR途径 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期检查点 | 124 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录耦合ner tc ner | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome POL切换 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸切除修复 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA POL在TC NER中填充间隙填充的Reactome修复合成 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DNA的反应组合成 | 92 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome全球基因组NER GG NER | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome滞后链合成 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATR的反应组激活复制应力 | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome端粒维护 | 75 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
端粒的Reactome扩展 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G2 M检查点 | 45 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome s阶段 | 109 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA链伸长 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hummel Burkitts淋巴瘤 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham CML分割与正常静止 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graham正常静止与正常分裂DN | 87 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李·威尔姆斯肿瘤的肿瘤变性 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA XPRSS INT网络 | 168 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA中心网络 | 117 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stanelle E2F1目标 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F绑定的REN | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasaki成人T细胞白血病 | 176 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3的大风apl突变 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
durchdewald皮肤致癌 | 88 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变 | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
怀特福德小儿癌标记 | 116 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist IL6剥夺DN | 98 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRAS信号传导DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ishida E2F目标 | 53 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 | 56 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信令24小时DN | 251 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YU BAP1目标 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |